为便于读者系统、高效地查阅已出版的同类研究主题学术成果，本编辑部特别推出"虚拟专辑"栏目。通过整理Green Carbon期刊既有刊文资源，有机整合跨期次发表的相关研究成果，以虚拟专辑形式在官方微信公众号平台进行发布。
公众号原文链接：Green Carbon虚拟专辑 | 合成生物学与绿色生物制造
1 Review
1. 汽爆秸秆中试发酵高效生产生物丁醇北京化工大学谭天伟院士团队在Green Carbon发表文章，通过简单间歇补料发酵调控策略实现了丙酮丁醇梭菌直接利用不脱毒蒸汽爆破秸秆酶解液发酵产生物丁醇。并进一步通过发酵过程的逐级放大讨论了潜在的“放大效应”对该发酵调控策略的影响。
题目：Pilot-scale acetone-butanol-ethanol fermentation from corn stover
作者：Changsheng Su, Di Cai*, Honggang Zhang, Yilu Wu, Yongjie Jiang, Yicheng Liu, Changwei Zhang, Chunling Li, Peiyong Qin, Tianwei Tan*
关键词：Bio-butanol；Fermentation；Corn stover
论文网址：http://doi.org/10.1016/j.greenca.2024.02.004
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2. 高甲酸盐浓度下的酿酒酵母耐受机制
北京化工大学谭天伟院士团队在Green Carbon发表文章，随着全球能源和环境危机的加剧，发展可持续的生物技术解决方案成为了迫切需求。文章采用自适应实验室演化技术改善了酵母对甲酸盐的耐受性，并探索了潜在的分子机制。
题目：Investigating formate tolerance mechanisms in Saccharomyces cerevisiae and its application
作者：Kai Wang , Yining Liu , Zhuoheng Wu , Yilu Wu , Haoran Bi , Yanhui Liu , Meng Wang , Biqiang Chen , Jens Nielsen, Zihe Liu*, Tianwei Tan*
关键词：Yeast；Formate tolerance；Metabolic engineering
论文网址：http://doi.org/10.1016/j.greenca.2023.08.003
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3. 合成生物技术推动新型生物基增塑剂反式乌头酸酯的开发
中国科学院青岛生物能源与过程研究所吕雪峰研究员团队在Green Carbon发表文章，开发了一种基于反式乌头酸的新型生物基增塑剂，将有望部分取代传统的石油基邻苯类增塑剂，突破塑料行业的发展瓶颈，服务人类健康与自然环境。
题目：Integration of Biological Synthesis & Chemical Catalysis: Bio-based Plasticizer trans-Aconitates
作者：Hongbin Hou, Xuenian Huang, Zhiqiang Du, Jian Guo, Min Wang, Guangqiang Xu, Ce Geng, Yunpeng Zhang, Qinggang Wang*, Xuefeng Lu*
关键词：Bioplastics；Plasticizers；Trans-aconitic acid；Sustainability
论文网址：http://doi.org/10.1016/j.greenca.2023.08.001
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4. 亲和诱导的蛋白质邻近连接系统
以色列魏茨曼研究所与本古里安大学研发团队在Green Carbon发表文章，开发了基于非共价互作模块Cohesin-Dockerin间的亲和作用以及共价交联模块SpyTag-SpyCatcher间的化学反应实现蛋白分子间近距离连接的系统。通过这一方法获得的蛋白结合复合物可耐受高温、表面活性剂SDS和尿素，同时保持相互作用模块组分的高亲和力和特异性。这种基于纤维小体的模块化蛋白复合物结构可以用于先进仿生分子机器的构建，也可应用于木质纤维素降解研究。
题目：Affinity-induced covalent protein-protein ligation via the SpyCatcher-SpyTag interaction
作者：Jacob O. Fierer, Omar E. Tovar-Herrera, Jonathan Y. Weinstein, Amaranta Kahn, Sarah Moraïs, Itzhak Mizrahi, Edward A. Bayer*
关键词：Protein engineering；Cohesin-Dockerin；SpyTag-SpyCatcher
论文网址：http://doi.org/10.1016/j.greenca.2023.07.001
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5. 生长偶联的甲醇脱氢酶活性与辅因子偏好性进化
中国科学院天津工业生物技术研究所王钰研究员、郑平研究员与华南理工大学李爽教授合作在Green Carbon发表文章，设计了一种基于辅因子营养缺陷型的生长偶联定向进化策略，用于提高MDH的催化活性并改变其辅因子偏好性。筛选获得的突变体可以为构建高效的甲醇生物转化细胞工厂提供性能优秀的催化元件。
题目：Engineering of cofactor preference and catalytic activity of methanol dehydrogenase by growth-coupled directed evolution
作者：Jinxing Yang, Liwen Fan, Guimin Cheng, Tao Cai, Jibin Sun, Ping Zheng*, Shuang Li*, Yu Wang*
关键词：Methanol dehydrogenase；Cofactor preference；Directed evolution
论文网址：http://doi.org/10.1016/j.greenca.2024.03.004
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2 Research
6. 合成左旋苹果酸的研究进展
中国科学院天津工业生物技术研究所张学礼研究员团队在Green Carbon发表文章，全面回顾了微生物合成L-苹果酸的历史背景和最新进展，论述了微生物发酵生产L-苹果酸工业化过程中所面临的挑战，并对相应的解决方案进行了总结。
题目：Microbial L-malic acid production: History, current progress, and perspectives
作者：Yongyan Xi, Feiyu Fan*, Xueli Zhang*
关键词：Bio-based production；L-malic acid；Metabolic engineering
论文网址：http://doi.org/10.1016/j.greenca.2023.10.005
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7. 红酵母——高效合成脂质和类胡萝卜素的细胞工厂
中国海洋大学刘光磊教授团队在Green Carbon发表文章，对红酵母起源、产品多样性以及遗传进展进行了全面的文献回顾，论述了红酵母作为微生物脂质、类胡萝卜素生产的高质量细胞平台的前景。
题目：Developing Rhodotorula as microbial cell factories for the production of lipids and carotenoids
作者：Ting-Ting Zhang, Ai-Hua Wu, Muhammad Aslam, Ji-Zhen Song, Zhen-Ming Chi, Guang-Lei Liu*
关键词：Microbial cell factories；Lipids；Carotenoids
论文网址：http://doi.org/10.1016/j.greenca.2024.09.004
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8. 半纤维素酶在纤维小体体系中至关重要
中国科学院青岛生物能源与过程研究所刘亚君研究员在Green Carbon发表文章，全面论述了纤维小体中半纤维素酶的类型、丰度、调控、活力及其在解除半纤维素对纤维小体抑制作用中的重要性，进而提出了未来基于半纤维素酶实现纤维小体定向强化的可能。
题目：Cellulosomal hemicellulases: indispensable players for ensuring effective lignocellulose bioconversion
作者：Min Xiao, Ya-Jun Liu*, Edward A. Bayer, Akihiko Kosugi, Qiu Cui, Yingang Feng
关键词：Cellulosomal hemicellulases；Bioconversion；Lignocellulose
论文网址：http://doi.org/10.1016/j.greenca.2024.01.003
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3 Commentary
9. 微生物绿色生物制造——以卟啉合成为例
华东理工大学的张立新、谭高翼团队在Green Carbon发表文章，对发表在Nature Biotechnology上的研究长文进行了评述，并以卟啉合成为例，讨论了微生物绿色生物制造领域的发展潜力和工业前景。
题目：Microbial green biomanufacturing: Porphyrin production as a representative
作者：Xiaoqing Wang, Yongjin J. Zhou*, Ya-Jun Liu*
关键词：Green biomanufacturing；Porphyrin production
论文网址：http://doi.org/10.1016/j.greenca.2024.08.001
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10. 人类肠道中广泛存在产纤维小体细菌
中国科学院青岛生物能源与过程研究所的冯银刚研究员与美国蒙大拿州立大学的Carl J. Yeoman教授在Green Carbon发表文章，对发表在Science上题为“Cryptic diversity of cellulose-degrading gut bacteria in industrialized humans”的研究论文进行了评述。
题目：When cellulosomes meet humans
作者：Yingang Feng*, Carl J. Yeoman*
关键词：Cellulosomes；Human gut microbiome；Bacteria
论文网址：http://doi.org/10.1016/j.greenca.2024.06.001
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11. 人工智能推进蛋白质结构预测与设计
中国科学院青岛能源所房森彪助理研究员、德国格瓦大学韦韧博士、中国科学院微生物研究所崔颖璐副研究员和剑桥大学苏林博士在Green Carbon发表文章，针对Baker等人在Science上发布的RoseTTAFold All Atom (RFAA)和RFdiffusion All-Atom (RFdiffusionAA)全原子生物分子“组装体”结构预测深度学习工具进行了系统性分析和点评。
题目：Advancing AI protein structure prediction and design: From amino acid “bones” to new era of all-atom “flesh”
作者：Senbiao Fang, Ren Wei, Yinglu Cui*, Lin Su*
关键词：AI protein structure prediction；All-atom modeling；Protein design
论文网址：http://doi.org/10.1016/j.greenca.2024.05.001
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12. 合成生物学助力疫苗佐剂的全生物合成
青岛农业大学李美洁副教授、丹麦技术大学姜兴林教授、中国科学院大连化学物理研究所周雍进研究员以及青岛农业大学杨建明教授在Green Carbon发表文章，对发表在Nature上的论文进行了系统性分析和点评，表示QS-21的全生物合成展示了合成生物学在解决复杂化学问题方面的潜力。
题目：Toward sustainable supply of vaccine adjuvant via synthetic biology
作者：Meijie Li, Xinglin Jiang, Yongjin J. Zhou*, Jianming Yang*
关键词：Synthetic biology；Vaccine adjuvants
论文网址：http://doi.org/10.1016/j.greenca.2024.07.001
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