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关联作图和连锁作图要结合进行

已有 8077 次阅读 2010-9-27 21:45 |个人分类:关联作图|系统分类:论文交流| 关联作图

        呵呵不是我的意思,是这篇文章的意思Mouse Genome-Wide Association Mapping Needs Linkage Analysis to Avoid False-Positive LociAssociation Mapping Needs Linkage Analysis Mouse 中是这样,其它物种中也应该是这样的。当然人除外了,连锁作图的作图群体太难建了。关联作图和连锁作图是互补的方法。植物作图常用的是连锁作图,再把关联作图方法引过来,当然更好。合这两种方法之力,可能还不足以解决所有遗传学的问题,很显然还会有新方法的出现.

        如果一个作图群体能同时用关联作图及连锁作图的方法,可能综合两种方法的优点,岂不更好,什么群体?.这篇文章有答案:From mutations to MAGIC: resources for gene discovery,validation and delivery in crop plants

From mutations to MAGIC.这篇文章中提到的是MAGIC群体.拟南芥已经建立了MAGIC群体A Multiparent Advanced Generation Inter-Cross to Fine-Map Quantitative Traits in Arabidopsis thaliana.MAGIC IN arabidopsis还有种叫NAM群体,即:nested association mapping群体.这个群体目前在玉米中报道较多,如Genetic Design and Statistical Power of Nested Association Mapping in Maize(2008年),这篇应该是提出方法的文章Genetic Design and Statistical Power of Nested Ass 2009年有两篇science  Genetic Properties of the Maize Nested Association Mapping PopulationGenetic Properties of the Maize和The Genetic Architecture of Maize Flowering TimeThe Genetic Architecture of Maize Flowering Time还有玉米和拟南芥NAM群体的比较Comparison of Mating Designs for Establishing Nested Association Mapping Populations in Maize and Arabidopsis thalianaComparison of Mating Designs .NAM应用中的条件优化Optimum allocation of resources Optimum allocation of resources for QTL detection using a nested association mapping strategy in maize当然,我更关注的是水稻,以前搜过,只搜到一个研究计划Medium-Term Plan: 2009–2011。该计划可能也要有文章出来了。

       这是一年以前就关注的东西了,我以前的博客中有,感觉这东西挺有意思,所以再重新补充资料。连我自己都有点怀念那个已经无法打开的博客了。有些东西已经没法补了。愿这个博客能长寿点。当N多年后再来看自己现在写的一些东西会是什么感觉?自己的一些基本判断是否正确,未来能告诉答案



https://wap.sciencenet.cn/blog-479743-367592.html

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