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  • 深圳湾实验室,研究员

    • 生命科学->遗传学与生物信息学->生物信息学

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抛弃“影响”因子,计算颠覆因子! 2022-07-03
导读 :全世界科技界受“影响”因子的毒害久矣:追热门、跟风向、造新闻、编故事。已经有科学家开发、验证的颠覆因子,却不被以盈利为目标的公司使用!呼吁 ...
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怎样推动“从0到1”的原始创新?从基于AI神经网络的蛋白质从头设计说起 2022-06-21
导读 :现在全国上下都在提倡推动“从0到1”的原始创新,提升基础研究的水平,但是到底什么是“从0到1”,什么是“从1到N”?见仁见智,并没有什么很 ...
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我永远的神 2022-03-07
我太太是山东人。我认识的山东人,除了爱喝酒,就是喜欢吃面食了,特别是饺子,可以说是面食之王了。我太太也从小就特别喜欢吃饺子,常常因吃撑了而胃疼。后来 ...
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切蛋白质分子,用牛刀能切出什么? 2022-02-08
导读: 俗话说杀鸡不用牛刀。假如用了牛刀,无论从哪里下刀,即一刀两断,这两块也无法自我组合满血复活,除非在恐怖片里;但是如果有医生在场紧急缝合,也 ...
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回国半年的感悟 2021-09-21
年年中秋,今又中秋,今年月儿分外圆。今年中秋是我出国36年后第一个在国内度过的中秋节日。全职回国工作半年 , 得到了众多旧雨新知的关怀,感谢朋友们的帮助 ...
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中澳两国人才迁居的比较:目前人才政策还缺什么? 2021-09-07
八年前,我被澳大利亚格里菲斯大学作为正教授引进,从美国移居到澳大利亚。今年三月我作为资深研究员全职加入深圳湾实验室,回到国内。在这里,我试着比较一下 ...
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拜托,AI还没有在RNA结构预测上获得重大进展! 2021-08-28
昨天,几个科普公众号轰炸了朋友圈,下面是几个例子: “Science封面重磅:新型AI算法准确预测RNA三维结构 ” — 学术头条; “继AlphaFold之后又一结构 ...
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七夕到,鹊桥今何在? 2021-08-15
昨天是七夕,中国的情人节,却没有感觉到情人节的味道。在国外,情人节会有铺天盖地的广告,商店一般提前几个星期就张灯结彩,就怕这个节日被人遗忘了。我昨天 ...
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AlphaFold2是怎样实现蛋白质结构预测的1+2等于3的? 2021-07-17
导读:2009年,我在马剑鹏 教授 所组织的 Telluride Workshop 作了关于《什么样的1和2会得到3:蛋白质的三维结构?》( What are the ‘1’ and the ...
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上哈佛、麻省理工的两个女儿是如何成长的? 2021-07-14
导读:今年三月份,在澳大利亚昆士兰州高中毕业的小女儿得到了麻省理工学院的录取通知,这是对她多年努力的一个肯定。小女儿在高中阶段的压力不小,因为大女儿 ...
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cjj1234 2021-9-10 22:58
周老师您好,我是华侨大学的一名学生,我最近再看您的这篇文章 RNA secondary structure prediction using an ensemble of two-dimensional deep neural networks and transfer learning ,尝试运行了 SPOT-RNA,生成的RNA结构预测图,有些碱基对的连线是绿色的,我不太清除这个绿色的连线是怎么来的,怎么通过用VARNA的命令行画出来的呢 ,特意来请教您。 我在utils.py 这个文件中看到了 用VARNA生成结构图的代码 subprocess.Popen( , stderr=subprocess.STDOUT, stdout=subprocess.PIPE).communicate() 里面这那个tertiary_b ... ...
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