现代医学研究表明，春困主要是由于春季气温升高，皮肤血管扩张，体表血液供应量增加，使大脑的血液供应量相应减少，从而导致人出现困倦、疲乏的感觉。此外，春季人体新陈代谢旺盛，耗氧量不断加大，大脑供氧量相对不足，也会使人感到困倦。这些生理变化主要是基于人体对当前环境变化的即时生理反应。

冬季日照时间短，人体生物钟会适应这种环境，形成相对缓慢的节奏。春季日照时间逐渐延长，生物钟需要一定时间来重新调整和适应这种变化。在这个调整过程中，身体的各项机能可能会出现暂时的不协调，导致人容易感到困倦，这或许与进化过程中形成的对季节变化的适应性基因有关。

在远古时代，人类和许多动物一样，面临着食物资源的季节性变化。冬季食物匮乏，为了生存，人类可能会逐渐发展出类似半冬眠的生理调节机制，降低身体的能量消耗。随着春季的到来，虽然食物资源逐渐丰富，但身体的这种节能机制可能不会立刻消失，依然会在一定程度上影响人体的生理状态，使人感到困倦，从这个角度看，春困可能是冬眠基因遗留影响的一种表现。然而截至今天，尚未发现明确的冬眠基因存在于人类基因组中，也没有研究能够直接证明春困与所谓的冬眠基因之间存在因果关系。春困更倾向于是人体在春季特定环境下的一种正常的生理调节现象。