综合性自然科学学报在高校科技期刊系列中占有很大比重，几乎每校都有这样一份综合性学报，已形成一种独特的期刊类型。这种模式源自19世纪末20世纪初的文理综合性大学学报，20世纪中叶演化为综合性自然科学学报和综合性社会科学学报两种版本。上海圣约翰大学前身圣约翰书院于清光绪十五年（1889年）创办的《约翰声》，为迄今所知我国最早的文理综合性大学学报。创刊于1915年的《清华学报》与其后1919年创刊的《北京大学月刊》一起，奠定了20世纪初期中国文理综合性大学学报这一期刊类型的基本模式。《清华学报》亦为中国历史上最早使用中、英文两种版本出版的文理综合性学报，是最早在刊名上缀以“学报”二字，并以学校名义出版的学术期刊。这种文理融通的模式甚至成为蔡元培执掌北京大学时期的象征之一。

     这种模式后来演化为文科的文、史、哲、经、法、社综合，以及理科的数、理、化、天、地、生综合，与其主办者综合性大学的学科布局显示出高度的一致性，也与科学发展既表现为综合又表现为学科细化的趋势相一致。即便是专科学校，也是专于某科的综合。

    1998年教育部《高等学校学报管理办法》涉及“大学学报”一词时，已将这种模式定义为：“大学学报是反映本校教学、科研成果为主的综合性学术刊物”。这种模式为中国高校形成教学、科研两大职能、为培育大量文理融通的复合型人才，做出了巨大贡献。与我国相似的英国剑桥大学出版社和牛津大学出版社各出版有100余种学术期刊，多为综合性学术期刊。全英各大学出版的学术期刊占全英学术期刊的60％以上。英国的Nature,美国的Science其实也是这种模式。俄罗斯、日本的大学也有这种期刊类型。

      然而，这种综合性模式运行100多年来，被过度地“拷贝”和沿袭，甚至在本世纪初又突然倒退回历史，在高职、高专与新办院校出现了七八百种文理综合性高校学报。这与近年来的高校办学特色化、与专业性期刊在发行量上的差距、与读者市场的细分等趋势形成尖锐冲突。这方面包括《中国科学》也按学科分为A，B，C，D辑出版。英国的Nature最近也按来稿多寡和专业方向分出11种专辑。于是，近年来高校提出了“推倒校园围墙，面向社会整合相关学科”，“突出某些优势学科，走特色化办刊之路”的举措。

    《清华大学学报》（自然科学版）月刊自1985年开始，逐渐形成：3，6，9，12期为理、核能、土木、水利、环境等小综合；1，4，7，10期为电机与信息科学（含计算机、自控等）；2，5，8，11期为机械（含精仪、热能、力学、航空航天），余按学校主要学科分出“准专辑”。2003年，《北京大学学报》（医学版）出版过一辑“非典”专辑；《北京科技大学学报》依托原校学科优势，在钢铁企业优化等方面形成特色；《西北大学学报》（自然科学版）依托国家西部大开发重点支持院校和教育部惟一“西部大开发研究中心”的优势，在西北自然资源开发方面形成特色；《长安大学学报》（自然科学版）依托原亚洲惟一“公路学院”的合校主体，在公路工程及运输方面形成特色。

      通过按优势学科或专业分辑出版，以及依托本校地缘优势、学科或专业优势，加大优势学科稿件比重、强化作者、读者意识特别是强化阅读市场意识，培育新的作者群和读者群、走准专业化和特色化的办刊思路，代表着综合性自然科学学报这种模式的进化，应该被肯定。