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- 没有root权限且在Linux系统离线安装GCC 12 的详细过程
- 我们在做计算的过程中可能会遇到 GCC 版本过低的问题，如果使用的计算机系统没有 root 权限则有时候很难解决所遇到的找不到高版本 libstdc++.so.6 动态库的问题。这里笔者根据自己的经验总结了在没有 root 权限且没有网络连接时，离线安装 GCC 12 版本的详细过程，分享给大家并且方便自己查看。 1. 下载安装 ...
- MKL离线编译CP2K 7.1+Plumed的详细过程
- Plumed是CP2K的一个扩展包（其不只支持CP2K，还支持其他众多分子动力学软件），可以实现各种增强采样模拟及数据分析；包含的增强采样方法如Metadynamics、Umbrella sampling以及Basin hopping等。 为了在较老的超算系统上安装带Plumed扩展包的CP2K，笔者摸索了两三天。最终发现了一种可以在较老的系统上安装CP2K7.1+Plume ...
- Ubuntu18.04编译VASP.5.4.1两种方法的详细过程(修改版)
- 笔者曾在 2018-9-28 根据自己的经验总结了 VASP 在 Ubuntu 系统的安装方法，但是可能由于包含一些过时的信息而被屏蔽，这里笔者修改之后重新分享给需要的朋友并方便自己查看。 下面两种编译方法（ gfortran 及 MKL 分别编译 VASP ）均需要 VASP 源码包及其补丁，这些可以在官网或通过其他途径下载。 vasp.5.4.1.05Fe ...
- ASE 的安装及其与VASP 对接的方法
- ASE 的全称是 Atomic Simulation Environment ，是一款基于 python 程序语言的工具包合集。支持与很多 DFT 程序的对接（ Abinit, CP2K, NWChem, Gaussian, Vasp 等），具有强大的提交计算、可视化及分析计算结果的功能。这里主要介绍 ASE 的安装及其与 VASP 对接的方法。我们知道，提交 VASP 计算任务之前需要准备 POTCA ...
- CP2K, NWChem 等在个人工作站上的安装
- 目前为止，笔者接触 CP2K 将近一年了。个人能力有限，曾经几次尝试在集群上编译 CP2K 均以失败告终。令人欣慰的是曾成功在 Ubuntu 16.04 上（单节点的工作站）编译 CP2K 5.1 ，实际上 Ubuntu 16.04 支持预编译的 CP2K 2.6.1 ，可以直接用命令： sudo apt install cp2k* 进行安装。令人开心的是今年 4 月份 Ubun ...
- GAMESS在服务器上的编译
- 本文是笔者亲测可用的编译过程，服务器的系统为 Centos6 。类似的方法也可以用于 gamess 在 Ubuntu 等系统上的编译。 1. 前期准备 1.1 获取安装包 在 Gamess 的官网获取授权，并在以下网址选择注册并选择合适的版本下载： http://www.msg.chem.iastate.edu/GAMESS/download/register/ ，一般较短一段时间内 ...
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