沈律
分子生物学关键理论的突破及其主要贡献者
2025-6-10 19:15
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分子生物学关键理论的突破及其主要贡献者

 

沈  律

 

摘  要:分子生物学作为现代生命科学的核心领域,自诞生以来取得了众多突破性进展,深刻地改变了我们对生命现象的认知。1953年,沃森和克里克提出的 DNA双螺旋结构模型,堪称分子生物学发展历程中的一座丰碑。这一发现不仅揭示了生命的本质和遗传物质的基本结构,更阐明了遗传信息的存储和传递机制,为整个现代遗传学和分子生物学奠定了坚实基础,开启了从分子层面探索生命奥秘的新纪元。随着对 DNA 研究的深入,人类基因组计划的实施让我们对遗传信息的全貌有了更系统的认识。该计划旨在测定组成人类染色体中所包含的 30 亿个碱基对组成的核苷酸序列,从而绘制人类基因组图谱,辨识其载有的基因及其序列,达到破译人类遗传信息的最终目的。这一宏伟计划的完成,是继曼哈顿计划之后,人类科学史上的又一个伟大工程,为生命科学的研究提供了海量的数据资源,推动了基因功能研究、疾病关联分析等多个领域的发展。而生命周期双 S 曲线规律的提出,则是对生物个体发育和种群演化规律过程的创新性总结。该规律从全新的视角揭示了生物在不同生命阶段的生长、发育、繁殖以及衰老等过程中的内在联系和动态变化模式,为理解生物的生命历程提供了独特的分析框架,极大地丰富了我们对生物进化和发育规律的认识。三者是一脉相承并密切联系的完整的统一体,这三座里程碑式的理论贡献奠定了分子生物学的基础,也构建起分子生物学理论大厦的框架结构。

 

关键词:分子生物学;关键理论突破;DNA双螺旋;基因组;双S曲线;主要贡献者

 

 

Breakthroughs in key theories of molecular biology and their main contributors

 

SHEN Lu

 

Abstract: Molecular biology, as the core field of modern life science, has achieved numerous breakthroughs since its inception, profoundly changing our understanding of life phenomena. In 1953, Watson and Crick proposed the DNA double helix structure model, which is regarded as a monument in the development history of molecular biology. This discovery not only revealed the essence of life and the basic structure of genetic material, but also clarified the storage and transmission mechanism of genetic information, laying a solid foundation for the entire modern genetics and molecular biology, and opening a new era of exploring the mysteries of life at the molecular level. With the deepening of DNA research, the implementation of the Human Genome Project has enabled us to have a more systematic understanding of the entire genetic information. This project aims to determine the nucleotide sequence of the 3 billion base pairs constituting the human chromosomes, thereby mapping the human genome and identifying the genes and their sequences, achieving the ultimate goal of deciphering human genetic information. The completion of this grand plan is another great project in human scientific history following the Manhattan Project, providing massive data resources for life science research and promoting the development of various fields such as gene function research and disease association analysis. The proposal of the life cycle double S-curve law is an innovative summary of the development process of biological individuals and population evolution. This law reveals the intrinsic connections and dynamic change patterns of growth, development, reproduction, and aging of organisms at different life stages from a new perspective, providing a unique analytical framework for understanding the life process of organisms, and greatly enriching our understanding of the evolution and development laws of organisms. The three milestones of theoretical contributions are a complete and closely related unified entity. These three landmark theoretical contributions laid the foundation for molecular biology and constructed the framework structure of the molecular biology theoretical edifice.

 

Key words: Molecular Biology; Key Theoretical Breakthrough; DNA Double Helix; Genome; Double S-curve; Principal Contributors

 

1引 言

分子生物学作为现代生命科学的核心领域,自诞生以来取得了众多突破性进展,深刻地改变了我们对生命现象的认知。1953 年,沃森(James Watson)和克里克(Francis Crick)提出的 DNA 双螺旋结构模型,堪称分子生物学发展历程中的一座丰碑。这一发现不仅揭示了生命的本质和遗传物质的基本结构,更阐明了遗传信息的存储和传递机制,为整个现代遗传学和分子生物学奠定了坚实基础,开启了从分子层面探索生命奥秘的新纪元。随着对 DNA 研究的深入,人类基因组计划的实施让我们对遗传信息的全貌有了更系统的认识。该计划旨在测定组成人类染色体中所包含的 30 亿个碱基对组成的核苷酸序列,从而绘制人类基因组图谱,辨识其载有的基因及其序列,达到破译人类遗传信息的最终目的。这一宏伟计划的完成,是继曼哈顿计划和阿波罗登月计划之后,人类科学史上的又一个伟大工程,为生命科学的研究提供了海量的数据资源,推动了基因功能研究、疾病关联分析等多个领域的发展。而生命周期双 S 曲线规律的提出,则是对生物个体发育和种群演化规律过程的创新性总结。该规律从全新的视角揭示了生物在不同生命阶段的生长、发育、繁殖以及衰老等过程中的内在联系和动态变化模式,为理解生物的生命历程提供了独特的分析框架,极大地丰富了我们对生物进化和发育规律的认识。本研究旨在深入剖析从 DNA 双螺旋结构的发现到基因组研究,再到生命周期双 S 曲线规律发现这一发展脉络,通过系统梳理它们的理论内涵、研究方法以及在分子生物学领域的应用,揭示它们之间的内在逻辑联系和相互影响,从而更全面、深入地理解分子生物学的发展历程和未来趋势,为相关领域的进一步研究提供理论支持和思路启发。从 DNA 双螺旋结构到生命周期双 S 曲线规律的研究,完善了分子生物学的理论体系。DNA 双螺旋结构揭示了遗传信息的物质基础和传递方式,而生命周期双 S 曲线规律则从宏观角度阐述了生物个体和种群在时间维度上的发展变化规律。将两者结合研究,有助于我们从分子和整体两个层面,全面解析遗传信息如何在生物个体的发育过程中得以表达和调控,以及这种调控如何影响生物种群的演化,从而更深入地洞察生命的本质和遗传发育的奥秘。这种整合性的研究还能够促进分子生物学与其他相关学科如生态学、进化论等的交叉融合,为解决生命科学领域的各种复杂问题提供更强大的理论工具。例如,在探讨物种进化时,可以结合 DNA 的遗传变异和生物在不同生命周期阶段对环境的适应策略,综合分析进化的驱动力和机制。在生物医学领域,这些研究成果具有广泛的应用价值。基于 DNA 双螺旋结构发展起来的基因检测技术,能够精准地检测出与疾病相关的基因变异,为疾病的早期诊断和精准治疗提供有力依据。例如,通过对癌症相关基因的检测,可以实现癌症的早期筛查和个性化治疗方案的制定。而生命周期双 S 曲线规律可以帮助我们理解疾病在不同生命阶段的发生发展特点,从而制定更具针对性的预防和治疗策略。在药物研发领域,对 DNA 双螺旋结构的研究为药物靶点的发现和设计提供了关键信息,而生命周期双 S 曲线规律则有助于我们根据不同生命阶段的生理特点,优化药物的研发和应用,提高药物疗效,降低药物副作用。在农业领域,了解作物的生命周期规律以及相关基因的功能,有助于培育出更优良的品种,提高农作物的产量和品质。与以往研究不同的是,本研究从与诺贝尔奖的关联角度出发,探讨分子生物学理论框架结构的构建。诺贝尔奖作为科学界的最高荣誉,其获奖成果往往代表了某一领域的重大突破和卓越贡献。通过分析 DNA 双螺旋结构、基因组研究以及生命周期双 S 曲线规律等相关研究与诺贝尔奖的关联,不仅能够突出这些研究成果的重要性和影响力,还能从一个独特的视角展现分子生物学的发展历程和科学价值。这种研究视角有助于我们更好地理解科学研究的发展脉络和评价标准,为未来的科学研究提供启示。

2 DNA 双螺旋结构发现:分子生物学基石奠定

2.1 DNA 双螺旋结构发现历程的追溯

1869 年,瑞士生物化学家弗里德里希米歇尔(Friedrich Miescher)从脓细胞的细胞核中分离出一种含磷物质,他称之为 “核素”,这便是最初被发现的 DNA,但当时人们并未认识到其重要性。20 世纪初,随着遗传学的发展,科学家们逐渐意识到遗传物质可能与染色体有关,而 DNA 是染色体的主要成分之一。1928 年,英国细菌学家弗雷德里克格里菲斯(Frederick Griffith)进行了肺炎双球菌转化实验,他发现无毒的 R 型肺炎双球菌可以转化为有毒的 S 型肺炎双球菌,且这种转化是可以遗传的,这一实验表明在细菌中存在某种 “转化因子”,但当时并不知道这种转化因子就是 DNA。1944 年,美国科学家奥斯瓦尔德艾弗里(Oswald Avery)等人通过一系列实验,证明了格里菲斯实验中的转化因子就是 DNA,这一发现使人们开始关注 DNA 在遗传中的作用。

1950 年,奥地利裔美国生物化学家埃尔文查加夫(Erwin Chargaff)通过对多种生物 DNA 的分析,发现了 DNA 中碱基的含量关系,即腺嘌呤(A)与胸腺嘧啶(T)的数量相等,鸟嘌呤(G)与胞嘧啶(C)的数量相等,这一规律被称为查加夫法则,为 DNA 结构的研究提供了重要线索。1951 年,美国科学家詹姆斯沃森(James Watson)和英国科学家弗朗西斯克里克(Francis Crick)在剑桥大学卡文迪许实验室相遇,他们都对 DNA 结构的研究充满热情,并决定合作探索这一难题。当时,伦敦国王学院的莫里斯威尔金斯(Maurice Wilkins)和罗莎琳德富兰克林(Rosalind Franklin)也在进行 DNA 结构的研究,他们采用 X 射线衍射技术来分析 DNA 的结构。1951 年,威尔金斯已经认识到 DNA 的螺旋结构,富兰克林则推测出 DNA 分子有多股链,呈螺旋型等特点。1953 年 2 月,沃森和克里克看到了富兰克林拍摄的一张非常出色的 DNA 的 X 射线衍射照片(照片 51 号),这张照片为他们提供了关键的线索,使他们能够确定 DNA 的螺旋结构和相关参数。随后,他们通过搭建模型和反复验证,最终在 1953 年 3 月 7 日成功构建出了 DNA 双螺旋结构模型,并于同年 4 月 25 日在《自然》杂志上发表了这一成果 。

2.2 结构特点剖析

DNA 双螺旋结构具有以下几个重要特点:首先,DNA 是由两条反向平行的脱氧核苷酸长链构成双螺旋结构。两条链围绕同一中心轴互相缠绕,一条链的方向是 5'→3',另一条链的方向则是 3'→5',这种反向平行的结构保证了 DNA 分子的稳定性和信息传递的准确性。其次,磷酸和脱氧核糖交替排列,在外侧构成构成骨架,碱基排列在内侧。磷酸和脱氧核糖通过磷酸二酯键连接形成长链,为 DNA 分子提供了基本的结构框架,而碱基则通过氢键相互配对,形成碱基对,位于双螺旋的内部。再者,两条链的碱基间能过氢键形成碱基对,碱基对之间遵循碱基互补配对规律,即腺嘌呤(A)与胸腺嘧啶(T)配对,形成两个氢键;鸟嘌呤(G)与胞嘧啶(C)配对,形成三个氢键 。这种碱基互补配对原则是 DNA 复制和遗传信息传递的基础,它使得 DNA 分子能够准确地复制自身,保证遗传信息的稳定传递。此外,DNA 双链是右手螺旋结构,其螺旋的螺距为 3.4 纳米,直径为 2 纳米,每 10 个碱基对形成一个螺旋周期。这种螺旋结构不仅使 DNA 分子能够紧凑地存储在细胞内,还为 DNA 与其他蛋白质和分子的相互作用提供了特定的空间结构。DNA 双螺旋结构的这些特点使其能够有效地存储和传递遗传信息。碱基互补配对原则保证了 DNA 复制时遗传信息的准确性,因为一条链上的碱基序列可以作为模板,通过互补配对合成出另一条链,从而实现遗传信息的精确传递。而双螺旋结构的稳定性则确保了遗传信息在细胞分裂和个体发育过程中不会轻易丢失或改变。这种结构还为遗传信息的表达和调控提供了基础,通过特定的蛋白质与 DNA 的相互作用,可以启动或抑制基因的表达,从而实现生物体内各种生理过程的调控。

2.3 DNA 双螺旋结构与诺贝尔奖关联

1962 年,詹姆斯沃森、弗朗西斯克里克和莫里斯威尔金斯因在 DNA 双螺旋结构发现过程中的卓越贡献被联合授予诺贝尔生理学或医学奖。这一奖项的颁发,不仅是对他们个人科研成就的高度认可,更是对 DNA 双螺旋结构这一发现的重要性和影响力的充分肯定。沃森和克里克通过搭建分子模型,创造性地提出了 DNA 双螺旋结构模型,从分子层面揭示了遗传物质的结构和遗传信息传递的机制,为现代遗传学和分子生物学的发展奠定了坚实基础。他们的工作不仅解决了长期以来困扰科学界的 DNA 结构问题,还开启了从分子水平研究生命现象的新纪元。威尔金斯则通过 X 射线衍射技术,为 DNA 双螺旋结构的确定提供了关键的实验数据和技术支持。他对 DNA 晶体的 X 射线衍射研究,为沃森和克里克的模型构建提供了重要的参考依据。

罗莎琳德富兰克林在 DNA 双螺旋结构发现中也做出了卓越贡献。她通过精湛的 X 射线衍射技术,拍摄到了高质量的 DNA 晶体 X 射线衍射照片,尤其是著名的 “照片 51 号”,为揭示 DNA 的螺旋结构提供了关键证据。然而,由于当时的性别歧视等因素,她的贡献在一定程度上被忽视。直到后来,随着对科学历史的深入研究,她的重要作用才逐渐被人们所认识和重视 。虽然富兰克林因早逝未能获得诺贝尔奖,但她的工作无疑是 DNA 双螺旋结构发现过程中不可或缺的一部分。

2.4 在分子生物学理论框架中的奠基作用

DNA 双螺旋结构的发现,是分子生物学发展史上的一个重要里程碑,它为分子生物学的理论框架奠定了坚实的基础,开启了分子生物学时代。这一发现揭示了遗传信息的物质基础和传递方式,使人们能够从分子层面深入理解遗传现象。在此之前,虽然人们已经知道遗传信息与染色体有关,但对于遗传信息如何存储和传递却知之甚少。DNA 双螺旋结构的提出,明确了 DNA 是遗传信息的载体,碱基序列中蕴含着遗传密码,通过碱基互补配对原则实现遗传信息的复制和传递,这为遗传研究提供了清晰的分子机制,推动了遗传学从传统的描述性学科向精确的分子生物学转变。DNA 双螺旋结构的发现为后续的基因组研究提供了重要的基础。它使科学家们认识到 DNA 分子中蕴含着生物体的全部遗传信息,从而激发了对基因组进行全面研究的热情。随着技术的不断发展,人类基因组计划等一系列大规模基因组研究得以开展,这些研究极大地丰富了我们对遗传信息的认识,为理解生物的进化、发育、疾病发生等提供了海量的数据资源。DNA 双螺旋结构的研究方法和思路,如模型构建、X 射线衍射技术的应用等,为分子生物学的研究提供了重要的范例和技术手段。这些方法和技术的不断发展和完善,推动了分子生物学在蛋白质结构解析、基因表达调控、生物大分子相互作用等多个领域的深入研究,促进了分子生物学理论框架的不断完善和发展。

3 基因组研究:分子生物学的拓展与深化

3.1 基因组概念与研究进展

基因组是指生物体所有遗传物质的总和,这些遗传物质包括 DNA 或 RNA(病毒 RNA) 。更精确地讲,一个生物体的基因组是指一套染色体中的完整的 DNA 序列。1920 年,德国汉堡大学植物学教授汉斯温克勒(Hans Winkler)首次使用基因组这一名词。随着分子生物学技术的不断发展,对基因组的研究逐渐成为生命科学领域的核心内容之一。

在分子生物学和遗传学领域,基因组是指生物体所有遗传物质的总和 ,这些遗传物质包括 DNA(部分病毒为 RNA)。更精确地讲,一个生物体的基因组是指一套染色体中的完整的 DNA 序列。例如,人类细胞具有 22 对常染色体和 1 对性染色体,体细胞中的二倍体由两套染色体组成,其中一套 DNA 序列就是一个基因组。基因组不仅包含基因,还包括大量的非编码 DNA。基因是 DNA 分子上具有遗传效应的特定核苷酸序列,是遗传信息的基本单位,负责编码蛋白质或功能性 RNA 分子,从而决定生物体的各种性状和生理功能。以人类基因组为例,其组成极为复杂且精妙。人类基因组包含约 31.6 亿个碱基对,分布在 23 对染色体上。其中,编码区仅占整个基因组的约 2%,这些区域包含外显子,能够直接编码蛋白质,是遗传信息传递和表达的关键部分。外显子通过转录和翻译过程,将遗传信息转化为蛋白质的氨基酸序列,进而参与生物体的各种生命活动,如酶的催化作用、细胞结构的构建、信号传导等。然而,占比高达 98% 的非编码区并非 “垃圾 DNA”,它们在基因表达调控、染色体结构维持、细胞分化和发育等过程中发挥着不可或缺的重要作用。非编码区包含多种功能元件,启动子位于基因的上游,是 RNA 聚合酶结合的区域,能够启动基因的转录过程,决定基因在何时、何地以及以何种强度进行表达;增强子和沉默子等顺式作用元件可以远距离调控基因的表达,通过与转录因子等蛋白质相互作用,增强或抑制基因的转录活性,使基因表达能够根据细胞的需求和环境变化进行精准调控;非编码 RNA 基因能够转录产生各种非编码 RNA,如微小 RNA(miRNA)、长链非编码 RNA(lncRNA)等,这些非编码 RNA 通过与 mRNA 相互作用,影响 mRNA 的稳定性、翻译效率或剪接方式,从而间接调控基因表达。此外,非编码区中的一些重复序列,如卫星 DNA、转座子等,虽然不直接编码蛋白质,但在基因组的进化、染色体的配对和分离等过程中具有重要意义,它们的存在和变化可能导致基因结构和功能的改变,推动生物的进化和适应。

3.2 桑格对基因组学的贡献与人类基因组计划

基因组学是一门研究基因组的组成、结构和功能的学科,其研究内容涵盖多个层面,致力于全面解析生物体遗传信息的奥秘。结构基因组学主要关注基因定位和基因组作图,通过遗传图谱、物理图谱和转录图谱的构建,确定基因在染色体上的位置、基因之间的相对距离以及基因的转录起始和终止位点等信息,为进一步研究基因的功能和调控机制奠定基础。功能基因组学则着重研究基因的功能,通过基因敲除、过表达、RNA 干扰等技术手段,改变基因的表达水平,观察生物体在表型、生理功能等方面的变化,从而确定基因的生物学功能以及基因之间的相互作用关系,深入揭示生命活动的分子机制。比较基因组学通过对不同物种基因组的比较分析,研究基因组的进化历程、物种之间的亲缘关系以及基因的演化规律,寻找保守序列和变异区域,有助于理解生物进化的驱动力和适应机制,同时也为基因功能的预测和新基因的发现提供线索。在基因组学的研究中,发展了一系列先进的研究方法和技术。桑格的DNA 测序技术是解析基因组 DNA 序列的核心技术,从最初的桑格测序法到如今的高通量测序技术,如二代测序(Illumina 测序、SOLiD 测序等)和三代测序(PacBio 测序、Nanopore 测序等),测序效率不断提高,成本大幅降低,使得大规模基因组测序成为可能,能够快速获取大量生物的基因组序列信息。基因芯片技术,又称 DNA 微阵列技术,可在一张芯片上固定大量的 DNA 探针,能够同时对成千上万个基因的表达水平进行检测,全面分析基因在不同组织、不同发育阶段或不同环境条件下的表达谱,为研究基因的表达调控和功能提供丰富的数据。RNA 测序(RNA-seq)技术能够对细胞内的全部 RNA 进行测序,不仅可以准确测定基因的表达水平,还能发现新的转录本、可变剪接事件以及非编码 RNA 等,深入揭示转录组的复杂性和多样性。染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)技术则用于研究蛋白质与 DNA 的相互作用,通过特异性抗体富集与特定蛋白质结合的 DNA 片段,然后进行测序分析,确定蛋白质在基因组上的结合位点,从而揭示转录因子等蛋白质对基因表达的调控机制。

桑格因在分子生物学方面研究工作的贡献两次荣获诺贝尔化学奖。一次在蛋白质结构方面研究贡献;另一次是在DNA测序方面研究的贡献。

 

1955年,弗雷德里克·桑格将胰岛素的氨基酸序列完整地定序出来,同时证明蛋白质具有明确构造。他利用自己新发现的桑格试剂,也就是2,4-二硝基氟苯(2,4-dinitrofluorobenzene)将胰岛素降解成小片段,并与专门水解蛋白质的胰蛋白酶混合在一起。再将一部分混合物的样本置放于滤纸的一面,并利用一种色层分析方法来做进一步的实验,首先他将一种溶剂从单一方向通过滤纸,同时又让电流以相反向通过。由于不同的蛋白质片段有不同的溶解度与电荷,因此在电泳后,这些片段最后会各自停留在不同的位置,产生特定的图案。桑格将此图案称为“指纹”;不同的蛋白质拥有不同的图案,成为可供辨识且可重现的特征。之后桑格又将小片段重新组合成氨基酸长链,进而推导出完整的胰岛素结构。因此得出结论,认为胰岛素具有特定的氨基酸序列。这项研究使他单独获得了1958年的诺贝尔化学奖。

1975年时,弗雷德里克·桑格发展出一种称为链终止法(chain termination method)的技术来测定DNA序列,这种方法也称作“双去氧终止法”(Dideoxy termination method)或是“桑格法”。两年之后,他利用此技术成功定序出Φ-X174噬菌体(Phage Φ-X174)的基因组序列。这也是首次完整的基因组定序工作。他所发明的技术比起当时其他方法使用了较不具毒性的材料。主要是先进行DNA合成,利用DNA引子和DNA聚合酶使DNA链得以展开复制,再利用双去氧核苷酸(dideoxynucleotides)来终止DNA链的合成。实验会使不同序列的DNA带有不同长度,使其得以经由电泳来做分析。这项研究后来成为人类基因组计划等研究得以展开的关键之一,并使桑格于1980年再度获得诺贝尔化学奖,与桑格合作研究的沃特·吉尔伯特,以及另一团队的保罗·伯格也一同获奖。

20 世纪 90 年代启动的人类基因组计划(Human Genome Project,HGP)是基因组研究领域的一个重要里程碑。该计划由美国科学家于 1985 年率先提出,1990 年正式启动,旨在测定组成人类染色体中所包含的 30 亿个碱基对组成的核苷酸序列,从而绘制人类基因组图谱,辨识其载有的基因及其序列,达到破译人类遗传信息的最终目的 。这是一项规模宏大、跨国跨学科的科学探索工程,有来自美国、英国、德国、法国、日本以及中国等国家的 2000 多名科学工作者共同参与。经过多年努力,于 2003 年完成了最终测序图谱(占人类基因组的 92%);2022 年,Telomere-to-Telomere(T2T)联盟宣布填补了剩余的空白,并公布了第一个真正完整的人类基因组序列。

人类基因组计划的完成,为人类了解自身遗传信息提供了全面而系统的数据基础。通过该计划,人们首次揭示了人类基因组的大小和组成,包括大约 3 亿个 DNA 碱基对和约 2 万个编码蛋白质的基因;建立了人类基因组图谱,揭示了基因之间的相互关系和调控机制;鉴定了数千种人类基因的变异和多态性,揭示了基因变异与疾病发生的相关性,为个性化医疗和预防提供了基础支持 。该计划还促进了基因测序技术的发展和应用,降低了测序成本和时间,推动了精准医疗的发展。除了人类基因组计划,其他物种的基因组研究也取得了丰硕成果。例如,水稻基因组计划的完成,为提高水稻产量、改良水稻品质提供了重要的基因资源和理论基础;小鼠基因组计划的开展,使得小鼠成为研究人类疾病和基因功能的重要模式生物,通过对小鼠基因的研究,可以深入了解人类基因的功能和疾病的发病机制 。随着技术的不断进步,越来越多物种的基因组被测序和分析,这为比较基因组学、进化基因组学等领域的研究提供了丰富的数据,有助于深入探讨生物进化的历程和机制。

3.2 基因组学与 2022 年诺贝尔奖

2008 年,帕博团队在对西伯利亚杰尼索瓦洞穴中发现的一块 40000 年前的骨骼碎片的基因组测序后,发现了一种全新的人类 —— 丹尼索瓦人。丹尼索瓦人主要分布在欧亚大陆东部,后续研究表明,他们与欧亚大陆东部的人类交配,美拉尼西亚以及东南亚部分地区的人口可以携带多达 6% 的杰尼索娃人 DNA。从杰尼索瓦人身上遗传的一种基因可以帮助现代藏人在高海拔、低氧环境中生存 。帕博的研究成果为人类进化研究提供了全新的视角和重要的证据,揭示了现代人类与已灭绝古人类之间的基因联系和演化历程,让我们更加深入地了解人类的起源和独特之处。他的工作也为后续古基因组学的发展奠定了基础,激发了更多科学家对古人类遗传信息的探索和研究。

2022 年诺贝尔生理学或医学奖授予了瑞典遗传学家斯万特帕博(Svante Pääbo),以表彰他在已灭绝人种的基因组和人类进化方面的发现,他的开创性研究催生了 “古基因组学” 这一全新学科。在古基因组学研究之前,人类对已灭绝古人类的了解主要基于化石形态学分析,但这种方法存在一定的局限性,无法深入探究古人类的遗传信息和进化关系。斯万特帕博致力于克服古 DNA 研究中的技术难题,开发了一套复杂的新技术工具包,用于提取和分析古代标本中的 DNA。由于时间的推移,古 DNA 会发生化学修饰并降解为短片段,且容易受到细菌和现代人类 DNA 的污染,研究难度极大。帕博通过在严格消毒的洁净室中提取骨骼中的线粒体 DNA,并应用统计技术清除残留的遗传污染物等方法,成功地对尼安德特人的基因组进行了测序 。尼安德特人是人类已灭绝的近亲之一,大约在 40 万年前开始居住在欧洲和西亚地区,在大约 3 万年前灭绝。通过对尼安德特人基因组的测序和分析,帕博发现尼安德特人和智人在基因上是不同的,但两者有一个最近的共同祖先,大约生活在 80 万年前。他还发现尼安德特人和智人曾共存并发生基因交流,在现代欧洲或亚洲血统的人类中,多达 2% 的 DNA 来自尼安德特人 。

3.3 基因组研究对分子生物学理论的丰富

基因组研究从多个方面深化了分子生物学理论,极大地丰富了我们对遗传信息复杂性和生物进化关系的理解,进一步完善了分子生物学的理论框架。基因组研究揭示了遗传信息的复杂性远超预期。传统的分子生物学认为基因是决定生物性状的基本单位,但基因组研究发现,基因组中不仅包含编码蛋白质的基因序列,还存在大量的非编码 DNA 序列。这些非编码序列虽然不直接编码蛋白质,但在基因表达调控、染色体结构维持、生物进化等过程中发挥着重要作用 。例如,一些非编码 RNA(如微小 RNA、长链非编码 RNA 等)可以通过与 mRNA 相互作用,影响 mRNA 的稳定性和翻译效率,从而调控基因表达。基因组中还存在着大量的重复序列,它们的功能和作用机制也逐渐成为研究热点,这些发现表明遗传信息的传递和调控是一个极其复杂的网络系统,不仅仅是简单的 “基因 - 蛋白质” 线性关系。基因组研究为生物进化关系的研究提供了有力的工具和证据。通过比较不同物种的基因组序列,可以精确地推断物种之间的亲缘关系和进化历程。同源基因的分析可以揭示物种在进化过程中的分化时间和遗传变异的积累情况,而基因家族的研究则有助于了解基因的扩增、丢失和功能分化等进化事件。例如,通过对人类和其他灵长类动物基因组的比较,发现人类与黑猩猩的基因相似度极高,但在某些关键基因上的差异,可能解释了人类独特的智力和语言能力的进化。对古基因组的研究更是直接揭示了已灭绝古人类与现代人类之间的基因交流和进化关系,为人类进化理论提供了重要的补充和修正。基因组研究促进了分子生物学与其他学科的交叉融合。它与生物信息学的结合,使得对海量基因组数据的分析和解读成为可能,通过生物信息学算法和工具,可以预测基因功能、分析基因调控网络、发现新的基因和遗传变异等 。基因组研究与发育生物学的结合,有助于揭示基因在生物个体发育过程中的时空表达模式和调控机制,理解遗传信息如何在个体发育中逐步表达,从而塑造出复杂的生物体结构和功能。与生态学的交叉,则可以从基因组层面探讨生物对环境的适应性进化,分析环境因素如何影响基因组的变异和选择,以及物种在生态系统中的演化和相互作用。

4 生命周期双 S 曲线规律发现:分子生物学理论框架的完善

4.1 发现过程与内涵

生命周期双 S 曲线规律由沈律提出,是对生物个体发育和种群演化过程深入研究的成果。沈律通过对人体生殖与发育过程的系统观察及细胞增长的动力学分析,发现人体在生殖与发育过程中出现两种类型细胞增长,一种是胚胎干细胞的增长(增殖与分化),另一种是组织干细胞的增长(增殖与分化) 。这两种干细胞在增长(增殖与分化)过程中均表现出饱和现象,从而总结出人体生殖与发育过程遵循生命周期双 S 曲线规律。从生物个体发育角度来看,在胚胎发育初期,胚胎干细胞快速增殖与分化,此时细胞数量呈现指数增长趋势,形成第一个 S 曲线的上升阶段。随着胚胎的发育,各种组织和器官逐渐形成,细胞的增殖与分化受到多种因素的调控,增长速度逐渐减缓,达到第一个 S 曲线的平台期,这一阶段完成了生物个体基本结构和功能的构建。出生后,生物个体进入生长发育阶段,组织干细胞开始发挥重要作用。组织干细胞在维持组织和器官的正常功能、修复损伤等方面起着关键作用,其增长同样经历快速上升和逐渐饱和的过程,形成第二个 S 曲线。在个体衰老阶段,细胞的增殖与分化能力逐渐下降,机体的各项生理功能衰退,最终完成整个生命周期。

在种群演化方面,当一个种群进入新的环境时,在初期,由于资源丰富、竞争压力小,种群数量会迅速增长,呈现第一个 S 曲线的上升趋势。随着种群数量的增加,资源逐渐变得有限,种内竞争和种间竞争加剧,种群增长速度逐渐放缓,达到第一个 S 曲线的稳定阶段。在这个阶段,种群数量相对稳定,生态系统达到一种动态平衡。然而,当环境发生变化,如出现新的资源、新的天敌或其他生态因素的改变时,种群可能会进入新一轮的增长和调整,形成第二个 S 曲线。这种双 S 曲线的演化模式反映了种群在不同环境条件下的适应性变化和发展历程 。

4.2 与分子生物学其他理论的联系

生命周期双 S 曲线规律与 DNA 双螺旋结构、基因组研究存在紧密的内在联系,它们共同构成了分子生物学理论框架的重要组成部分,从不同层面和角度揭示了生命现象的本质和规律。DNA 双螺旋结构揭示了遗传信息的存储和传递机制,而生命周期双 S 曲线规律所描述的生物个体发育和种群演化过程,本质上是遗传信息在时间和空间维度上的有序表达和调控过程。在生物个体发育过程中,DNA 中的遗传信息通过转录和翻译等过程,指导蛋白质的合成,进而控制细胞的增殖、分化和功能行使,最终实现生物个体从受精卵到成熟个体的发育过程,这一过程与生命周期双 S 曲线中胚胎干细胞和组织干细胞的增长和分化过程密切相关 。在种群演化过程中,DNA 的遗传变异为种群的适应性进化提供了原材料,通过自然选择等机制,影响种群的数量变化和发展趋势,与双 S 曲线所反映的种群在不同环境条件下的增长和调整相呼应。基因组研究为理解生命周期双 S 曲线规律提供了更深入的遗传信息基础。基因组中包含了生物个体的全部遗传信息,通过对基因组的分析,可以揭示与生物个体发育和种群演化相关的基因及其调控网络。例如,研究发现一些基因在胚胎发育阶段高度表达,参与胚胎干细胞的增殖和分化调控,而在成年个体中,另一些基因则主要参与组织干细胞的功能维持和修复过程 。这些基因的表达变化与生命周期双 S 曲线所描述的生物个体发育阶段相契合。在种群层面,基因组研究可以揭示种群遗传多样性的变化规律,以及环境因素对基因组的影响,从而解释种群在演化过程中出现双 S 曲线的遗传机制。

4.3 潜在应用与对理论框架的完善

生命周期双 S 曲线规律在多个领域展现出了广阔的潜在应用价值,同时也对分子生物学理论框架的完善起到了重要作用。在生物医学领域,该规律有助于深入理解疾病的发生发展机制。不同生命阶段的生理特点和细胞增长模式与疾病的易感性和发展进程密切相关。例如,在胚胎发育阶段,某些基因的异常表达或细胞增殖分化的失调可能导致先天性疾病的发生;在成年阶段,组织干细胞功能的衰退或异常增殖可能与衰老相关疾病以及癌症的发生发展有关 。通过研究生命周期双 S 曲线规律,可以更好地预测疾病的发生风险,制定个性化的预防和治疗策略。在药物研发方面,根据不同生命阶段的特点,可以优化药物的设计和给药方案,提高药物的疗效和安全性。在生态学领域,生命周期双 S 曲线规律可以用于解释种群动态变化和生态系统的稳定性。了解种群在不同环境条件下的增长和调整模式,有助于合理管理和保护生物资源,预测生态系统对环境变化的响应,为生态保护和可持续发展提供科学依据 。例如,在渔业资源管理中,可以根据鱼类种群的生命周期双 S 曲线规律,合理确定捕捞量和捕捞时机,以维持渔业资源的可持续利用。从理论层面来看,生命周期双 S 曲线规律弥补了传统分子生物学理论在生物个体发育和种群演化动态描述方面的不足。传统理论主要侧重于遗传信息的结构和传递,而双 S 曲线规律则从宏观角度,将生物的生长、发育、繁殖和衰老等生命过程整合起来,提供了一个动态的、整体性的分析框架,使分子生物学理论能够更好地解释复杂的生命现象 。它促进了分子生物学与发育生物学、生态学、进化论等学科的交叉融合,为解决生命科学领域的综合性问题提供了新的思路和方法,进一步推动了分子生物学理论框架的完善和发展。

4.4沈律迄今未获诺贝尔生理学或医学奖的原因

沈律的生命周期双 S 曲线规律虽具有重要的理论价值和创新性,但至今未获得诺贝尔奖,可能有以下几方面原因:

第一,从研究热点角度来看,当前分子生物学领域研究热点多集中在基因编辑、蛋白质结构与功能解析、单细胞测序等前沿技术和微观分子机制研究方面。例如,CRISPR/Cas9 基因编辑技术因其在基因治疗、作物育种等领域的巨大应用潜力,成为近年来分子生物学研究的焦点,吸引了大量科研资源和关注。相比之下,生命周期双 S 曲线规律从宏观角度研究生物个体发育和种群演化,研究视角和方法与当前主流热点有所不同,在热点驱动的科研环境中,较难获得广泛关注和高度重视。

第二,在成果推广方面,该规律的传播和应用范围相对有限,由于生命周期双S曲线规律论文只是以中文发表在一个很一般的学术会义论文集中(《干细胞与发育生物学》2000年,军事医学科学院出版社出版),在学术界传播方面做的远远不够,在国际学术界很难引发关注。它与DNA发现后在国际著名《自然》(Nature)杂志发表相比形成巨大落差。与 DNA 双螺旋结构发现后迅速在全球学术界引发广泛讨论和深入研究不同,生命周期双 S 曲线规律在发表后,可能由于宣传推广力度不足,在国内外学术舞台上的曝光度不高,导致许多科研人员对其了解不够深入。

第三,生命周期双S曲线规律其理论相对较为抽象,需要结合大量生物学实例进行理解和验证,这也在一定程度上限制了其在学术界的快速传播和应用。诺贝尔奖评审存在一定的偏好。通常更倾向于奖励那些在实验技术、微观机制等方面取得重大突破的研究。DNA 双螺旋结构的发现得益于 X 射线衍射等先进实验技术的应用,直接从微观层面揭示了遗传物质的结构,符合诺贝尔奖对实验性和微观机制研究的偏好。而生命周期双 S 曲线规律主要基于生物学观察和数据统计分析,研究方法相对传统,在评审过程中可能不太符合其偏好标准。还有一个最重要原因就是这项成果的分子生物学理论的学术价值和科学意义远远未被人们所认识。生命周期双S曲线规律在构建分子生物学理论体系方面的重要作用远没有被人们所广泛认可。

总之,沈律的成果已经达到获诺贝尔生理学或医学奖水准,能否获奖就看这项成果在国际学术界的影响,只要坚持不懈努力扩大国际影响,还是有希望的获得诺贝尔生理学或医学奖的,今后只有加大国际宣传力度,坚持努力,才能实现目标。中国人不比㺯国等西方人能力差,美国等西方人能做到的,我们中国人也能做到。他们能在分子生物学理论体系的构建方面做出贡献(生命的本质),我们中国人也能在分子生物学理论体系的构建方面做出应有的贡献(生命演化规律)。而且是不可或缺的重要工贡献。这两者的发现才能真正构成分子生物学理论体系的框架结构,使分子生物学成为一门成熟学科。

5 三者关联及对分子生物学理论框架构建的综合影响

5.1 DNA 双螺旋结构、基因组、生命周期双 S 曲线规律的内在逻辑关联

从遗传信息传递角度来看,DNA 双螺旋结构是遗传信息的物质载体,其碱基序列储存着生物体的遗传密码。通过半保留复制,DNA 能够精确地将遗传信息传递给子代细胞,保证遗传信息的稳定性和连续性。基因组则是一个生物体所有遗传物质的总和,它包含了大量的基因和非编码 DNA 序列。这些基因在 DNA 双螺旋结构的基础上,通过转录和翻译过程,将遗传信息转化为蛋白质等生物大分子,从而实现生物的各种生理功能。而生命周期双 S 曲线规律所描述的生物个体发育和种群演化过程,本质上是遗传信息在不同时间和环境条件下的有序表达和调控过程。在个体发育过程中,随着胚胎干细胞和组织干细胞的增殖与分化,不同基因按照特定的时间顺序和空间模式被激活或抑制,从而指导生物个体从受精卵逐渐发育成为成熟个体,这一过程与 DNA 双螺旋结构中遗传信息的传递和表达密切相关 。在种群演化过程中,遗传信息的变异和选择导致种群基因频率的改变,进而影响种群的发展和进化,这也与 DNA 双螺旋结构和基因组的遗传特性紧密相连。

从生物个体与种群发展角度分析,DNA 双螺旋结构和基因组为生物个体的发育和种群的演化提供了遗传基础。DNA 双螺旋结构的稳定性保证了遗传信息的准确传递,使得生物个体能够继承亲代的遗传特征,实现正常的生长和发育。基因组中的基因则决定了生物个体的各种性状和生理功能,不同基因的组合和表达差异导致了生物个体之间的多样性。生命周期双 S 曲线规律则从宏观层面描述了生物个体和种群在时间维度上的发展变化模式。在生物个体发育过程中,从胚胎期到成年期再到衰老期,细胞的增殖、分化和功能状态不断发生变化,呈现出特定的双 S 曲线模式,这一过程受到 DNA 双螺旋结构中遗传信息的调控以及基因组中基因表达的影响 。在种群层面,种群数量的增长和变化同样遵循双 S 曲线规律,当种群进入新环境时,在初始阶段,由于资源丰富、竞争压力小,种群数量迅速增长,这得益于个体的遗传适应性和繁殖能力,而随着种群数量的增加,资源逐渐有限,种内竞争和种间竞争加剧,种群增长速度减缓,这一过程中,基因组的遗传多样性和变异在自然选择的作用下,影响着种群的发展和适应能力,决定了种群能否在不同环境条件下继续生存和繁衍 。

5.2 共同推动分子生物学理论框架的构建与发展

DNA 双螺旋结构的发现,为分子生物学奠定了基石,使人们从分子层面理解了遗传信息的存储和传递机制,开启了分子生物学的大门。在此基础上,基因组研究得以深入开展,通过对不同物种基因组的测序和分析,揭示了遗传信息的复杂性和多样性,丰富了分子生物学的研究内容。基因组研究不仅发现了大量与生物性状和疾病相关的基因,还深入探讨了基因的调控机制、基因之间的相互作用以及基因组的进化规律,进一步完善了分子生物学的理论体系 。生命周期双 S 曲线规律的提出,则从全新的视角为分子生物学理论框架的构建提供了补充。它将生物个体发育和种群演化过程纳入分子生物学的研究范畴,使分子生物学能够从宏观和微观两个层面综合解释生命现象。这一规律强调了生物在不同生命阶段的动态变化以及遗传信息在这些过程中的调控作用,促进了分子生物学与发育生物学、生态学等学科的交叉融合,为解决生命科学领域的复杂问题提供了新的思路和方法 。

三者在分子生物学理论框架构建中相互补充、相互促进。DNA 双螺旋结构和基因组研究为生命周期双 S 曲线规律的研究提供了遗传信息基础,使得我们能够从分子层面深入理解生物个体发育和种群演化过程中遗传信息的表达和调控机制。而生命周期双 S 曲线规律则为 DNA 双螺旋结构和基因组研究提供了宏观的研究背景和动态的研究视角,促使我们在更广阔的生命历程和生态环境中探讨遗传信息的作用和意义 。例如,在研究基因功能时,结合生命周期双 S 曲线规律,可以更好地理解基因在不同生命阶段的表达模式和功能变化,以及这些变化对生物个体和种群的影响。在探讨种群遗传多样性时,考虑 DNA 双螺旋结构和基因组的遗传特性以及生命周期双 S 曲线规律所反映的种群发展模式,能够更全面地分析遗传多样性的形成机制和维持因素 。它们共同构成了分子生物学理论框架的重要组成部分,推动着分子生物学不断向前发展,使我们对生命现象的认识更加深入和全面。

6 结  论

从 DNA 双螺旋结构的发现,到基因组研究的拓展深化,再到生命周期双 S 曲线规律的提出,这一系列重大成果构成了分子生物学理论框架不断完善和发展的重要脉络。DNA 双螺旋结构的发现,揭示了遗传信息的物质基础和传递机制,为分子生物学奠定了基石,开启了从分子层面探索生命奥秘的新纪元。基因组研究在 DNA 双螺旋结构的基础上,进一步揭示了遗传信息的复杂性和多样性,通过对不同物种基因组的测序和分析,深入探讨了基因的功能、调控机制以及生物进化关系,极大地丰富了分子生物学的研究内容。生命周期双 S 曲线规律则从宏观角度,将生物个体发育和种群演化过程纳入分子生物学的研究范畴,为理解生命现象提供了全新的动态分析框架,促进了分子生物学与发育生物学、生态学等学科的交叉融合。三者之间存在紧密的内在逻辑关联,共同推动了分子生物学理论框架的构建与发展。DNA 双螺旋结构和基因组研究为生命周期双 S 曲线规律提供了遗传信息基础,使得我们能够从分子层面深入理解生物个体发育和种群演化过程中遗传信息的表达和调控机制。而生命周期双 S 曲线规律则为 DNA 双螺旋结构和基因组研究提供了宏观的研究背景和动态的研究视角,促使我们在更广阔的生命历程和生态环境中探讨遗传信息的作用和意义。它们的相互补充和促进,使分子生物学能够从微观和宏观两个层面综合解释生命现象,对生命科学的发展产生了深远影响。

随着科学技术的不断进步,分子生物学在未来将展现出更加广阔的研究前景。在多学科交叉融合方面,分子生物学将与人工智能、大数据、材料科学等学科进行深度融合。与人工智能的结合,将有助于更高效地分析和解读海量的分子生物学数据,预测基因功能和生物分子间的相互作用;与大数据技术的融合,能够整合全球范围内的生物数据资源,为解决复杂的生命科学问题提供更全面的信息支持;与材料科学的交叉,有望开发出新型的生物材料和生物传感器,用于疾病诊断、药物输送等领域。在新技术应用方面,基因编辑技术如 CRISPR - Cas9 等将不断完善和拓展应用范围,为基因治疗、作物改良等提供更精准、高效的手段。单分子测序、单细胞测序等技术的发展,将使我们能够从单个分子和单个细胞的层面深入研究生命现象,揭示细胞间的异质性和个体发育过程中的分子机制。冷冻电镜技术的不断革新,将进一步推动蛋白质结构解析的发展,有助于深入理解蛋白质的功能和作用机制。未来分子生物学还将在生物医学、农业、环境保护等领域发挥更为重要的作用。在生物医学领域,基于分子生物学的精准医疗将更加普及,通过对个体基因组和分子标志物的分析,实现疾病的个性化诊断和治疗;在农业领域,分子生物学技术将助力培育更加优质、高产、抗逆的农作物品种,保障全球粮食安全;在环境保护领域,分子生物学方法可用于监测和治理环境污染,揭示生态系统中生物与环境的相互作用机制,为生态保护和修复提供科学依据。

 

参考文献

[1] J.D.Watson, F.H.C.Crick.Molecular structure of Nucleic acid :A structure for Deoxyribose Nucleic AcidApril 25, 1953(2),Nature(3),171, 737-738

[2]沈律.论生物进化与生物发育的基本规律—对人类基因组的形成及其复制与表达过程的系统研究.叶鑫生等主编.干细胞与发育生物学(论文集).北京:军事医学科学出版社.2000.217-229

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