碳酸盐岩中的孔隙按成因分为2种类型：原生孔隙、次生孔隙。
原生孔隙形成于沉积期前（如有孔虫、腹足的体腔孔等）和沉积期间（如粒间孔、生物格架孔等）。具体为：
1、粒间孔（图1-图4）：颗粒堆积时，由于颗粒相互支撑而构成颗粒之间的孔隙。
2、遮蔽孔（图4）：颗粒堆积时，由于较大颗粒（如介壳）的遮挡，在颗粒之下所保留的孔隙空间。
3、生物体腔孔（图5）：具骨骼体腔结构的生物死后，软体部分腐烂后留下的骨骼体腔空间。
4、生物格架孔（图6、7）：造礁生物（如珊瑚、海绵、层孔虫、苔藓虫、钙藻等）所形成的骨架间及骨架内孔隙。
5、鸟眼孔（图8、9）：未填充的鸟眼构造形成的孔隙。
6、窗孔和层状孔洞（图10、11）：菌藻类生物纹层间，由菌藻类生物腐烂或干化收缩所造成的孔隙。
图1 粒间孔
粒间孔分布于藻砂屑之间，其形态受颗粒外形制约；可见少量粒内溶孔。蓝色铸体薄片，单偏光
图2 粒间孔、粒间溶孔
粒间孔分布于藻砂屑之间，其形态受颗粒外形制约；局部可见粒间溶孔。蓝色铸体薄片，单偏光
图3 粒间孔
残余鲕粒仅保存了鲕粒形态幻影；粒间孔非常发育，分布于残余鲕粒之间，沿孔壁充填沥青。红色铸体薄片，单偏光
图4 粒间孔、粒间溶孔、粒内溶孔、遮蔽孔
粒间孔非常发育，分布于残余鲕粒之间；局部可见粒间溶孔和粒内溶孔、遮蔽孔；沿孔壁充填沥青。蓝色铸体薄片，单偏光
图5 生物体腔孔
在介形虫两瓣硬壳之间发育体腔孔，是介形虫死后软体部分腐烂留下的孔隙。蓝色铸体薄片，单偏光
图6 生物格架孔
绵层类蓝细菌原地生长堆积构筑而成叠层石礁体格架，在礁体格架中间孔隙较发育。蓝色铸体薄片，单偏光
图7 生物格架孔
主要是蠕虫管组成生物格架，其中未被充填部分发育生物格架孔；蠕虫管间为灰泥，另有部分溶蚀-沉淀的次生亮晶方解石。普通薄片，单偏光
图8 鸟眼孔
可见形似鸟眼、大小约为0.15~0.3mm、长轴多平行纹层排列的孔隙；仅少被亮晶白云石沿边缘充填。普通薄片，单偏光
图9 鸟眼孔
发育丰富的层状鸟眼孔，大小约为0.05~0.5mm，长轴多平行纹层排列。蓝色铸体薄片，单偏光
图10 窗孔和层状孔洞
发育丰富的层状孔洞，形似窗孔，大小约为0.1~1.5mm，长轴多平行纹层排列。蓝色铸体薄片，单偏光
图11 窗孔和层状孔洞
发育丰富的层状孔洞，形似窗孔，大小约为0.1~1mm，长轴多平行纹层排列。蓝色铸体薄片，单偏光
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