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画泡泡图,发CNS
王程扬 2018-3-28 14:49
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 小伙伴们看了《 把Cell爆文的思路、方法用到自己的研究中 》都想知道: 找到关键转录因子的这个图是怎么画的? Figure S5 . Motif Dynamics, Related to Figure ...
个人分类: 生物paper|3971 次阅读|没有评论
我画的图只能发Plos One?Genome Research的图长啥样?
王程扬 2018-3-28 14:43
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 小哈组会因heatmap受挫,老板说:“有些图一看就只能发PLOS ONE,多学学Genome Research的配色。” 那就看看Genome Research的配色方案。检索策略:在Genome Research网站https:/ ...
个人分类: 转录调控|4816 次阅读|没有评论
等我有钱了,我也这样研究一个基因
王程扬 2018-3-22 16:37
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丸子和小丫 来源: 嘉因 大家好,我是让每一位实验猫都能享用生信福利的嘉因小丫,以及她的朋友们。 读paper时,我们总要问:有什么思路和方法,能用到我的课题里? 好多 ...
个人分类: 转录调控|4333 次阅读|没有评论
你的miRNA-seq数据要重新分析吗?
王程扬 2018-3-22 16:01
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 看过《 我研究的miRNA没,没,没了 》的小伙伴儿心里发慌: miRBase 22跟21相比,删掉了52个人类miRNA,新增了156个,13个改名了,21个序列还变了。那我的miRNA-seq数据岂 ...
个人分类: RNA-seq|3426 次阅读|没有评论
我研究的miRNA没,没,没了
王程扬 2018-3-22 15:51
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 希望标题的情况不要发生在小伙伴儿身上。。。不过,miRNA的名字、序列可能变了,heatmap可能要重新画了,投稿时你好意思用v21版本吗?! 话说沉寂了3年多的miRBase, ...
个人分类: RNA-seq|2234 次阅读|没有评论
以生物学家的方式纪念霍金
王程扬 2018-3-15 10:53
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 物理学家史蒂芬·霍金去世,享年76岁 � � 21岁时,霍金患上肌肉萎缩性侧索硬化症(卢伽雷氏症,ALS) 2014年,霍金参加冰桶挑战; ...
个人分类: 表观遗传|2089 次阅读|没有评论
用别人的数据发自己的Science | 给你的文章加5分
王程扬 2018-3-7 09:55
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫来源: 嘉因 文中有【彩蛋】脑补2016年一篇Science paper作者的心路历程: MYC regulates the antitumor immune response through CD47 and PD-L1, Science , ...
个人分类: 生物paper|3210 次阅读|没有评论
哪个转录因子调控你的基因?Plan C,不需要那么多ChIP-seq
热度 1 王程扬 2018-2-23 10:49
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 《 哪个蛋白质调控我感兴趣的基因? 》一文讲了找上游转录因子的三种策略: Plan A: 基于大量ChIP-seq公共数据挖掘 Plan B: motif分析预测 Plan C:DNase ...
个人分类: 转录调控|8267 次阅读|1 个评论 热度 1
国自然有这个图,谁敢说缺创新点
热度 1 王程扬 2018-2-23 10:45
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 出自http://ipp.jaas.ac.cn/Article/UploadFiles/201109/2011092817254731.ppt 新理论(新方法)研究新/老问题,小丫擅长,至少四颗星。 找哪 ...
个人分类: 自然NIH|3948 次阅读|1 个评论 热度 1

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