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基因组坐标
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缺少规范的后果就是，每用一个文件都得去确认它的标准。
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基因组文件也是个烦人的问题，有些格式是的第一个碱基是0，有些又是1，要做精确到碱基的分析时，就比较烦恼了。
现在把常用的坐标起始问题记录一下。
UCSC注释文件的起始坐标都是0，参见https://cgwb.nci.nih.gov/goldenPath/gbdDescriptions.html
ENCODE peak文件起始坐标也是0，参见http://genome.ucsc.edu/FAQ/FAQformat.html#format13
GFF格式起始坐标是1，说明同上。
MACS输出文件储xls格式外，其余也都是0起始，参见https://github.com/taoliu/MACS/
NCBI genbank文件起始坐标应该是1.
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