根据问卷调查结果，高校科技期刊在管理方面尚存在不少问题：

    一是在编辑部建设方面，办公用房普遍有所改善，军队期刊好于教育部与地方院校期刊，地方院校期刊好于教育部主管的期刊；

    二是在管理机制方面，59.55％期刊直属主管校长，50.91％期刊按系处级建制，75.91％期刊为编辑部管理模式，但也出现了12.73％的期刊开始以杂志社、期刊中心模式整合校内期刊资源，向“小集团化”方向发展的趋势，91.82％的期刊建有编委会，70.45％期刊采取主编兼职、副主编和编辑部主任专职的管理机制；

    三是在编辑人力资源管理方面，平均每刊有4.44名专职编辑和1.21名兼职编辑，学历结构中博士达到8.80％，硕士达到27.84％，本科学历达到45.56％，本科以上达到84.34％，整体地向高学历发展；

    四是在编辑按教学科研人员待遇方面，不从事教学的编辑部居多，达到53.18％，从事科研者居多，达到54.55％，从事科研已成为在岗提高编辑素质进而提高期刊质量的重要举措，但编辑按教学科研人员待遇仍然普遍地未获落实，落实者仅占28.64％，多按教辅人员对待，认为编辑待遇较差和低于教师者占55％；

    五是招收研究生的编辑部虽然数量很少，仅占7.27％，但它反映了通过正规学历教育培养新一代编辑的新诉求，是以编、教、研一体化为目标建设新型编辑部的重要标志；

    六是在编辑科研成果方面，据粗略统计，改革开放以来，高校期刊编辑发表有关编辑学论著至少在2万篇以上，有数种成果获得国家或省部级奖励，而且开始有国家、省部、厅局、学校等多层次、多元化在研基金资助项目，中国高校自然科学学报研究会科技期刊学基金也发挥了积极作用，完成了一批优秀的编辑学、科技期刊学研究成果，有数家编辑部成立了新闻出版、编辑出版、传播学等研究所、室、中心，制度化建设亦取得可喜进展；

    七是在编辑出版业务管理方面，84.55％得期刊自由投稿比例占到50％至100％，主动组稿比例偏低，而且越是教育部、“985”、“211”院校期刊的自由投稿比例更大，出版周期也相对较长，平均退稿率为44.67％，70％以上的期刊为拨款加版面费经营模式，教育部“985”、“211”院校期刊收取的版面费已占到支出总额的30至50％（20％的期刊占到总额的50％）；八是编辑部管理中的服务意识、诚信意识不够，因为稿源充足，需方市场旺盛，处于绝对强势，故养成编辑作者意识、读者意识淡漠，抽样访谈中有丢失稿件、因无记录和丢失审稿意见而将一篇稿件寄送一人重复审稿3次、长达一年半不答复、单方制订无基金稿不收、硕士和讲师以下学历和职称者不收、无硕士以上授权点的稿件不收等“霸王”条款。

    高校科技期刊在主管部门、主办部门和编辑部各层面的制度化建设程度较低,特别在主管部门层面的制度化建设较低，影响高校科技期刊整体结构失调或不知所措。在主办部门、编辑部层面的制度化建设不足，造成由于主要分管者、主要负责人或编辑骨干的去留、更替，而直接影响期刊质量和造成影响力下降。