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什么是bootstrap？: 热度 6 张金龙 2011-12-30 00:00; Bootstrap又称自展法，是用小样本估计总体值的一种非参数方法，在进化和生态学研究中应用十分广泛。例如进化树分化节点的自展支持率等。 Bootstrap的思想，是生成一系列bootstrap伪样本，每个样本是初始数据有放回抽样。通过对伪样本的计算，获得统计量的分布。例如，要进行1000次bootstrap，求平均值的置信区间，可以对每 ...; 个人分类: 统计分析|48138 次阅读|9 个评论热度 6

一个简单的马尔可夫链: 热度 2 张金龙 2011-12-1 15:04; 一个简单的马尔可夫链在一个随机过程中，如果事件发生概率在t时刻所处的状态为已知时，它在t + 1时刻只与t时刻的状态有关，而与之前所处的状态无关，则称该过程具有马尔可夫性。时间和状态都是离散的马尔可夫过程称为马尔可夫链。马尔可夫链在经济学，社会学，生命科学领域有着广泛的应用。这里举例说明。例子：姜 ...; 个人分类: 统计分析|27288 次阅读|5 个评论热度 2

二项分布的对数似然面:算法与R语言实现: 热度 1 张金龙 2011-11-19 00:47; 二项分布的对数似然面 : 算法与R语言实现 jinlongzhang01@gmail.com 对数似然面是极大似然估计的结果之一，这里介绍在R语言中如何绘制对数似然面（Log Likelihood Surface）,这里用到的对数似然函数是二项分布的，对于泊松分布，正态分布，负二项分布等，只需对对数似然函数进行适当修改即可。 ...; 个人分类: 统计分析|12404 次阅读|1 个评论热度 1

用R语言绘制似然面Likelihood Surface: 热度 1 张金龙 2011-11-18 12:46; 本文的目的，是直观表达极大似然估计。给出一组数，若用正态分布拟合，则其平均值和标准差最可能的取值是什么？极大似然面的顶点，就是最优估计。实际情况下，是对对数似然函数 Log Likelihood 取极值。这里只按照似然（ Likelihood ）的原始定义，直接求 Likelihood 。 like ...; 个人分类: 统计分析|10402 次阅读|1 个评论热度 1

6亿年来的海陆变迁: 张金龙 2011-11-5 12:06; 晚元古代（600MA）6亿年前元古代末期（560Ma） 5.6亿年前早寒武纪（540Ma） 5.4亿年前晚寒武纪（500MA） 5.0亿年前中奥陶纪（470Ma） 4.7亿年前晚奥陶纪（450MA） 4.5亿年前志留纪（430Ma） 4.3亿年前早泥盆纪（400MA） 4.0亿年前晚泥盆纪（370Ma） 3.7亿年前密西西比世 ...; 个人分类: 天文地理|12906 次阅读|没有评论

如何编写R函数: 热度 1 张金龙 2011-10-26 19:28; 如何编写 R 函数？张金龙 jinlongzhang01@gmail.com R 语言实际上是函数的集合，用户可以使用 base ， stats 等包中的基本函数，也可以自己编写函数完成一定的功能。但是初学者往往认为编写 R 函数十分困难，或者难以理解。这里对如何编写 R 函数进行简要的介绍。 ...; 个人分类: 统计分析|44283 次阅读|3 个评论热度 1

Inno setup 制作安装文件以编译FigTree为例: 热度 1 张金龙 2011-10-17 11:45; Inno setup 制作安装文件以编译FigTree为例张金龙（jinlongzhang01@gmail.com） Windows下安装文件的制作为软件的安装和卸载提供了方便。用户不再用担心可执行文件及动态连接库等保存在固定的文件夹中，只需要进行软件的安装和卸载，就可以将全部需要的可执行文件，以及程序运行所需要的文件创建和删除。这为程序管 ...; 个人分类: 科研笔记|8549 次阅读|1 个评论热度 1

Cygwin 简明指南-以编译r8s为例: 热度 1 张金龙 2011-9-23 16:58; 本文内容已经过期，请参考新版 http://blog.sciencenet.cn/blog-255662-1144730.html Cygwin 是 Windows 平台下的一套 Unix/Linux 模拟环境，为 Windows 用户提供了 shell 环境以及 linux 下的编译器如 gcc 及众多软件 (Perl, Python,VIM, Emacs, Gedit 等等 ) 。这里介绍如何用 Cygwin 编译分子 ...; 个人分类: 科研笔记|9423 次阅读|6 个评论热度 1

如何撰写生态学科研论文？: 热度 2 张金龙 2011-8-7 23:14; 如何撰写生态学科研论文？张金龙科研论文是科学家贡献的最直接标志。好的研究论文往往具有很强的生命力，在十几年，甚至几十年后还会有人引用。研究论文，作为当代最重要的科学研究著作的形式，理应受到特别的关注。而对于广大研究生而言，学会正确的撰写科研论文，也是学习的重 ...; 个人分类: 科研笔记|6159 次阅读|2 个评论热度 2

PCNM动画展示：生态学与空间统计学: 热度 2 张金龙 2011-7-28 19:29; PCNM (Principal Coordinates of Neighbourhood Matrix) 是 Legendre 教授等开发出的表示空间关系的方法，类似于 pcoa 。常用于生物多样性空间格局研究中，例如在古田山 beta 多样性研究中， Legendre ( 2009 ) 就使用了这种方法。用样地的规则栅格距离可以对点两两之间的距离关系进行 PCNM 模拟。 &n ...; 个人分类: 统计分析|23740 次阅读|2 个评论热度 2

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