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- 全基因组关联分析后的分析
- 全基因组关联分析后,会获得和性状相关的分子标记,可以在此基础上结合其它知识确定性状控制的侯选基因,并对侯选基因进行基因功能验证.这篇文章提供了一个范例 A Coastal Cline in Sodium Accumulation in Arabidopsis tha ...
- 复杂性状作图
- 这是篇最新综述综述 Towards identifying genes underlying ecologically relevant traits in Arabidopsis thaliana relevant traits 这篇文章可能是一篇新的经典综述,主要讨论拟南芥复杂性状(由多个QTL控制的性状)作图方法.这里面有两个比较好的表,一个表比较了不 ...
- 用多个RIL群体进行QTL作图
- QTL作图一般是利用一个作图群体,当然如果能同时利用多个群体更好.前面介绍的关联作图和连锁作图结合的方法,大都要用到多个RIL.这里提供这个主题的一些其它文章. 1 Six new recombinant inbred populations for the study of quantitative traits in Arabidopsis thaliana ...
- 520个水稻品种的全基因组数据
- 数据来源:Huang, X., X. Wei, et al. Genome-wide association studies of 14 agronomic traits in rice landraces. Nat Genet 42(11): 961-967.( http://www.nature.com/ng/journal/v42/n11/abs/ng.695.html?lang=en ) GenBANK序列号:ERP000106,ERP000235,ERP000236.这个序列号是NCBI ...
- 用高通量测序的方法鉴定转座子插入位点
- Use of Illumina sequencing to identify transposon insertions underlying mutant phenotypes in high-copy Mutator lines of maize identify transposon Transpositional landscape of rice genome revealed by Paired-End Mapping of highthroughput resequencing data. Transpositional landscape of rice ...
- 关联作图和连锁作图的结合
- 既然关联作图和连锁作图是两种互补的方法，将这两种方法结合起来进行可能效果更好，能充分利用两者的优点。前面有篇博文已经涉及到这方面的内容（ http://www.sciencenet.cn/m/user_content.aspx?id=367592 ）。任何作图都需要作图群体，NAM和MAGIC是可以同时利用两种方法进行作图 ...
- 水稻全基因组关联作图时代到来了
- 这篇文章宣告了一个新时代的到来 Genome-wide association studies of 14 agronomic traits in rice landraces，Nature Genetics,2010,Vol 42 , 961967 (全文有点大，上传受到限制)。这是我期待已久的一篇文章。所谓一个时代的到来，也不是我说了能算了，我太小 ...
- 水稻基因命名系统
- Gene Nomenclature System for Rice，Rice (2008) 1:72–84 Gene Nomenclature 该文的翻译版 水稻基因命名法系统.pdf 这种翻译,我比较赞赏. 但如果有一天,中国的研究人员,在中国作出了世界1流的研究,还要用这种方式来让更多的中国研究人员来了解其价值 ...
- 基因的表观遗传学修饰
- Virus-mediated efficient induction of epigenetic modifications of endogenous genes with phenotypic changes in plants 这是个比较有意思的技术。
- 分子育种
- 分子育种，好象说得比较热，但离真正的分子育种还任重道远。真正的分子育种至少应该是这样的水平：可以根据育种目标，直接给出一个品种应该有的基因型。当然，现在的水平离这还太遥远太遥远。真实的情况是，一个没有任何分子生物学背景的育种家，可能育成在生产中大面积推广 ...
