dssp是分析蛋白二级结构的程序。

biopython中本身是不带有dssp程序的，他是调用电脑中的dssp。

因此我们先安装dssp,建议直接使用编译好的软件，

下载链接：

https://pan.baidu.com/s/1c1BrXz6

然后修改权限变成可执行文件，修改文件名dssp。注意小写。

将其添加到环境变量PATH中。

如果依旧不可以，可直接在脚本文件中指定其路径。

 dssp=DSSP(model_rec,pdbfile,dssp="/home/gaussian/python2.7/bin/dssp")

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安装方法2：

通过conda 命令安装，conda install -c ostrokach dssp

安装后得到的明林是mkdssp;

which mkdssp

~/anaconda2/bin/mkdssp

cp mkdssp dssp