覃元元
[转载]BMC plant biology||花椒LBD转录因子基因家族的全基因组鉴定和功能特征揭示其在叶片变异中的潜在作用
2025-6-3 15:43
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叶片形态对经济林木的生产力和环境适应性至关重要。青花椒(Zanthoxylum armatum)在自然群体中表现出显著的叶片大小和形状多样性,这种多样性被认为是植物对不同环境适应的结果。然而,青花椒叶片变异的遗传机制尚未被系统揭示。叶片形态的遗传调控机制复杂,涉及多个基因和信号通路。

青花椒的广泛地理分布(从热带、亚热带至温带)导致其叶片表型差异显著,但具体调控基因不明确。LBD转录因子在植物叶片极性建立和形态建成中起关键作用,但其在青花椒中的功能尚未研究。

LBD基因家族在拟南芥、水稻、玉米等模式植物中被广泛研究,已知其参与器官发育、细胞分化及胁迫响应。青花椒作为重要的经济作物,其基因家族的系统研究尚未见报道。

1题目

文章题目:Genome-wide identification and functional characterization of the LBD transcription factor gene family in Zanthoxylum armatum DC. reveal its potential role in leaf variation

发文单位:重庆文理学院经济植物生物技术重庆市重点实验室、重庆市特色植物产业协同创新中心、智慧农业学院,长江大学香料作物种质创新与利用湖北省重点实验室,重庆市农业技术推广总站,重庆市荣昌区林业科技推广站

2杂志

BMC plant biology;二区IF=4.3分

3链接

Deng, Yifei, et al. "Genome-wide identification and functional characterization of the LBD transcription factor gene family in Zanthoxylum armatum DC. reveal its potential role in leaf variation." BMC Plant Biology 25.1 (2025): 1-18.

doi.org/10.1186/s12870-

4检测指标

Norminkoda提供转录组测序分析

5主要内容

5.1 基因家族特征

青花椒LBD基因家族包含97个成员,多数为不稳定亲水蛋白,核定位,具有完整的LOB结构域。

5.2 进化与结构

系统发育分析显示ZaLBD分为5个亚家族,保守基序和基因结构支持功能分化。

串联重复和共线性事件驱动基因家族扩张,部分基因经历正选择(如ZaLBD40/ZaLBD43)。

5.3 功能预测

启动子分析表明ZaLBD可能参与光响应、激素信号和胁迫适应。

蛋白互作网络显示其与叶片发育关键基因(如AS1/AS2)存在潜在互作。

5.4 表达模式

不同纬度青花椒的叶片中,ZaLBD45表达量最高且与叶片大小负相关,ZaLBD19表达趋势与叶片大小一致,提示二者可能调控叶片形态。

6总结

6.1 科学意义

揭示了青花椒LBD基因家族的进化历史、结构特征和表达模式,为理解其功能分化提供基础。

发现ZaLBD45和ZaLBD19可能与叶片大小调控相关,为解析环境适应性机制提供候选基因。

6.2 应用价值

研究结果为青花椒的遗传改良(如抗逆性、产量提升)提供理论依据。

为其他植物LBD基因家族的功能研究提供参考。

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