邓倩云
翼和SNP分型技术(一):PCR-LDR技术
2025-11-3 15:14
阅读:739

选择SNP分型服务,可根据实验规模决定。PCR-LDR技术适用于中低通量检测,能精准满足小规模实验需求;基于二代测序的Hi-SNP技术则适合高通量检测,为大规模实验提供高效方案。

1. PCR-LDR技术技术路线:

图片1.png 

2. 分型流程

a. 位点评估:确认物种,基因或序列信息,对SNP位点的同源性(高同源不适合该方法检测SNP,本公司有针对该状况的特色服务),GC含量(含量过高可能导致检测失败)等进行评估,确定可行性。

b. 样本质控:电泳及浓度综合质控,不合格的样本反馈给客户。单管操作,样本消耗量少,100ng样本就能做几十上百个SNP

c. 引物设计合成:根据扩增子设计并合成引物。

d. 扩增阶段:调整各对引物的体积及反应条件,使得每对引物的扩增效率相当,同时扩增多个目标DNA片段。

e. LDR及电泳:扩增产物进行连接酶检测反应,反应产物进行毛细管电泳分离。

f. 数据分析:分析荧光峰位置及片段大小,确定基因型。生成实验报告。

 

3. 技术核心

连接酶检测反应(LDR)

图片2.png 

 

PCR-LDR-SNP分型系统

图片3.png 

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