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LC-MS/MS| 蛋白质谱| 蛋白质组学| 蛋白修饰| 蛋白质组学生信软件| DIA|
【工具篇之四】Scaffold 软件中Protein View功能崭露头角
崔蕴博 2019-4-23 20:17
蛋白视图 此视图窗一共3个不同的相关联窗格构成，包括选取感兴趣蛋白窗口、人工截取谱图窗口和鉴定肽段、以及查看蛋白覆盖率和其他的质谱实验相关参数等。如图1所示 不同的窗口大致如下： 蛋白窗口，它提供了两个相互不同的定位目标蛋白和显示所选择蛋白特性的窗口。 ...
个人分类: 蛋白质组学生信软件|3636 次阅读|没有评论
【工具篇之三】Scaffold 软件中Sample View功能小试牛刀
崔蕴博 2019-4-16 21:40
样本视窗（S ample View） 样本视窗主要包括下面4个主要功能： 样本蛋白表格，蛋白鉴定实验结果的全局展示 过滤样本功能，可以通过一些方法增加或者减少表格中蛋白展示数目 展示窗口，提供选项可大致分析表达差异，或者根据不同修饰进行筛选过滤 信息窗口，展示GO或者样本详细信息。   ...
个人分类: 蛋白质组学生信软件|2887 次阅读|没有评论
【工具篇之二】Scaffold 4软件界面初相识
崔蕴博 2019-4-6 19:16
Scaffold设计目的是旨在帮助科学家们找到他们生物样本中的蛋白，通过利用当前搜库软件导出的文件，例如：SEQUEST®, Mascot®, MaxQuant, X! Tandem和PD等，并对这些文件进行阐释，使科学家们更容易更快捷的从大数据中获取想要的信息，比较样本之间的差异以及搜索蛋白修饰。使找寻数据更加容易，可找到部分 ...
个人分类: 蛋白质组学生信软件|4830 次阅读|没有评论

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