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代谢组数据上传攻略:手把手教你从零搞定Metabolomics Workbench!
陈明杰 2025-6-9 13:02
导读: 还在为代谢组数据存储和共享发愁?本文为你带来最全上传指南 —— 从注册账号、填写元数据,到数据上传、审核反馈,一步步教你获得专属 DOI 号,让数据可追溯、可引用! 一、代谢组简介 代谢组( Metabolome )是指生物体内所有小分子代谢物的集合,包括中间代谢产物(如氨基酸、有机酸)、激素 ...
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在线绘制Nature Biomedical Engineering同款基因排序图
陈明杰 2025-5-27 13:46
导读: 基因排序点图是基因表达分析的可视化利器。它按基因倍数变化从大到小排序,清晰呈现表达差异显著的基因。结合颜色编码 p 值,可直观判断基因表达变化的统计学意义,助力高效筛选关键基因。 & ...
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在线临床指标分类信息表转甜甜圈矩阵图
陈明杰 2025-4-24 15:54
导读: 在临床研究中,临床指标分类信息表记录了患者的年龄、性别、肿瘤分期等关键信息。为了高效分析这些信息,可采用甜甜圈矩阵可视化方法。甜甜圈图中每个扇区代表该变量的一个类别。这种可视化方式能清晰呈现不同分类变量的分布和关联,便于快速识别数据中的模式和差异。 ...
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在线绘制单细胞测序scRNA-seq marker基因火山图
陈明杰 2025-4-21 14:15
导读: 《 Frontiers in Immunology 》单细胞测序文章“ Fibroblast growth factor receptor risk signature predicts patient prognosis and immunotherapy resistance in colorectal cancer ” Fig1B 的火山图展示了 8 种不同细胞类型中 top5 差异表达 marker 基因。 &n ...
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在线绘制单核苷酸多态性SNP密度图
陈明杰 2025-4-21 09:19
导读: 《PLoS One》文章“ Genome-wide association study of cassava starch paste properties ”fig 2的SNP密度图展示了18条染色体1Mb区间内的SNP数。行是染色体,不同的颜色表示不同的SNP密度,灰色表示没有SNP,绿色表示密度较低,红色表示密度最高。从这张图可以直观地看出SNP的分布情况,为疾病研究提供思 ...
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在线绘制cell metabolism同款多组配对连线散点图
陈明杰 2025-4-16 15:24
导读: 《Cell Metabolism》文章“ A key role of PIEZO2 mechanosensitive ion channel in adipose sensory innervation ”fig 2E的 多组配对连线散点图 展示了iWAT中5个感兴趣基因(Ucp1、Cidea、Fasn、Acacb、Adrb3)的相对表达水平。左侧灰色为Cre-组,右侧蓝色为Cre+组,共12个样品,每个样品以直线连接Cre ...
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