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单细胞数据融合方法：SCALEX: 张俊鹏 2023-3-24 18:04; 单细胞数据融合方法： SCALEX 单细胞实验能够将样品分解成其组成成分、不同细胞类型和细胞状态。许多计算工具已经开发用于单细胞数据集的综合分析，所有这些工具都寻求从非生物噪声（例如不同供体、条件和 / 或分析平台的批量效应）中分离生物变化。随着单细胞研究的技术进步，整合任务的范围正在迅速 ...; 个人分类: 科普|234 次阅读|没有评论

单细胞RNA测序数据可视化工具比较: 热度 1 张俊鹏 2023-3-20 22:00; 单细胞 RNA 测序数据可视化工具比较在短短十余年时间里，由于测序协议的出现，每个单细胞测序实验中表征的细胞数量从约 1000 个细胞增加到数百万个细胞。同时，许多计算方法也被开发出来用于分析和量化单细胞测序数据。典型的单细胞测序分析管道从原始读取开始，对其进行处理以创建一个表达矩阵，其中包含 ...; 个人分类: 科普|404 次阅读|1 个评论热度 1

AgeAnno：人类衰老单细胞注释知识库: 热度 1 张俊鹏 2023-3-17 17:06; AgeAnno ：人类衰老单细胞注释知识库衰老被定义为生物体功能特征的逐渐退化。衰老过程也是大多数人类疾病最广为人知的危险因素之一。目前，老龄化人口正以前所未有的速度增长，迫切需要启动详细的研究和制定健康老龄化的策略。大量证据表明，衰老伴随着复杂的分子和细胞改变，如细胞间通讯失调、表观遗 ...; 个人分类: 科普|489 次阅读|1 个评论热度 1

人工智能应用于临床肿瘤学: 张俊鹏 2023-3-15 10:19; 人工智能应用于临床肿瘤学在过去十年里，人们对人工智能 (AI) 在医学上的应用重新产生了兴趣。这是由深度学习算法的出现、计算硬件的进步以及正在生成和用于临床决策的指数级数据增长所驱动的。个性化护理的优势已得到证实，并且认识到肿瘤及其反应率在人与人之间存在巨大差异。在肿瘤学领域，就像其他医 ...; 个人分类: 科普|441 次阅读|没有评论

ChatGPT对临床和转化医学的潜在影响: 热度 1 张俊鹏 2023-3-13 07:20; ChatGPT 对临床和转化医学的潜在影响关于 ChatGPT 对临床和转化医学的潜在影响，本次看一下《 Clinical and Translational Medicine 》期刊的评述文章（图 1 ）。图 1 ChatGPT 对临床和转化医学的潜在影响评述聊天生成预训练转换器 (ChatGPT) 是由 Open AI 开发的用 ...; 个人分类: 科普|499 次阅读|4 个评论热度 1

癌症分子亚型的现状及临床应用趋势: 张俊鹏 2023-3-10 07:15; 癌症分子亚型的现状及临床应用趋势癌症是一大类遗传疾病，目前主要按其起源部位分类，如脑癌、乳腺癌和肺癌。然而，并非所有器官的癌症都是相同的，癌症之间和癌症内部存在遗传异质性。造成这种异质性的一个主要原因是基因组的不稳定性，它可以在单核苷酸水平上起作用，或者在更大的尺度上起作用。这对目前 ...; 个人分类: 科普|468 次阅读|没有评论

利用药物转录组图谱探索中药药理活性成分平台：ITCM: 热度 1 张俊鹏 2023-3-8 21:27; 利用药物转录组图谱探索中药药理活性成分平台： ITCM 中医被认为是药物发现的丰富来源，在预防和治疗各种疾病，如免疫系统疾病、心血管疾病、癌症和 COVID-19 等极其复杂的疾病方面表现出极好的潜力。许多中药衍生药物在治疗疾病方面效果显著，如青蒿素、葛根素、伊草素等。 2015 年，一种以青蒿素为 ...; 个人分类: 科普|692 次阅读|2 个评论热度 1

免疫信号通路关联的调控子数据库：ImmReg: 张俊鹏 2023-3-6 15:10; 免疫信号通路关联的调控子数据库： ImmReg 免疫系统失调已被发现是癌症发展的主要原因。免疫治疗已经成为一种有前途的癌症治疗策略。免疫相关基因表达失调的基础知识对于产生强大的免疫至关重要，并为癌症免疫治疗提供了新的见解。许多机制有助于基因表达调控，并确保转录对外部信号的响应。通过定量和计算分析， ...; 个人分类: 科普|539 次阅读|没有评论

定向分化的转录因子图谱: 张俊鹏 2023-3-3 09:54; 定向分化的转录因子图谱全面了解基因调控网络 (GRN) 控制细胞状态是分子生物学的基本目标。转录因子 (Transcription factor ， TF) 结合到基因组中的特定序列，以改变基因表达和指定细胞状态。单个 TF 的过表达可以导致细胞命运的深刻变化。例如，单个 TF 已被证明可以引导多功能干细胞向许多不 ...; 个人分类: 科普|611 次阅读|没有评论

值得关注的宝藏数据库：CNCB-NGDC: 张俊鹏 2023-3-1 09:30; 值得关注的宝藏数据库： CNCB-NGDC 国家基因组学数据中心 (NGDC) 是中国国家生物信息中心 (CNCB) 的一部分，为全球学术界和工业界提供一系列数据库资源。随着多组学数据以前所未有的速度爆发式积累， CNCB-NGDC （图 1 ）通过大数据归档、整合分析和增值策展，不断扩展和更新核心数据库资源。在 ...; 个人分类: 科普|445 次阅读|没有评论

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