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噬菌体几个视频链接,顺便再推荐下JoVE可视化的期刊
早在十多年前,我曾经在博文《科学网—视觉的冲击——令人叹为观止的可视化》一文提到“几乎每一篇SCI论文里都少不了统计数据和图表……
我们看到,高档的论文里对数据图表制作的要求也越来越严格,而样式也越来越趋于多样化。”
如博主数字科学交流在《科学出版将面临大崩溃?https://blog.sciencenet.cn/blog-521339-479646.html》
JoVE(Journal of Visualized Experiments)是一个以在线多媒体视频为主要出版内容的生物学学术期刊。它创刊于2006年,总部位于美国马萨诸塞州萨默维尔。JoVE的独特之处在于其所有文章均以视频形式呈现,并通过PubMed和MEDLINE索引,这使得实验研究更加生动和直观。这个期刊将实验以视频的方式展示,致力于提高科研的效率(The Journal of Visualized Experiments (JoVE) is a PubMed-indexed video journal. Our mission is to increase the productivity of scientific research. )!
学科领域和影响力
JoVE涵盖多个生物学领域,包括神经科学、细胞生物学、发育生物学、免疫学、生物工程、植物生物学等。其视频内容主要来源于哈佛大学、麻省理工学院、斯坦福大学、耶鲁大学等顶级学术机构的研究实验室2。由于JoVE的同行评审制度和高质量的视频内容,它被认为是科学研究和教育的重要资源。
用户评价和使用体验
用户对JoVE的评价普遍较高,认为其视频质量高、内容丰富,有助于直观理解复杂的实验过程。许多科研人员和学生通过JoVE学习新的实验技术和方法,认为其增加了文章的透明度和数据的可重复性。此外,JoVE还提供了免费的访问和同行评议的服务,进一步提升了其在学术界的影响力。
JoVE(Journal of Visual Experiments )杂志是一个以在线多媒体视频为出版内容的生物学学术期刊。经美国国家医学图书馆(NLM)和美国国立研究院(NIH)批准,从2008年8月起,JoVE杂志内容正是被Pubmed收录。成为世界上首家、也是唯一一家被Pubmed收录的以多媒体视频为出版内容的学术期刊。堪称学术期刊领域的里程碑,或开创学术期刊出版的新局面。

根据钱俊斌博主的介绍( https://blog.sciencenet.cn/blog-74774-38781.html来源:新科学 http://www.xinkexue.com)
JoVE杂志创办于2006年末, 总部位于美国马萨诸塞州东部城市萨默维尔。就其出版形式,我们可将其称作视频文章,即学术文章的内容完全是通过视频以动态的形式展现到互联网上。虽然也配 有少量的文字介绍,但这些文字也只是以方便被搜索和收录为目的。目前杂志已拥有200多篇来自包括免疫学、神经科学、微生物学、发育生物学等主要生物学领 域的视频文章。在短短不到两年的时间里,JoVE就能被Pubmed所收录、并且还是以一种新媒体的形式出现在学术期刊界,不得不让人称奇。当然,它的成 功除了它自身的创新性之外,得到世界顶尖科研机构的有力支持也是一大主要原因。通过访问他们的网站,我们不难发现,其中很大一部分视频文章都是来自像哈佛、普林斯顿大 学这样的超级牛校。再看一下它的编委阵容,21个编委有11个来自哈佛和普林斯顿,其受到的支持力度让人乍舌。另外,作为免费的、同行评议的在线生物学杂 志,JoVE对来稿的要求也相当严格,只有1/4的来稿最终会被接收和发表。而其另一种访谈形式的视频文章也只以邀请约稿的形式运作。
作为一种科学展示与共享的全新方式,在线视频文章的出现对科学的意义,笔者总结以下几点:
增 加文章的透明度、提高文献数据可重复性:目前科学研究的成果数据可重复性太差已经成为一个普遍的问题。一个科学家发表文章以及数据后,其他科学家根据其文 章描述的方法重复实验,却无法得到吻合的数据,那么这表明发表该文章的科学家在作假吗?当然有这种作假的科学家,那么这种赤裸裸的视频文章模式,将把这类 作假科学家拒之门外。另外,也有一部分科学家其实不是作假,而是因为在文章表述上的笼统与含糊,造成读者的理解偏差,最终导致数据无法重复。那么有了视频 的直观介绍,这种理解偏差将被大大减少。
拓展科学文献的展示纬度,并化繁为简:通过多媒体,通过动态的视频,人们能够具体 而详实地看到 从理论到操作的整个过程(特别是后者),比起看那些密密麻麻的蚂蚁文字和抽象图片,在线视频在帮助读者理解实验内容和掌握实验方法上具有很显著的优势。那 些深奥的科学通过视频的形象展示,降低了科学理论在描述上的复杂性和在理解上的难度。看文章的过程就像看一部科普电影般轻松,而且文章的内容在读者的脑海 中也将更加丰满,即能产生一个多维度的印象。
摆脱耗费在学习新技术上的无底黑洞:现代科学的发展日新月异,新的技术层出不 群,稍不留 神,你就落后了。学习和掌握新的实验技术仍是一种劳动密集型的苦差事,我们真有这么多时间去学这些技术吗?我们准备花多少时间、多少金钱在学习这些新技术 上呢?那可是一个无底的黑洞呀!视频文章的优势恐怕就是在于它既是一片科学文章,同样也是一片非常优良的视频教程,学习新技术?没问题,你要做的就只是 follow me!
可及性是在线视频的一大优势:只要你能够上互联网,只要你的电脑上安装过浏览器,一般你就能够访问到这些文献。而且单就JoVE而言,它还是免费的午餐,而且质地优良,无副作用,不吃白不吃呀
直接将视频文章关联到传统文章上:这也是JoVE所倡导的一个模式,那就文章作者在发表传统模式文章的时候,附带上视频文章在里面。那么,传统模式文章的优点和视频文章的优点将相得益彰,交相辉映。这个时候,我们是不是可以称这种文章为一种“完整”的文章了呢?
除了前面第5点说到的,有可能出现一种“完整”的文章的概念外,JoVE给文献应用格式上也带来了一些变化,那就是在引用在线视频文章的时候,必须得加上视频的所在网址了,如下格式(来自JoVE的网站):Carlson J.R., Shiraiwa T. (2007). Proboscis extension response (PER) assay in Drosophila. JoVE. 3. http://www.jove.com/Details.htm?ID=193, doi: 10.3791/193 。这种变化只是一个缩影,笔者相信随着在线视频文章模式的进一步推广,还会有更多的变化发生。 21世纪,互联网高速发展,它正在不断地改变人们的生活和工作方式,不管你愿不愿意,适不适应,这种改变都将继续发生,而且还是以“迅雷不及掩耳盗铃”之势地发生。当大众刚刚在为Youtube、酷6、优酷等在线视屏网站狂热的时候,才不到一年时间,科学家们就惊喜的发现,他们也能找到属于科学界的Youtube,那就是JoVE。这种转变、这种普及速度实在是快得惊人。那么各位,你准备好迎接这种挑战了吗?
噬菌体简介及其杀菌的机制


https://v.qq.com/x/page/i3574wyd1hk.html
https://v.qq.com/x/page/b3574tofr72.html
JoVE(Journal of Visualized Experiments,可视化实验杂志)科学视频期刊涵盖生物学、生物化学、免疫学和医学等领域。下面是一个示例:噬菌体是口腔病原体牙龈卟啉单胞菌生态学中未被认识的参与者
配备视频摘要
https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-023-01607-w
https://app.jove.com/v/201999/protocol-for-removing-bacteriophages-from-infected-salmonella
从受感染的沙门氏菌培养物中去除噬菌体
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