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置顶 · 升级版|16srRNA微生物多样性测序报告解读
2021-4-1 17:29
微生物多样性测序(扩增子测序)是基于二代高通量测序对16S/18S/ITS等序列进行测序。可以同时检测样本中的优势物种、稀有物种及一些未知物种的检测,获得样本的微生物群落组成以及相对丰度。 相信关注我们的小伙伴对此并不陌生。 这次我们整合了大家平时会遇到的一些问题,在原有的基础上对报告进一步完善。 ...
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置顶 · [转载]多快好省的宏基因组研究技巧 — 资深专家分享
2020-4-27 13:34
谷禾健康 原创 近年的研究热点集中于环境和生物体相互作用的微生物群体,而大量复杂的微生物群体存在培养困难,构成复杂(包括细菌、古菌、真菌、原生生物、病毒甚至小型真核生物)。因此 如何用高通量精准的了解这些群体的构成,基因功能分布以及具体的表达活性和代谢状况 成为首要问题。 高通量测序技术 ...
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置顶 · [转载]微生物多样性测序结果如何看?
隐藏 2019-11-18 14:37
原文 如何读懂和利用你的微生物多样性测序结果? 谷禾健康 原创 做过16s测序的小伙伴们都知道 测完之后会拿到一份结果报告 但这并不代表可以开始写文章了 看似一大堆数据图表却不知如何下手 这是很多人头疼的地方 那么怎样给报告中的数据赋予灵魂 让它真正成为对你有帮助的分析呢? 今天我们来详细解 ...
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[转载]正值夏季,警惕食源性疾病,常见的食物中毒的病原菌介绍
2021-7-30 14:21
民以 食 为天,食以 安 为先。 随着夏季来临,我们最近检测的报告中发现以上食源性 致病菌 的检出率和超标率也在逐步上升。 尽管许多人可能没有意识到,近年来, 食源性疾病 的发病率逐年升高, 食源性病原体 正在 引起大量疾病 ,对人类健康和经济产生重大影响,已成为全球范围内的重大公共卫生问题。 食 ...
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[转载]最新研究 | 抑郁症竟与口腔微生物群相关
2021-7-27 09:39
抑郁症似乎已经成了这个时代的通病之一,它是一种复杂的心理健康障碍,影响着全世界3亿多人。 我们知道, 脑-肠道-微生物组轴 在抑郁症和其他精神疾病中发挥重要作用。然而,口腔微生物群在心理健康中的潜在作用很少受到关注。 近日,一项研究基于 16S rRNA测序,比较了抑郁症(n = 40)和匹配对照(n = 43)的 ...
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[转载]肠道重要基石菌属——罗氏菌属(Roseburia)
2021-7-26 09:57
罗氏菌属是共生细菌的一部分,在世界各地的人群中都有代表,占健康肠道细菌总数的 2-31%(谷禾数据库)。产生短链脂肪酸,特别是丁酸,影响结肠运动,具抗炎特性。 注: ↓代表其丰度较低, ↑代表其丰度较高 罗氏菌属 の 基本特性 罗氏菌属(Roseburia) ...
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[转载]瘤胃球菌属——消化降解关键菌?炎症标志菌?
2021-7-22 09:42
瘤胃球菌(ruminococcus)在 消化抗性淀粉 方面起着重要作用,但也与肠道疾病(IBS,IBD,克罗恩等)、免疫性疾病(过敏、湿疹、哮喘等)、神经系统疾病(自闭症,抑郁症等)相关。 瘤胃球菌の基本特性 瘤胃球菌属, 革兰氏阳性菌 , 厌氧 ,呈球状,不产生孢子。 瘤胃球菌是最早发现的胃部细菌之 ...
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[转载]拟杆菌属——只有在正确的位置和合适的丰度下才是有益菌
2021-7-16 14:14
拟杆菌(bacteroides)——重要的基石菌属,存在于人类肠道中,它们与人类具有 共生 关系。它们有助于 分解 食物并 产生 身体所需的 营养和能量 。然而,当拟杆菌进入到除胃肠区域 以外 的身体部位,可引起或加剧脓肿等 感染 。 初识拟杆菌 拟杆菌是革兰氏 阴性 、不形成孢子、 厌氧 和杆状细菌, ...
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肠道细菌四大“门派”——拟杆菌门,厚壁菌门,变形菌门,放线菌门
2021-7-12 14:29
一般在肠道菌群健康检测报告中,会有 主要菌属构成比例 ,类似下图: 图源:谷禾肠道菌群健康检测报告 我们可以看到图中列举了拟杆菌门,厚壁菌门...等。很多小伙伴拿到报告之后,对于这些细菌门表示困惑。 这些细菌门都代表了什么意思? 某个细菌门比例高了会怎么样? 某个细菌门比例高,是好是坏 ...
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换个角度看“三胎” | 胎次影响母婴肠道菌群
2021-7-7 14:28
生?还是不生? 随着三胎政策到来,关于三胎的话题源源不断: 包括显而易见的经济压力,职场男女是否平等,教育是否能跟上,住房是否得到保障,医疗问题,家庭关系,产后心理等各个方面。 今天我们抛开这些看, 生育更直接的是一 次 身体的考验 。 单看“三胎”这个词,意味着母亲从十月怀胎 ...
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[转载]高脂饮食改变肠道微生物群,且削弱抗生素作用
2021-7-6 14:43
所谓的 抗生素耐受性 是一种典型的易感微生物在 长时间接触 抗生素后 存活的能力 ,它在慢性和复发性细菌感染中起着 关键作用 ,并促进了抗生素耐受性的演变。然而,促进抗生素耐受性发展的生理因素还不完全清楚。 最新研究表明,高脂肪饮食可以改变肠道微生物群,从而削弱抗生素的功效。 扬州大学研 ...
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[转载]排便困难?反复便秘?不要忽视肠道菌群
2021-7-6 09:52
便秘 是世界范围内 高度流行 的功能性 胃肠道疾病 ,患病率为 2-20%. 根据罗马 IV 标准,慢性便秘的典型症状是 排便困难、不频繁或不完全排便 。 便秘的症状 总是连续不断、反复出现,严重影响患者的身心健康和生活质量。 慢性便秘与 多种因素 有关,如肠道神经细胞的变化、菌群改变、肌病、神经递质和生 ...
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