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RNA技术在疫苗领域获得大的重视,最近在遗传病治疗方面也获得突破。和基因编辑不同,RNA编辑更简单更安全,在改变细胞基因表达环境方面有更大优势。随着这种技术在临床上的应用,可能对药物研发和疾病治疗带来重大影响。
两种针对遗传疾病的RNA编辑疗法最近获得了临床试验的批准,这为更安全的治疗带来了希望。
Move over, CRISPR: RNA-editing therapies pick up steam (nature.com)
RNA编辑正在获得动力。经过数十年对如何操纵这种复杂分子的基础研究,至少有三种基于RNA编辑的疗法已进入临床试验或获得批准。他们是第一个达到这一里程碑的人。
长期以来,RNA编辑的支持者一直认为,它可能是CRISPR等基因组编辑技术的更安全、更灵活的替代品,但它带来了大量的技术问题。
科学家说,人体试验的启动标志着该领域的日益成熟和接受。英国剑桥大学生物学家安德鲁·利弗(Andrew Lever)说:“人们对RNA技术有了更深入的了解,RNA疫苗和COVID大流行在一定程度上增强了这一点。“RNA现在被视为一种非常重要的治疗分子。
RNA在蛋白质合成中起着至关重要的作用:DNA中编码的遗传信息在被翻译成蛋白质之前被转录成信使RNA(mRNA)。RNA分子由称为核苷酸的构建块组成,每个核苷酸包含四个碱基或字母之一。
RNA编辑技术旨在通过改变RNA序列来补偿有害突变,从而合成正常蛋白质。RNA编辑还可以增加有益蛋白质的产生。
与CRISPR基因组编辑不同,RNA编辑不会改变基因。它也不会引入永久性变化,因为RNA分子是瞬时的。这意味着治疗效果的持续时间可以更短。
但这种短暂性可以提供安全优势。CRISPR疗法的一个风险是脱靶效应,或靶基因组区域之外的意外变化,马萨诸塞州伍兹霍尔海洋生物实验室的神经生物学家Joshua Rosenthal指出。“DNA中的脱靶效应可能非常危险。在RNA中,情况就不那么严重了,因为它会翻身。
一次一个字母
一种常见的RNA编辑方法,即单碱基编辑,利用了一种已经在细胞中发现的酶:作用于RNA的腺苷脱氨酶(ADAR)。这种酶将 RNA 序列中称为腺嘌呤的碱基交换为称为肌苷的碱基。
位于马萨诸塞州剑桥市的Wave Life Sciences正在探索单碱基编辑,以治疗一种称为α-1抗胰蛋白酶缺乏症(AATD)的遗传性疾病,这种疾病会损害肺部和肝脏。这种疾病会减少AAT的产生,AAT是一种在肝细胞中产生的蛋白质,可以保护肺部免受吸入污染空气或其他刺激物造成的损害。
Wave的产品是一条短链核苷酸,可指导天然存在的ADAR酶改变每个mRNA分子中的特定字母,以纠正影响AAT产生的突变。“通过使用细胞的内源性机制来编辑单个碱基,你现在可以制造出一种正常的蛋白质。我们已经证明,正常蛋白质可以高水平表达,“Wave总裁兼首席执行官Paul Bolno说。
Bolno说,在小鼠中,该药物编辑了肝细胞中约50%的靶mRNA,这足以产生治疗效果。
该公司去年12月在英国和澳大利亚开始了该药物的临床试验,并将评估该药物的安全性和其他功能。
编辑整个段落
另一种称为RNA外显子编辑的方法,可以一次改变RNA分子中的数千个遗传字母,而不是只改变一个字母。外显子编辑类似于编辑整个段落,而不是纠正一个错别字,Lever说。这项技术对于由一个人基因组中的多个突变引起的疾病尤为重要;他补充说,这种突变阵列很难通过单碱基变化来解决。
该技术靶向前 mRNA,前 mRNA 是从 DNA 转录的,然后加工成 mRNA。Pre-mRNA包括外显子(RNA转录本中含有制造蛋白质指令的部分)和内含子(不含此类指令)。通过一种称为RNA剪接的机制,内含子从前mRNA中被切除,外显子被缝合在一起形成最终的mRNA,并被翻译成蛋白质。
马萨诸塞州波士顿的Ascidian Therapeutics等公司正在利用RNA剪接过程去除含有突变的外显子,并用健康的外显子代替它们。上个月,Ascidian获得了美国食品和药物管理局(FDA)的批准,对外显子编辑器进行了临床试验,以治疗导致视力丧失的Stargardt病。患有这种疾病的人在单个基因中有几个突变,导致产生一种通常保护视网膜的有缺陷的蛋白质。
Ascidian的疗法依赖于一个工程化的DNA片段,该片段被输送到细胞中并产生正常的RNA外显子。它们在剪接过程中取代了突变的蛋白质,从而产生了功能性蛋白质。DNA 还产生促进外显子编辑的 RNA 序列。
“使用一个分子,[疗法]能够一次替换22个外显子,”生物学家Robert Bell说,他是Ascidian的研究负责人。
抗癌RNA
基于RNA的疗法的潜力不仅限于遗传疾病。Rznomics是一家位于韩国城南市的生物制药公司,正在测试一种RNA编辑器,用于治疗肝细胞癌,这是最常见的肝癌类型。2022 年 9 月,该公司在韩国开始了一项临床试验,并打算将其扩展到国际上。
Rznomics的方法涉及mRNA剪接,但与Ascidian的方法不同,它不使用细胞自身的剪接机制。取而代之的是,该公司选择了一种天然存在的核酶,这是一种可以在mRNA靶区诱导剪接的RNA分子。研究人员设计了核酶来切割肿瘤细胞中的mRNA并插入致命的货物:一种RNA序列,该序列被翻译成一种蛋白质,产生一种诱导细胞死亡的毒素。当周围的癌细胞与这些细胞接触时,毒素会扩散,从而促进它们的死亡。这种治疗分子取代了与肿瘤生长相关的RNA序列。
Lever说,使用剪接方法对抗不止一种疾病非常令人兴奋,他也是英国剑桥Spliceor的首席医疗官,该公司正在研究RNA剪接疗法。“它为原本无法治疗的疾病开辟了全新的治疗可能性。
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