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[转载]【客户文章】机器学习+单细胞测序揭示圆锥角膜治疗新靶点
陈明杰 2025-6-25 10:30
英文标题: Deciphering mitochondrial dysfunction in keratoconus: Insights into ACSL4 from machine learning-based bulk and single-cell transcriptome analyses and experimental validation 中文标题: 解析圆锥角膜中线粒体功能障碍:基于机器学习的批量和单细胞转录组分析及实验验证对 ACSL4 的新 ...
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[转载]【项目文章】多组学短快平发文——测序技术助力发现角膜瘢痕重要因子
陈明杰 2025-6-19 14:05
英文标题: Integrated transcriptome and proteome analysis identifies keratins as key regulators of corneal scarring in a murine model 中文标题: 整合转录组和蛋白质组分析鉴定角蛋白为小鼠模型角膜瘢痕形成的关键调节因子 发表期刊: Computational and Structural Biotechnology Journal ...
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[转载]项目文章:从ac4C修饰到胃癌致病机制,NAT10的潜力与突破
陈明杰 2025-6-12 15:01
胃癌一直是全球范围内致死率极高的恶性肿瘤之一,尽管近年来治疗手段不断进步,但对于中晚期胃癌患者来说,整体预后仍不理想。在上篇推文中,我们聊到 ac4C 修饰在绝经后骨质疏松( PMOP )中的研究进展。今天,我们一起来看一看 ac4C 在癌症领域,尤其是胃癌中的研究是怎样展开的。 近日,福建医 ...
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[转载]【客户高分文章:IF40.8】外泌体传递促焦亡miRNA--驱动心脏损伤的肇事因子
陈明杰 2025-6-10 11:40
【客户高分文章: IF40.8 】外泌体传递促焦亡 miRNA-- 驱动心脏损伤的肇事因子 英文标题: Exosomal transfer of pro-pyroptotic miR-216a-5p exacerbates anthracycline cardiotoxicity through breast cancer-heart pathological crosstalk 中文标题: 外泌体转移的促细胞焦亡 miR-216a-5 ...
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代谢组数据上传攻略:手把手教你从零搞定Metabolomics Workbench!
陈明杰 2025-6-9 13:02
导读: 还在为代谢组数据存储和共享发愁?本文为你带来最全上传指南 —— 从注册账号、填写元数据,到数据上传、审核反馈,一步步教你获得专属 DOI 号,让数据可追溯、可引用! 一、代谢组简介 代谢组( Metabolome )是指生物体内所有小分子代谢物的集合,包括中间代谢产物(如氨基酸、有机酸)、激素 ...
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在线绘制Nature Biomedical Engineering同款基因排序图
陈明杰 2025-5-27 13:46
导读: 基因排序点图是基因表达分析的可视化利器。它按基因倍数变化从大到小排序,清晰呈现表达差异显著的基因。结合颜色编码 p 值,可直观判断基因表达变化的统计学意义,助力高效筛选关键基因。 & ...
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在线临床指标分类信息表转甜甜圈矩阵图
陈明杰 2025-4-24 15:54
导读: 在临床研究中,临床指标分类信息表记录了患者的年龄、性别、肿瘤分期等关键信息。为了高效分析这些信息,可采用甜甜圈矩阵可视化方法。甜甜圈图中每个扇区代表该变量的一个类别。这种可视化方式能清晰呈现不同分类变量的分布和关联,便于快速识别数据中的模式和差异。 ...
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在线绘制单细胞测序scRNA-seq marker基因火山图
陈明杰 2025-4-21 14:15
导读: 《 Frontiers in Immunology 》单细胞测序文章“ Fibroblast growth factor receptor risk signature predicts patient prognosis and immunotherapy resistance in colorectal cancer ” Fig1B 的火山图展示了 8 种不同细胞类型中 top5 差异表达 marker 基因。 &n ...
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在线绘制单核苷酸多态性SNP密度图
陈明杰 2025-4-21 09:19
导读: 《PLoS One》文章“ Genome-wide association study of cassava starch paste properties ”fig 2的SNP密度图展示了18条染色体1Mb区间内的SNP数。行是染色体,不同的颜色表示不同的SNP密度,灰色表示没有SNP,绿色表示密度较低,红色表示密度最高。从这张图可以直观地看出SNP的分布情况,为疾病研究提供思 ...
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在线绘制cell metabolism同款多组配对连线散点图
陈明杰 2025-4-16 15:24
导读: 《Cell Metabolism》文章“ A key role of PIEZO2 mechanosensitive ion channel in adipose sensory innervation ”fig 2E的 多组配对连线散点图 展示了iWAT中5个感兴趣基因(Ucp1、Cidea、Fasn、Acacb、Adrb3)的相对表达水平。左侧灰色为Cre-组,右侧蓝色为Cre+组,共12个样品,每个样品以直线连接Cre ...
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