2021年(2): D3DistalMutation——远端突变显著影响酶的活性 2021-06-30

酶是一种非常重要的生物催化剂。在生物体中，酶能够加速化学反应并参与几乎所有的新陈代谢过程；在工业上，酶在催化抗生素合成和降解污染物方面发挥着不可或缺 ...

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2021(1): 上海药物所开发基于配体的抗新冠肺炎药物靶标预测和虚拟筛选平台 2021-01-27

上海药物所开发基于配体的抗新冠肺炎药物靶标预测和虚拟筛选平台   2003 年的非典（ SARS ）、 2012 年的中东呼吸综合征（ MERS ）和 ...

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JCIM创刊60周年纪念虚拟专辑之MM/GBSA 2021-01-22

JCIM 创刊 60 周年纪念虚拟专辑之 MM/GBSA   徐志建 JCIM 青年编委 中国科学院上海药物研究所   Journal of Chemical ...

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JCIM创刊60周年纪念虚拟专辑之admetSAR 2021-01-21

JCIM 创刊 60 周年纪念虚拟专辑之 admetSAR 徐志建     JCIM 青年编委      中国科学院上海药 ...

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JCIM 60周年纪念刊 2021-01-19

我们遴选了在药物设计和化学信息学领域最有影响力的10篇论文，从化学信息学中广泛使用的SMILES到分子对接必用的ZINC数据库。更令人高兴的是，其中有华东理工大 ...

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2020年(5): 基于能量和结构的二维增强采样方法ossPTMetaD的发展与应用 2021-01-04

蛋白质的功能发挥与其构象变化密切相关。因此，研究靶标蛋白的动态行为对理解其生物学功能以及药物发现与设计至关重要。分子动力学（ MD ）模拟能够从原子水 ...

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2020年(4): 三氟甲基取代对化合物活性的影响 2020-12-30

随着含氟药物研究的发展，在药物分子中引入三氟甲基（ –CF 3 ）已经引起研究者们越来越多的关注。由于 –CF 3 具有强吸电子性、亲脂性和稳定的 C ...

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2020年(3): 新冠病毒刺突蛋白与宿主ACE2受体亲和力计算研究获进展 2020-12-17

席卷全球的新冠病毒肺炎（COVID-19）是由SARS-CoV-2病毒引起的。新冠病毒的刺突蛋白位于病毒表面，介导病毒与宿主细胞ACE2受体的结合，从而帮助病毒入侵和感染 ...

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