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取整截断函数及其在PBC中的使用
李继存 2013-8-17 07:47
取整截断函数及其在PBC中的使用 2013-08-13 14:05:39 取整和截断相关的函数,有着各种不同的名称,不同的定义,很容易让人迷惑。它们之间根据具体情况还可以相互转换成不同的写法,更增添了混乱。下面整理 Fortran 和 C 中的相关函数。 函数 Fortran C 向下取整 ...
个人分类: 数学轮子|13395 次阅读|没有评论
利用PyMOL制作反应势能面示意动画
热度 1 李继存 2013-4-18 23:50
2013-04-18 10:43:35 发布图片 2013-11-14 21:18:18 增加教程 2016-09-07 20:17:18 颜色映射 利用PyMOL内置的OpenGL制作了势能面反应的示意图, 具体制作过程容后再讲. PyMOL是基于Python的分子可视化软件, 在结构生物学中使用十分广泛. 它的主要特色是对生物大分子显示效果好, 并自带一个高效的光 ...
个人分类: 数学轮子|11917 次阅读|2 个评论 热度 1
空间中两随机向量间夹角的概率密度分布
李继存 2013-3-19 09:59
空间中两随机向量间夹角的概率密度分布
设空间维数为 n ,则此空间中任意两个向量之间的夹角 $\theta$ 符从一定的分布,其概率密度函数如下: $p(\theta)=\frac{\Gamma(\frac{n}{2})}{\Gamma(\frac{n-1}{2})} \frac{\sin^{n-2}(\theta)}{\sqrt\pi} $ 对二维平面, $n=2, p(\theta)=\frac{1}{\pi}$ 对三维空 ...
个人分类: 数学轮子|9764 次阅读|没有评论
一元三次方程求根公式及其Fortran代码
热度 2 李继存 2012-10-31 00:10
一元三次方程的求解比一元二次方程困难,求根公式看起来也很复杂, 中文 维基百科 上原先的三角函数解公式有误,我已经修改过了。但是我觉得还有必要将这些公式简化一下,给出具体的算法,以便编程使用。 首先需要明确,一元三次方程 $f(x)=ax^3+bx^2+cx+d=0,(a\neq0) $ 至少有一个实根 ...
个人分类: 数学轮子|24378 次阅读|5 个评论 热度 2
二维三次卷积插值算法及Fortran代码【更新】
李继存 2012-7-24 13:26
最近有人问起二维三次卷积插值算法( Cubic Convolution Interpolation )及其程序的问题,我想到这种插值算法也能用于图像的插值,所以也就有了兴趣,稍微了解了一下,并试着用 Fortran 实现了一下,同时也顺便复习了一下 Fortran90 的一下新特性。如果需要,敬请使用;发现 Bug ,烦请明示。 ...
个人分类: 数学轮子|10400 次阅读|没有评论

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