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SPOT-RNA-1D: RNA主链二面角的预测
2021-5-29 20:27
导读: 许多疾病(包括癌症)跟非编码 RNA 相关,但是我们对它们的了解甚少,因为用于理解它们功能机制的结构很难被 X射线晶体衍射、核磁共振和冷冻电镜等物理方法所解析。没有机制的理解,就没有彻底解决疾病的手段,所以通过计算来预测RNA结构,大幅度提高其精度势在必行。长期以来,RNA结构的预测集中在二级结构 ...
个人分类: 科技推广|1644 次阅读|没有评论
BRiQ-RNA: 一个对RNA近天然态结构的高精度优化修正的方法
2021-5-19 09:43
导读 :蛋白质和RNA结构的实验解析远远满足不了需求,计算预测成为必须。蛋白质结构预测难,RNA结构预测更难,而对预测的结构模型进行的高精度修正更是难上加难。以熊鹏博士为第一作者,詹剑博士和 我 为通讯作者,与中山大学的巫瑞波教授合作一起发展的BRiQ-RNA方法可以对接近天然态结构的初始RNA结构模型有效 ...
个人分类: 科技推广|1787 次阅读|没有评论
实验室的厕所:可以不蹲吗?
热度 11 2021-4-24 11:26
导读:国内上厕所有时会觉得罄竹难书。俗话说,悲粪之下出诗人,我呢,方便之余写 写 博客吧! 如果有人来参观实验室,一般是领着去看看高大上的仪器设备,绝对不会特意安排去参观厕所的,但在现实生活中,虽 然不安排也是会自发去的,谁能抵挡得住生理上的需要呢? 往年,我回国访问,上厕所是我的 ...
个人分类: 心得体会|4691 次阅读|16 个评论 热度 11
哈罗,深圳!
热度 1 2021-4-10 22:07
共享单车作为一个互联网的新生事物,是我一直很想尝试的,想骑就骑,想停就停,不正是实现骑车自由的终极梦想?住在澳大利亚的黄金海岸市时,曾经在旅游区发现过几辆摩拜单车,有点跃跃欲试,但每次以汽车代步,没有找到机会。近年来新闻里看到的是共享单车公司倒闭的倒闭、兼并的兼并、收购的收购,连摩拜也变成了美团! ...
个人分类: 家庭教育|2215 次阅读|1 个评论 热度 1
百度的螺旋桨RNA结构预测竞赛,预测的不是RNA结构
2020-12-25 11:23
今天在朋友圈无意发现百度正在组织螺旋桨RNA结构预测竞赛的新闻,而且12月20日就开始注册了,并且把我们最近的一个工作(Nature Communications 10, 5407 (2019))作为学习材料,算是小惊喜。 在 deepmind公司的AlphaFold于 2018年 蛋白质结构预测一炮打响的推动下,国内外多个科技大公司如百度、阿里、腾讯、华为、微软 ...
个人分类: 科技推广|3296 次阅读|没有评论
平地惊雷:AlphaFold2解决了蛋白质结构预测的问题?
热度 3 2020-12-2 21:44
平地一声惊雷,Google的 AlphaFold2在今年第14届蛋白质结构预测的比赛(CASP14)中对大部分的蛋白实现了原子精度或者接近原子精度的结构预测,把学术界的预测远远甩在后面,不仅仅计算生物学家而且实验结构生物学家也被震惊了。 AlphaFold2预测的一个结构 甚至帮助 结构生物学家发现他们的错误,而另外一些结构,预测 ...
个人分类: 科技推广|9995 次阅读|4 个评论 热度 3
从美国总统选举的大数据预测说起
热度 1 2020-11-7 13:20
2016年美国总统选举的时候,多数传统民意测验预测希拉里·克林顿将获胜,但我们澳洲格里菲斯大学的同事根据推特情绪大数据的分析结果却认为特朗普会赢。事实证明他是对的,而且50个州,他预测对了49个,这远远高于随机碰上的可能性。除此之外,他还成功地预测了2016年英国的脱欧公投及2019年澳大利亚联邦选举的结果。今年 ...
个人分类: 政策评论|3364 次阅读|1 个评论 热度 1
走向肤浅的人与步入深度的机器
热度 4 2020-11-5 11:21
长期以来人工智能只能透过两层人工神经元来感知外界。最近几年,计算方法和计算能力的突破使得人工智 能可以 进行几十、几百层的深度学习。自此之后,阿尔法狗打遍围棋天下无敌手(2016), 阿尔法-折叠勇获蛋白质结构比赛第一名 (2018),同时机器翻译不断改进,自动驾驶也愈加成熟,很明显机器替代人来做一些从简 ...
个人分类: 政策评论|6625 次阅读|4 个评论 热度 4
新冠病毒的诊疗呼吁一个全国统一的电子病历大数据
热度 8 2020-10-30 14:12
新冠病毒的诊疗,假如我们有一个全国统一的电子病历大数据,也就是说所有病人的治疗过程即时登记在全国计算云里,那么一个跟踪各个地区各种疾病即时发生率的计算软件就能够自动发现不同寻常的高峰,发出流行预警,从而避免地方可能的拖延、为全国的决策争取到最多的时间,把危害降到最小。 一个全国统一 ...
个人分类: 政策评论|5974 次阅读|8 个评论 热度 8

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GMT+8, 2021-6-16 03:58

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