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您是否正在为生态环境数据的复杂性而头疼?面对一堆非正态分布、存在嵌套结构或多重共线性的数据,不知从何下手?传统的统计听不懂,R语言代码又总是报错?
R语言的丰富程序包生态系统和强大的社区支持,使其在处理复杂数据分析任务时表现出色。AI大语言模型在助力利用R语言开展数据统计分析方面有着令人遐想的广阔空间。然而,生态环境领域数据往往具有高度的复杂性和异质性,这要求分析者不仅要有扎实的统计学基础,还需要能够灵活运用各种统计模型和方法。GPT在这方面展现出巨大的潜力,它不仅能够帮助研究者理解和选择合适的统计模型,还能在数据分析过程中提供实时的指导和建议,极大地提高了研究效率。
本次内容涵盖了从生态环境领域数据特点及统计方法介绍、GPT入门到辅助R语言基础;数据准备及ggplot 绘图基础;回归和混合效应模型(包含方差分析、协方差分析);多元统计分析(排序、聚类和分组差异检验);随机森林模型;结构方程模型;非线性关系数据分析; Meta分析及贝叶斯回归与混合效应模型等一系列专题及实战案例。
第一单元 生态环境数据统计概述及基础
1.1 生态环境数据特点及统计方法介绍
1.生态环境数据复杂性和多样性
2.生态环境数据类型及分布特点
3.生态环境数据主要统计分析方法及统计检验(t-检验、F检验、卡方检验)
4.如何根据数据类型、特点及结构选择合适的统计方法
1.2 GPT与R语言结合开展数据分析优势
1.3 R语言入门
1.安装与配置R和RStudio
2.R语言程序包和函数用途和用法
3.R中变量、数据类型、函数等
4.R语言数据基本操作
1.4 生态环境数据准备及绘图基础
1.生态环境数据类型及常见数据资源
2.生态环境数据整理及清洗
3.生态环境数据探索
4.ggplot2绘图
1) 基础绘图类型:散点图、箱线图、频率图、提琴图、峰峦图、相关图等2) 高级绘图技巧: 多图组合、排版及生成高质量图
第二单元 回归与混合效应模型
2.1 一般和广义线性回归模型(lm&glm)
1.一般线性模型和广义线性模型介绍:基本原理、假设条件及应用情景等
2.一般线性模型(lm)R语言实现
1)回归模型2)方差分析3)协方差分析4)模型诊断5)模型选择(逐步回归)
3.广义线性模型(glm)R语言实现
1)广义回归模型、链接函数、分布族、模型比较2)逻辑斯蒂回归(0,1数据) 3)泊松回归(计数数据):泊松、负二项分布、零膨胀、零截断
2.2 线性和广义线性混合效应模型(lmm&glmm)
1.混合效应模型简介:嵌套数据、固定效应、随机效应等基本概念
2.线性混合效应模型(lmm)
1)模型构建:模型类型确定(随机截距/随机截距)、模型比较和诊断2)模型结果解读、描述及作图
3.广义线性混合效应模型(glmm)
1)根据数据特征选择合适的广义线性混合模型误差分布及程序包 2) 二项分布(0,1)混合效应模型:数据检查、模型构建、结果展示 3)计数数据混合效应模型:泊松、过度离散、零膨胀及零截断
4.混合效应模型的模型选择(模型average)
2.3 相关数据分析:空间、时间及系统发育相关
第三单元 多元统计分析
3.1 多元统计分析技术在生态环境数据分析应用简介
1)非约束排序(PCA、PCoA、NMDS)分析:模型选择、结果解读及绘图2)约束排序(RDA、db-RDA)分析:数据筛选、变量选择、结果解读及绘图
3.2 多元统计中的聚类分析及分组差异检验
1.多元统计中的聚类分析
1)层次聚类(hclust):数据检查、聚类聚类质量评估、结果解读及绘图2)非层次聚类(kmeans):数据检查、聚类聚类质量评估、结果解读及绘图
2.多元统计中的分组差异检验
1)非参数多元方差分析(PERMANOVA)分析 2)非参数多元方差分析(PERMANOVA)与非约束排序(PCoA)结合
3.3 多元统计中机器学习:随机森林(Random Forest,RF)模型
第四单元 结构方程模型(SEM)(lavaan)
1.结构方程模型(SEM)基本原理
2.结构方程模型(lavaan)分析
1) 初始模型构建2) 模型调整3) 模型评估及结果表达
3.潜变量(latent)分析
4.复合变量(composite)分析
第五单元 其他统计模型或方法
5.1 非线性数据分析
1.非线性数据分析简介:广义可加模型 VS 非线性模型
2.广义可加模型(GAM)案例:模型构建、模型诊断、结果绘图等
3.非线性模型(NLM)案例:模型构建、参数设置等
5.2 Meta分析(Meta-analysis)
1.Meta分析基本原理
2.Meta分析效应值选则与计算
3.Meta分析效应值(累积/平均):随机效应模型、固定效应模型、森林图等
4.Meta分析解释变量引入(分类/连续变量)及结果绘图
5.Meta分析模型诊断:发表偏爱性、失安全系数等
5.3 贝叶斯回归与混合模型
1.贝叶斯回归和混合效应模型简介
2.贝叶斯回归模型案例:模型构建、模型诊断及结果绘图
3.贝叶斯混合效应模型案例:模型构建、模型诊断及结果绘图
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