稻瘟病是由稻瘟病菌（M.oryzae）引起的世界范围内最严重的病害之一。培育抗稻瘟病水稻品种是控制稻瘟病传播、减少对化学农药依赖的有效策略。在这项研究中，来自48个国家的477个测序水稻种质在孕穗期进行了接种和评估。我们发现23个种质对稻瘟病表现出较高的穗瘟抗性。全基因组关联分析（GWAS）鉴定出43个数量性状位点（QTL）与水稻穗瘟抗性显著相关（P<1.0×10−4）。这些QTL区间包含四个先前报道的与稻瘟病抗性有关的基因（OsAKT1、OsRACK1A、Bsr-k1和Pi25/Pid3）。我们选择了-Log10（P值）大于6.0的QTL或在两年重复中检测到的QTL，共计12个QTL，用于进一步的候选基因分析。根据这12个QTL注释基因序列中的显著单核苷酸多态性（SNP）分布以及接种72小时后抗稻瘟病品种之间的差异表达水平，鉴定出3个抗稻瘟病候选基因（Os06g0316800、Os06g0320000、Pi25/Pid3）。Os06g0316800编码一种富含甘氨酸的蛋白质OsGrp6，它是参与细胞应激反应和信号传导的植物细胞壁的重要组成部分。Os06g0320000编码一种功能未知的蛋白质（DUF953），它是硫氧还蛋白样家族的一部分，对维持体内活性氧（ROS）稳态至关重要，被称为OsTrxl1。最后，Pi25/Pid3编码一种抗病蛋白，强调了其在植物生物学中的潜在重要性。通过分析这三个基因的单倍型，我们确定了有利于抗稻瘟病的单倍型，为未来的水稻抗稻瘟病育种计划提供了宝贵的遗传资源。

2024发表的研究论文

Molecular Breeding (2024) 44:49 https://doi.org/10.1007/s11032-024-01486-5