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schrodinger cnavas 计算小分子相似性

已有 6943 次阅读 2017-12-2 22:13 |系统分类:科研笔记

canvas 是针对小分子的软件工具,包括如下功能:

(八)化学信息学:薛定谔软件的化学信息学解决方法提供以下专业算法:二元指纹向量聚类分析;相似性分析;层次聚类方法;化学过滤方法;多样性分析;sphere exclusion diversity;字结构搜索;独特的SMILES产生法;多元线性回归;偏最小二乘回归;主成份分析;主成份回归分析;神经网络算法;朴素贝叶斯分析算法;自组织特征映射法;所需模块:Canvas;

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canvas中计算分子相似性有2个工具:

工具1是计算相似性矩阵,application->similarity matrix from Finger



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工具2是相似性筛选      application->similarity screen

这2个方法的基础是先计算获得分子指纹:





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