如何获取任何基因/所有基因的promoter区序列信息？

熊朝亮 2021-4-29 23:48

获取任何基因/所有基因的promoter区序列信息，请见： https://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath/hg38/bigZips/ 其中，包括： upstream1000.fa.gz upstream2000.fa.gz upstream5000.fa.gz 具体选用1-kb, 2-kb 或 5-kb promoter regions，根据自己的需求予以选择！ 如果查找单个基因的promoter区，请见博文： ...

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DriverDBv2---人类肿瘤driver基因数据库

熊朝亮 2015-12-8 18:59

DriverDBv2: a database for human cancer driver gene research. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26635391

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基因组变异注释工具

热度 1 熊朝亮 2015-9-4 16:45

Genomic variants annotating softwares: (1).ANNOVAR(Annotate Variation); http://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/ (2).SnpEff(SNP effect); http://snpeff.sourceforge.net/ (3).VAAST(Variant Annotation,and Analysis and Search ...

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