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[转载]Forests||表型+理化+转录分析皂荚苷生物合成的关键途径和基因

已有 130 次阅读 2025-4-14 16:03 |系统分类:科研笔记|文章来源:转载

本研究通过表型观察和RNA-seq技术,揭示了皂荚(Gleditsia sinensis Lam.)豆荚发育过程中皂苷(gleditsioside)生物合成的关键途径和调控基因。皂苷含量从6月至11月逐渐增加,差异表达基因(DEGs)分析显示萜类骨架和三萜生物合成途径中分别有703和162个DEGs。鉴定出99个编码关键酶(如HMGCR、CYP93E1、UGT)的基因,并通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)和瞬时过表达实验验证了CL5845.Contig1(HMGCR)、CL8823.Contig2(LUP4)和CL11248.Contig4(CYP93E1)对皂苷合成的促进作用。

1题目

文章题目:Phenotypic and RNA-seq Profiles Identified Key Pathways and Genes Involved in Gleditsioside Biosynthesis in Gleditsia sinensis Lam.

发文单位:北京林业大学;河南省林业科学研究院;焦作市云台山国家级自然保护区管理局

2杂志

Forests;IF=2.4分

3链接

Wang, J.; Yang, Y.; Liu, Y.;Liu, J.; Xiao, D.; Chen, H.; Wang, C.;Fu, T.; Chang, F.; Wang, Y.; et al.Phenotypic and RNA-seq Profiles Identified Key Pathways and Genes Involved in Gleditsioside Biosynthesis in Gleditsia sinensis Lam. Forests 2025,16, 393.

doi.org/10.3390/f160303

4检测指标

Norminkoda提供了总皂苷检测。

5主要内容

5.1 豆荚发育与皂苷积累:

豆荚长度在6-8月显著增长(GS1-GS3),随后趋于稳定;皂苷含量从9.3 μg/g(GS1)升至10.9 μg/g(GS6),与长度呈正相关。

5.2 关键通路与基因:

5.2.1 萜类合成途径:

MVA途径:HMGCR、DXPS等基因上调,催化IPP/DMAPP合成。

MEP/DOXP途径:IDI、ISPG等基因参与,提供萜类前体。

三萜环化(TCP):LUP4(β-amyrin环化酶)、CYP93E1(羟化酶)调控皂生成。

5.2.2 糖基化修饰:UGT基因(如Unigene37260)负责皂苷糖链延伸。

5.3 调控网络:

5.3.1 WGCNA鉴定出MEgrey模块(含HMGCR、LUP4等hub基因),与皂苷含量显著相关(r=0.76)。

5.3.2 转录因子(如AGBH、ERF)可能参与发育阶段的基因表达调控。

6总结

6.1关键发现:

皂苷合成关键酶(HMGCR、LUP4、CYP93E1)的表达动态与皂苷积累高度一致。

WGCNA揭示MEgrey模块为皂苷合成的核心调控网络。

瞬时过表达实验验证HMGCR、LUP4、CYP93E1正向调控皂苷生物合成。

6.2意义:

为皂苷生物合成机制研究提供了基因资源,为通过遗传改良提高皂荚药用价值奠定基础。

本研究通过表型观察和RNA-seq技术,揭示了皂荚(Gleditsia sinensis Lam.)豆荚发育过程中皂苷(gleditsioside)生物合成的关键途径和调控基因。皂苷含量从6月至11月逐渐增加,差异表达基因(DEGs)分析显示萜类骨架和三萜生物合成途径中分别有703和162个DEGs。鉴定出99个编码关键酶(如HMGCR、CYP93E1、UGT)的基因,并通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)和瞬时过表达实验验证了CL5845.Contig1(HMGCR)、CL8823.Contig2(LUP4)和CL11248.Contig4(CYP93E1)对皂苷合成的促进作用。



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