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胚胎中的基因网络过渡取决于先驱转录因子和核心组蛋白之间互作
2020-03-19 16:57

美国宾夕法尼亚大学Kenneth S. Zaret、Makiko Iwafuchi等研究人员合作揭示,胚胎中的基因网络过渡取决于先驱转录因子和核心组蛋白之间的相互作用。 相关论文于2020年3月16日在线发表在《自然—遗传学》杂志上。

研究人员确定了一个短的α螺旋区,在FOXA先驱因子之间保守,它与核心组蛋白相互作用并有助于体外的染色质开放。相同的结构域参与了正常小鼠早期胚胎的染色质开放。因此,通过先驱因子和核心组蛋白之间的相互作用,染色质的局部开放促进了基因编程。
 
据介绍,胚胎和其他命运改变的背景下的基因网络转换涉及转录因子的组合。一类命运改变的转录因子是先驱因子,它们扫描并靶向核小体DNA,并起始可打开局部染色质的合作事件。然而,与核小体的分子相互作用如何促进染色质开放现象方面仍然了解较少。
 
附:英文原文

Title: Gene network transitions in embryos depend upon interactions between a pioneer transcription factor and core histones

Author: Makiko Iwafuchi, Isabel Cuesta, Greg Donahue, Naomi Takenaka, Anna B. Osipovich, Mark A. Magnuson, Heinrich Roder, Steven H. Seeholzer, Pilar Santisteban, Kenneth S. Zaret

Issue&Volume: 2020-03-16

Abstract: Gene network transitions in embryos and other fate-changing contexts involve combinations of transcription factors. A subset of fate-changing transcription factors act as pioneers; they scan and target nucleosomal DNA and initiate cooperative events that can open the local chromatin. However, a gap has remained in understanding how molecular interactions with the nucleosome contribute to the chromatin-opening phenomenon. Here we identified a short α-helical region, conserved among FOXA pioneer factors, that interacts with core histones and contributes to chromatin opening in vitro. The same domain is involved in chromatin opening in early mouse embryos for normal development. Thus, local opening of chromatin by interactions between pioneer factors and core histones promotes genetic programming.

DOI: 10.1038/s41588-020-0591-8

Source: https://www.nature.com/articles/s41588-020-0591-8

Nature Genetics:《自然—遗传学》,创刊于1992年。隶属于施普林格·自然出版集团,最新IF:41.307
官方网址:https://www.nature.com/ng/
投稿链接:https://mts-ng.nature.com/cgi-bin/main.plex


本期文章:《自然—遗传学》:Online/在线发表

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