[转载]简单使用DESeq2/EdgeR做差异分析 2019-08-20

参考自 http://www.bioinfo-scrounger.com/archives/113   简单使用DESeq2/EdgeR做差异分析           DE ...

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maftools 找不到对象\'Variant_Classification\' 2019-06-12

> require(maftools) 载入需要的程辑包：maftools Registered S3 methods overwritten by 'ggplot2':   method     & ...

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Docker的ubuntu镜像安装的容器无ifconfig和ping命令的解决 2019-04-01

Docker的Ubuntu镜像安装的容器无ifconfig命令和ping命令 解决： apt-get update（这一步必须） sudo apt-get install net-tools     ...

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安装Ubuntu 18.04.2 LTS流程 2019-04-01

1. 下载Ubuntu 18.04.2 LTS from https://www.ubuntu.com/download/server ;   2. 下载Rufus 制作启动盘。注意：usb installer不可行; 3. 制作启动盘 参 ...

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全外显子组生信分析流程-14-annovar_to_maftools 2019-03-27

#!/usr/bin/bash purpuse: combine annovar results and convert it to MAFtools format #combination i ...

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全外显子组生信分析流程-13-table_annovar 2019-03-25

#purpose: re-annotate VCF with table_annovar.pl  perl annotate_variation.pl -buildver hg19 -downdb&nb ...

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全外显子组生信分析流程-12-Control-Freec 2019-03-23

#!/usr/bin/bash #Control-Freec 既可以检测拷贝数变异CNV，还可以分析杂合性缺失LOH。官网如下 #http://boevalab.com/FREEC/ #https://www.jianshu. ...

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全外显子组生信分析流程-11-Mutect2 2019-03-23

#!/usr/bin/bash #purpose: identify SNV and InDels from paired tumor and normal samples #set&nbs ...

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