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Plants南京林业大学生命科学学院——基于人工智能的花粉识别平台

已有 368 次阅读 2025-5-17 09:51 |个人分类:学术软文|系统分类:论文交流

花粉形态学鉴定作为植物分类学、古气候重建及生态监测等领域的重要技术手段,其标准化与自动化进程受制于传统显微法的固有局限,即存在形态特征量化困难、鉴定耗时且极度依赖专家经验等问题。为此,南京林业大学生命科学学院与中国科学院植物研究所团队在Plants期刊发表了题为AIpollen: An Analytic Website for Pollen Identification Through Convolutional Neural Networks的研究论文。该研究利用深度学习技术,训练数据集涵盖了36个不同属的花粉图像数据。经过203个训练周期,模型在测试集上达到97.01%的准确率,并以该模型为核心开发了AIPollen网站 (http://aipollen.top/),为研究人员提供了一个便捷的花粉图像识别平台。

          

研究过程与结果

本研究旨在开发一个基于深度学习的自动化花粉识别系统AIpollen,通过残差网络实现高精度分类。研究团队首先构建了包含36个不同属类、总计12,039张预处理图像的数据集,这些图像主要来源于专业书籍和电子显微镜图像 (SEM/TEM),并经过严格的标准化处理。考虑到花粉在显微镜下通常呈现灰度特征,所有图像均被转换为灰度格式以消除颜色干扰,随后进行锐化、对比度增强和随机旋转等预处理。为增强模型鲁棒性,研究还采用了随机遮挡策略,模拟实际观察中可能存在的花粉结构缺陷,最终通过数据扩增技术使每类样本量达到360~400张,有效缓解了数据不平衡的问题。

在模型架构选择上,研究采用了ResNet34网络并进行了针对性改进。该模型在2015年ImageNet竞赛中以3.5%的错误率脱颖而出,其核心创新在于残差连接和层归一化技术,能有效解决深度网络中的梯度消失问题。值得注意的是,将传统ReLU激活函数替换为ELU (指数线性单元) 后,模型准确率从92%显著提升至97%,这得益于ELU对负值区间的平滑处理能更好地保留梯度信息。训练过程中采用Adam优化器,其结合动量法和RMSProp算法的优势,通过自适应调整参数更新步长实现快速稳定收敛。损失函数选用交叉熵损失,通过softmax转换和负对数似然计算,有效强化模型对错误分类的惩罚机制。

模型评估采用五折交叉验证,平均验证准确率达96.25%,各折表现稳定在95%~98.33%之间,证明模型具有良好的泛化能力。最终测试集准确率为97.01%,训练集达99.89%,F1分数95.9%,ROC曲线下面积99.96%,各项指标均显示模型在保持高精度的同时具备优秀的类别平衡性。特别是真阳性率 (TPR) 和真阴性率 (TNR) 在各属类间表现均衡,如图B所示,表明模型未出现明显的分类偏好。研究团队进一步开发了用户友好的网页平台 (https://www.aipollen.top),用户可直接上传花粉图像获取实时分类结果。

          

研究总结

本研究开发了基于改进ResNet34架构的花粉智能识别系统AIpollen (https://www.aipollen.top),实现了高效精准的花粉分类。研究通过构建包含36个属的12,039张标准化灰度图像的数据集,采用ELU激活函数替代传统ReLU,结合动态学习率调度和综合数据增强技术,使模型在五折交叉验证中达到96.25%的平均准确率,最终测试集表现达97.01%的识别精度,各项评估指标 (F1=95.9%、AUC 99.96%) 证明系统兼具高灵敏度与稳定性。该成果为古生态学研究、过敏原检测、农业监测、油气资源评估等领域提供快速、精准的属级水平的花粉种类鉴定服务。 

          

作者介绍  

南京林业大学生命科学学院本科生俞星辰、硕士研究生许祯琇,中国科学院植物研究所博士研究生赵佳文为本文第一作者。南京林业大学生命科学学院郭仲龙副教授为本文通讯作者。南京林业大学生命科学学院硕士研究生魏君戎、王琦,北京大学生命科学学院沈凤博士,中国科学院植物研究所杨效曾研究员亦为本项目做出重要贡献。本文得到南京林业大学科研启动经费的支持。

                

阅读英文原文:https://www.mdpi.com/3028980

期刊主页:https://www.mdpi.com/journal/plants

               

Plants 期刊介绍

主编:Dilantha Fernando, University of Manitoba, Canada

期刊内容主要涉植物科学领域的研究,目前已被SCIE、Scopus等数据库收录。

2023 Impact Factor:4.0

2023 CiteScore:6.5

Time to First Decision:18.9 Days

Acceptance to Publication:2.4 Days

尾图1.jpg



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