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QTL作图

热度 1 2010-10-13 20:52

这台电脑里没有我的资料，正好我凭自己的感觉写点东西。说说QTL作图。QTL作图有3个要素。作图群体，基因型，表型。其实就这么简单。作图群体有：F2、DH、RIL等（这里列举的是基于两个亲本的分离群体的QTL作图，当然作图群体也可以是关联作图群体，用关联作图方法同样可以检测QT ...

个人分类: 未分类|8328 次阅读|1 个评论 热度 1

水稻基因组学综述

热度 2 2010-10-9 21:05

Rice genomics moves ahead Rice genomics moves ahead 。2010年的，里面涉及到水稻基因组及相关的许多方面。是一位朋友主动发给我的，她说人家找她下，后来又不要了。为了不浪费劳动成果，把文章发给我。为了进一步放大成果，我把它放这里，可能会有更多朋 ...

个人分类: 未分类|3607 次阅读|2 个评论 热度 2

扩增侧翼序列的新方法

2010-10-8 20:59

今天和朋友交谈说道侧翼序列扩增的事，我说最近看到一篇扩增侧翼序列的新方法。就是这篇了Restriction Site Extension PCR: A Novel Method for High Throughput Characterization of Tagged DNA Fragments and Genome Walking High Throughput Characterization of Tagged DNA ...

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T-DNA插入系的易位效应

2010-10-7 20:48

T-DNA插入突变，是一种常用的大规模的产生突变体的方法。其基本原理是：T-DNA插入到功能基因，产生功能失活突变。但T-DNA的插入可能还会有其它效应，如这篇文章报道的：Chromosomal Translocations are a Common Phenomenon in Arabidopsis thaliana T-DNA Insertion Lines。 Chr ...

个人分类: 未分类|8221 次阅读|没有评论

水稻QTL精细定位

2010-10-6 23:34

这篇也将是一篇不断更新的博文,关注QTL精细定位. 1 Fine mapping of Sta1 , a quantitative trait locus determining stele transversal area, on rice chromosome 9(得到全文再上传,有空再把一些旧资料补上) 2.Bai X, Luo L, Yan W, Kovi Mallikarjuna R, Zhan W, ...

个人分类: QTL精细定位|8465 次阅读|1 个评论

水稻抽穗期控制基因研究

2010-10-6 23:21

Regulation of flowering in rice:twoflorigengenes,acomplex gene network,andnaturalvariation Regulation of flowering in rice 。这里面的遗传控制图应该是最新的，有新的水稻抽穗期基因出来可以添到图中，如果正在克隆，应该在里面找到相应的位置。 还有篇08年的综述Florigen and the Photoperiodic Control of ...

个人分类: flowering|9593 次阅读|1 个评论

基于高通量测序的基因功能研究方法

2010-9-30 00:23

高通量测序当然是革命性的技术，而且成本在不断降低，总有一天能降到能够接受的程度，所以我非常关注高通量测序方法的应用，目前的先驱性研究可能会成为今后的主流技术手段。 综述文章Utilization of next-generation sequencing platforms in pl ...

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QTL精细定位的两种思路

2010-9-28 23:28

一：将QTL分解为单个孟德尔因子-----遗传背景简单化（单片段代换系） 二：利用大型或超大型分离群体获得足够多的统计学参数（NAM...） 例子Dissection of genetically complex traits with extremely large pools of yeast segregants Dissection of genetically ...

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重组自交系的高通量测序

2010-9-28 08:51

High-throughput genotyping by whole-genome resequencing High-throughput genotyping by whole-genome reseque 。用重组自交系来进行精细定位，放在几年前估计会让人笑话。精度不够。但当和全基因组重测序结合后结果就不一样了。这篇文章显示150个系的RIL群体有精 ...

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