导读：在临床研究中，临床指标分类信息表记录了患者的年龄、性别、肿瘤分期等关键信息。为了高效分析这些信息，可采用甜甜圈矩阵可视化方法。甜甜圈图中每个扇区代表该变量的一个类别。这种可视化方式能清晰呈现不同分类变量的分布和关联，便于快速识别数据中的模式和差异。

图中最上面一行是8个临床指标的名字，包括Grade，Gender，T.Stage，N.Stage，M.Stage，Stage，Age1和Event。最左侧是每个Cluster（亚型）的名字和患者数。主图是3行8列的甜甜圈矩阵，每行代表一个Cluster（亚型），每列代表一个临床指标。例如C3行，Gender列的甜甜圈图是根据Cluster C3中Gender为FEMALE和MALE的患者数绘制的。甜甜圈最下面是卡方检验的p值以及颜色图例。

1，打开作图URL

https://www.bioinformatics.com.cn/plot_clinical_info_table_to_donut_matrix_plot_265

2，示例数据

点击图片上方的示例数据，下载，并使用excel打开。

示例数据为临床指标分类信息表，包括1+N列：

第1列是主分类：一般是通过建模等获得的分类信息，例如癌症亚型等。此列通常不是常规意义的临床指标信息。

第2+列是临床指标：性别，年龄，生存状态，癌症分期，分级等信息。不能是连续变量，必需是分类变量。例如不能是risk score的数值，可以是根据risk score值的高低所获得的高风险组和低风险组

3，输入检查

示例数据：点击输入框下面的“示例”按钮，将载入示例数据。

真实数据：数据放在excel中，调整好后，Ctrl+A选中数据，Ctrl+C拷贝，Ctrl+V粘贴数据到输入框中。

然后使用输入框下面的“输入检查”按钮先对输入数据进行检查。若检查不通过，请根据检查提示重复【修改-输入检查】步骤，直到检查通过（如下图所示），然后可以继续选择参数。

注：输入检查按钮会根据不同模块的输入要求，逐行逐列检查输入数据，并给出提示，确保数据符合模块输入要求。

4，选择参数

图片大小：1）图片宽度；2）图片高度。若内容放不下，则会自动扩展。

甜甜圈相关：1）甜甜圈半径，即甜甜圈的大小；2）甜甜圈宽度，即圆形带的宽度，当宽度为1时，甜甜圈会变成pie图；3）甜甜圈起始角度，即从多少度开始绘制，默认从90度开始逆时针绘制

图例相关：1）图例字体大小，即最下面图例的字体大小；2）图例相对位置，即图例距离主图的位置，数值越负，图例越往下；3）图例小矩形大小，即图例中带颜色的小矩形的大小。数值越大，小矩形越大。请配合图例字体大小使用

除legend外的其他文字字体大小：控制主图最上面临床指标文字，最左侧分类文字以及卡方检验p值文字的字体大小。若文字太长，请使用acrobat illustrator或者inkscape等编辑器编辑。详细的p值请下载统计信息表格

颜色：设置了27种自定义颜色。颜色顺序按照从第2列开始，每一列中唯一类别名的字母顺序排列。例如unknown在第3列出现过，在第5列又出现，则第5列的unknown的颜色就与前面第3列分配的unknown的颜色一样。即颜色不是按照每列独立分配的，而是整体分配的，即每个分类在所有数据中仅分配一种颜色 

字体：设置了期刊杂志中最常用的两种字体：Times New Roman和Arial。如需使用其他字体，可以下载pdf或者svg图片，然后使用acrobat illustrator或者inkscape进行编辑修改

5，提交出图

检查通过，并且参数选好后，点击“提交”按钮，约3s后，会在页面上显示临床指标分类信息汇总甜甜圈矩阵图。我们提供了pdf、svg两种矢量图，png、tiff两种标量图供大家下载使用。可以使用acrobat illustrator或者inkscape软件编辑矢量图，进行组图，调整文字位置，添加说明等操作，以满足个性化需求。

同时也提供了统计信息表格供下载。

表格中上半部分是每一列中每类的信息，即甜甜圈的数据

下半部分是卡方检验的统计结果，主要包括：总卡方值，p值，自由度（degree of freedom），期望频数（expected）信息。

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