||
叶片形态对经济林木的生产力和环境适应性至关重要。青花椒(Zanthoxylum armatum)在自然群体中表现出显著的叶片大小和形状多样性,这种多样性被认为是植物对不同环境适应的结果。然而,青花椒叶片变异的遗传机制尚未被系统揭示。叶片形态的遗传调控机制复杂,涉及多个基因和信号通路。
青花椒的广泛地理分布(从热带、亚热带至温带)导致其叶片表型差异显著,但具体调控基因不明确。LBD转录因子在植物叶片极性建立和形态建成中起关键作用,但其在青花椒中的功能尚未研究。
LBD基因家族在拟南芥、水稻、玉米等模式植物中被广泛研究,已知其参与器官发育、细胞分化及胁迫响应。青花椒作为重要的经济作物,其基因家族的系统研究尚未见报道。
1题目
文章题目:Genome-wide identification and functional characterization of the LBD transcription factor gene family in Zanthoxylum armatum DC. reveal its potential role in leaf variation
发文单位:重庆文理学院经济植物生物技术重庆市重点实验室、重庆市特色植物产业协同创新中心、智慧农业学院,长江大学香料作物种质创新与利用湖北省重点实验室,重庆市农业技术推广总站,重庆市荣昌区林业科技推广站
2杂志
BMC plant biology;二区IF=4.3分
3链接
Deng, Yifei, et al. "Genome-wide identification and functional characterization of the LBD transcription factor gene family in Zanthoxylum armatum DC. reveal its potential role in leaf variation." BMC Plant Biology 25.1 (2025): 1-18.
https://doi.org/10.1186/s12870-025-06727-z
4检测指标
Norminkoda提供转录组测序分析
5主要内容
5.1 基因家族特征
青花椒LBD基因家族包含97个成员,多数为不稳定亲水蛋白,核定位,具有完整的LOB结构域。
5.2 进化与结构
系统发育分析显示ZaLBD分为5个亚家族,保守基序和基因结构支持功能分化。
串联重复和共线性事件驱动基因家族扩张,部分基因经历正选择(如ZaLBD40/ZaLBD43)。
5.3 功能预测
启动子分析表明ZaLBD可能参与光响应、激素信号和胁迫适应。
蛋白互作网络显示其与叶片发育关键基因(如AS1/AS2)存在潜在互作。
5.4 表达模式
不同纬度青花椒的叶片中,ZaLBD45表达量最高且与叶片大小负相关,ZaLBD19表达趋势与叶片大小一致,提示二者可能调控叶片形态。
6总结
6.1 科学意义
揭示了青花椒LBD基因家族的进化历史、结构特征和表达模式,为理解其功能分化提供基础。
发现ZaLBD45和ZaLBD19可能与叶片大小调控相关,为解析环境适应性机制提供候选基因。
6.2 应用价值
研究结果为青花椒的遗传改良(如抗逆性、产量提升)提供理论依据。
为其他植物LBD基因家族的功能研究提供参考。
Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )
GMT+8, 2025-6-6 17:27
Powered by ScienceNet.cn
Copyright © 2007- 中国科学报社