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【综述论文】发展肿瘤网络模型的准则与策略

已有 2708 次阅读 2014-3-31 16:28 |系统分类:论文交流| 大数据, 肿瘤, 网络模型

Dana Pe'er and Nir Hacohen. Principles and strategies for developing network models in cancer. Cell 2011, 144: 864-872.


准则1:分子间相互影响产生数据中的统计相关性(Molecular influences generate statistical relations in data)

准则2:网络不是一成不变的:上下文相关与动态性(Networks are not fixed: the role of context and dynamics)

准则3:找到“差异”网络(Extracting "differential" networks)


策略1:发现遗传位点和体突变(Discovery of inherited alleles and somatic mutations)

策略2:用RNAi发现网络关键部分(Discovering key network components using RNAi)

策略3:统计识别异常调控的基因及其调控因子(Statistical identification of dysregulated genes and their regulators)

策略4:整合基因型和基因表达数据为因果模型(Integrating genotype and gene expression into causal models)

策略5:整合单细胞数据来解决细胞间的遗传异质性(Integration of single cell data to account for cell-cell heterogeneity)

策略6:用扰动来发现网络重构(Using perturbations to reveal network wiring)


未来前景:个性化肿瘤医疗(Personalized cancer medicine)



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