科学网—PTMBio的博文

装机进行中！景杰生物引进ThermoFisher最新质谱仪Exploris 480

卜晨 2020-3-16 09:02

景杰生物一直致力于打造最专业的蛋白质组学平台，而先进的仪器设备是该平台的重要基础。继2019年引进Bruker系列最新质谱仪 timsTOF Pro之后，最新的ThermoFisher系列 Exploris 480质谱仪无疑将为景杰生物再添利器，并形成优势互补，共同构筑蛋白质组学领域最全面、性能最高的质谱仪集群。加之景杰生物在蛋白质组特别是修 ...

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新方法新突破！Nat Commun：基于directDIA的位点特异性高深度磷酸化修饰组学

卜晨 2020-3-16 09:01

蛋白质磷酸化是生物体中较常见的一种蛋白质翻译后修饰方式，它可以通过激发、调节诸多信号通路进而参与调控生物体生长、发育、逆境应激、疾病发生等多种生命过程，所以磷酸化一直是生物学研究的重点与热点。但是基于DDA分析的定量磷酸化蛋白质组学正面临着检测通量和定量稳定性等方面的突破。虽然DIA技术的发展，提供了 ...

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Science Advances | 高深度巴豆酰化组学分析揭示其在DNA损伤修复中的重要作用

卜晨 2020-3-16 08:59

近年来，蛋白质翻译后修饰的研究走上了快车道，各类突破性成果不断涌现。而在这个车道上，巴豆酰化修饰可谓是一匹“黑马”。2011年，芝加哥大学赵英明教授课题组在 Cell 杂志上首次报道了巴豆酰化修饰的发现。由于其重要意义，该项工作更是被评为 Cell 的“ 年度五大突破性进展 ”之一。随后的研究中，其在生殖发育、 ...

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利刃出鞘！Urine proteomics，生物标志物筛选新利器

卜晨 2020-3-6 17:04

生物标志物（Biomarker）是指可供客观测定和评价的一个生理病理或治疗过程中的某种特征性的生化指标，通过对它的测定可以对同一种疾病不同状态进行精确分型，跟踪疾病发展、诊治的进程，最终实现对于疾病和特定患者进行个性化精准治疗的目的。图1. 生物标志物筛选的重要意义蛋白生物标志物有助于疾病的早期诊断、 ...

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Nat Commun：蛋白组学揭示人巨细胞病毒感染过程中蛋白复合物的全景变化

卜晨 2020-3-6 17:03

人巨细胞病毒（HCMV）又称为人疱疹病毒 5 型（HHV-5），其感染率在我国高达 86%～96%。HCMV 是弱致病因子，绝大多数表现为无症状性感染；但在生理性免疫低下的胎儿和新生儿中，HCMV会引发发育性免疫缺陷和疾病，同时也会增加艾滋病和器官、骨髓移植患者等病理性免疫低下人群的病死率。近日，来自普林斯顿大学分子生物 ...

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世界野生动植物保护日 | 古蛋白质组学书写已灭绝生物的“墓志铭”

卜晨 2020-3-6 17:02

3月3日是第七个“ 世界野生动植物保护日 ”，今年全球的主题是“ 维护地球上所有的生命（Sustaining all life on earth）”，我国的主题是“ 维护全球生命共同体 ”。尤其是在疫情暴发的背景下，如何更好地与大自然其他生命和谐相处，引发了人们更多的思考。随着全球经济发展和城市化的进程，自然环境，包括一些原始 ...

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The Plant Journal连发两文，揭示植物缺水逆境胁迫/铁-硫代谢新机制

卜晨 2020-2-28 16:11

近日，植物学领域专业期刊 The Plant Journal 发表题为Expression of a dominant-negative AtNEET-H89C protein disrupts iron-sulfur metabolism and iron homeostasis in Arabidopsis的论文。美国密苏里大学Ron Mittler团队基于timsTOF Pro质谱仪的4D蛋白质组学以及靶向蛋白质组学，结合转录组学分析，对拟南芥中AtNEET ...

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Mol Cell：新研究揭示组蛋白巴豆酰化/乙酰化修饰拮抗调控代谢稳态与基因表达

卜晨 2020-2-28 16:10

为了确保高效的生长和生存，细胞必须感知到多样化的营养环境，并相应地迅速调整它们的代谢状态。实现这一目标的方式之一是使基因表达与代谢环境同步。组蛋白修饰为此提供了一种理想的机制，因为组蛋白修饰的变化是快速可逆的，并且依赖于代谢中间产物作为修饰的辅助因子。了解代谢环境、染色质和基因表达之间的关系 ...

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Nat Commun: SUMO化修饰组学揭示PIAS1新底物蛋白及调控细胞迁移机制

卜晨 2020-2-28 16:09

SUMO化修饰是一种普遍存在、动态可逆的蛋白翻译后修饰类型，虽然修饰过程与泛素化过程很相似，又称为“小泛素化”，但是SUMO化修饰具有与泛素化修饰截然不同的功能。泛素化修饰的靶分子主要被蛋白酶体降解，而 SUMO化修饰介导靶分子定位与功能调节。 SUMO化循环过程与泛素化循环过程相似，包括活化、结合、连接、修饰和 ...

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识微见远，脑脊液蛋白质组学揭示软脑膜黑色素瘤转移及治疗耐药性的分子特征

卜晨 2020-2-17 16:53

肿瘤细胞转移进入颅内结构和脑脊液是晚期黑色素瘤最严重的并发症之一。多达5-7%的黑色素瘤患者会出现软脑膜黑色素瘤转移，这些患者的预后很差，通常平均存活8-10周。当前对于软脑膜黑色素瘤转移（Leptomeningeal Melanoma Metastases，LMM）患者的脑脊液（cerebrospinal fluid，CSF）环境几乎一无所知，难以制定有效的治 ...

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