MKL离线编译CP2K 7.1+Plumed的详细过程 2021-09-14

Plumed是CP2K的一个扩展包（其不只支持CP2K，还支持其他众多分子动力学软件），可以实现各种增强采样模拟及数据分析；包含的增强采样方法如Metadynamics、Umbre ...

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Ubuntu18.04编译VASP.5.4.1两种方法的详细过程(修改版) 2021-09-14

笔者曾在 2018-9-28 根据自己的经验总结了 VASP 在 Ubuntu 系统的安装方法，但是可能由于包含一些过时的信息而被屏蔽，这里笔者修改之后重新分享给需要的朋友 ...

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Pymol 入门：Pymol的安装与作图 2020-06-09

1.       Pymol  在 Windows  系统中的安装 Pymol 是著名的分子结构显示与绘图软件，有企业版、政府和学术版 ...

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ASE 的安装及其与VASP 对接的方法 2019-09-02

ASE 的全称是 Atomic Simulation Environment ，是一款基于 python 程序语言的工具包合集。支持与很多 DFT 程序的对接（ Abinit, CP2K, NWChem, Gaussian, Vas ...

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CP2K, NWChem 等在个人工作站上的安装 2018-08-13

  目前为止，笔者接触 CP2K 将近一年了。个人能力有限，曾经几次尝试在集群上编译 CP2K 均以失败告终。令人欣慰的是曾成功在 Ubuntu 16.04 上（单节点的 ...

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统计水分子间氢键个数的 Pymol 脚本 2017-11-21

       笔者编写了一个统计水分子间氢键个数的小脚本，与大家分享一下。该脚本基于 python 3 编写而成， 可以直接应用于 pymol 软件。脚 ...

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