新型ST6417碳青霉烯耐药高毒力肺炎克雷伯菌（CR-hvKP）分离株CR2021由哈尔滨医科大学团队首次报道。分子分型结果显示，ST6417菌株源于中国最流行的ST23型高毒力肺炎克雷伯菌（hvKP），其tonB基因相对ST23存在单一位点变异（C239A突变）。因此，ST6417 CR-hvKP的出现，可能是ST6417 hvKP获得CR质粒的结果。
基因组特征
全基因组测序分析显示，CR2021菌株包含一条5.2 Mb大小的染色体和三个质粒（pCR2021_IncFII、pCR2021_IncFIB和pCR2021_IncX3）。其中，pCR2021_IncFII携带12种耐药基因，pCR2021_IncFIB携带毒力基因iroBCDN和iucABCD-iutA，pCR2021_IncX3则含有碳青霉烯耐药基因blaNDM-5（表1）。
表1 CR2021菌株的染色体和质粒特征
NDM遗传环境
pCR2021_IncX3携带完整的T4SS系统，可能通过质粒接合完成碳青霉烯耐药基因blaNDM-5的水平转移。
图1 质粒pCR2021_IncX3的比较基因组圈图和遗传背景线性分析
细菌毒力实验
通过生物膜形成实验、血清杀伤实验、抗中性粒细胞吞噬实验及大蜡螟幼虫感染模型，研究验证了CR2021的高毒力特性。
图2 菌株CR2021毒力验证实验结果：（A）生物膜形成实验；（B）血清抗性实验；（C）抗人中性粒细胞吞噬试验；（D）大蜡螟幼虫感染模型。
重点：ST6417 CR-hvKP的发现揭示了高毒力菌株通过获得blaNDM-5-IncX3质粒进化为CR-hvKP的新路径。
参考文献
Liu J, Yuan S, Xuan L, et al. Emergence of a novel sequence type carbapenem-resistant hypervirulent Klebsiella pneumoniae ST6417 harboring blaNDM-5 on the IncX3 plasmid[J]. Microbiology Spectrum, 2024, 12(10): e00984-24.
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