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不恰当的分类法导致流感病毒来源的困惑！
2009年流行的流感病毒是H1N1流感病毒，初起叫猪流感，后WHO命名为H1N1人流感病毒，随后报告要流行的是H5N1流感病毒，后WHO命名为H5N1禽流感病毒，实践表明其没有在人群中流行，今年要预防的是H7N9禽流感病毒，WHO已点明是禽流感病毒，含义是不会在人群中流行。根据血凝素蛋白分型，流感病毒有H1至H15共15种亚型，人类流行的局限于H1至H3这三个亚型。而禽类带有所有亚型的流感病毒，因此有人认为人类流感病毒来自于禽流感病毒，但来自于并不是等同于，流行于人群的H1人流感病毒并不等同于H1禽流感病毒，不意味H1禽流感病毒可以在人群中流行，此H1非彼H1，流行及预防的原则不相同。
由于研究的角度不同，病毒的命名从来就没有很好的统一，根据临床流行病学家角度，病毒应该从流行规律、宿主与疾病的关系分类，而实验病毒学家主张从病毒核酸与结构分类，长期以来没有兼顾各方面的合理分类；1937年有专家根据病毒对组织的亲和性进行分类，1948年提出根据病毒所引起宿主症状分类，但随着对病毒结构认识的深入，逐步转向按病毒本身的特征分类了，最终经1996年国际病毒分类委员会决定，所有病毒不论寄生宿主，按核酸结构与蛋白质亚单位等分类，看来因分子生物学的发展，实验病毒学家的意见占了上风。这确实有利于实验病毒学的研究，但这种分类法完全忽略了病毒对宿主的依赖作用，对人类病毒性疾病的流行与防治无指导作用，直接导致如今在流感病毒预防工作中的困惑。
因为结构相似的同科病毒对人类不仅有能否感染、能否致病之分，还有流行方式与预防手段不同之分。以乳头瘤病毒为例，我们可以从人、牛、兔、狗、马、羊、鼠、猪、猩猩等许多物种发现乳头瘤病毒，这些病毒有共同的功能性结构和相似的生存规律，但各有其长期宿主，并不交叉流行。痘科病毒中天花病毒可引起人类致命性病变，而牛痘病毒仅造成局部轻微反应；疱疹病毒科中人疱疹病毒仅诱发人类的自限性病变，而乙型疱疹病毒在其长期宿主灵长目动物中感染率高达50-82%，一旦感染人类死亡率极高，但其不能在人间传播。从另一面看，多种结构上毫无关联的病毒可以感染人体的同一种组织，如属小RNA病毒科的甲肝病毒、嗜肝DNA病毒的乙肝病毒、黄热病毒科的丙肝病毒、嵌杯病毒科的戊肝病毒，这些相互之间结构毫无关联的病毒都可导致人类的肝炎。对此，我们只能得出这样的结论，仅根据病毒核酸与蛋白的结构特征，于人类病毒性疾病的防治毫无意义。离开宿主我们甚至无以发现与鉴定病毒；忽视病毒在自然界的习性，凭核酸序列判断病毒的传染源，纸上谈兵罢了，最多当个“事后诸葛亮”，难以指导病毒流行病防治。
这也是一条基因一个蛋白论点的误导结果，在实验室可能是如此，在自然界就不一定正确了。最浅显的例子就是乙肝病毒的e抗原与核心抗原，这两种蛋白源于一个基因，可这两种蛋白在结构上、分布上、功能上以及抗原性上完全不同；至今把慢性乙型肝炎的发病机理搅得如此混乱，也是这个基因惹的祸。人类基因组研究项目如此伟大，预言了解30亿对DNA序列后可知一生的健康与疾病，然而十余年过去才知后面还有更多、更难、更大的项目要做。核酸序列仅仅记录一种生物信息，信息转化为实物受制于不少因素，不想解释得太复杂，首先总要看看“场地”吧。如果根据临床流行病学家的分类，新病毒流行（Emerging virus）必定有一个从点发至群发的渐变演化过程，不会得出因杂交突发流行的概念。
虽然由于分类的问题，病毒的命名有点混乱，但是WHO专家最终命名还是两者兼顾，比较靠谱，在有核酸分类标记的基础上加上宿主定义，没有顺从国际病毒委员会命名原则。
流感病毒的核酸序列分析可以了解流感病毒演化史，不能证明其某段序列是通过杂交获得的。例如根据线粒体的基因序列分析，人类的祖先起源于非洲，有一支走向北欧，在北方寒冷的气候，逐步形成深目高鼻白肤蓝瞳的人种特征，如其回到非洲要回复到当地人模样，恐怕不是几代人就能达到的，东方黄种人是另外一支，相貌特征介于中间，我们不能说是北欧人与非洲人群居而形成的吧。流感病毒也同理，通过跨物种传播，禽流感病毒演化成猪流感病毒，再演变成人流感病毒，需要相当的时间。如果禽、人流感病毒可以在猪身上杂交，杂交经一次传代就可发生，按病毒的天文数量，流感病毒“杂交大全”早已成就，还需要专家预言吗？当今生命世界，经历亿万年的进化，基因组的发展与进化极端有序，不管物种的大小繁简，都有严格的规则，不然其难以自保。基因是自私的，说的就是基因只顾自我复制发展，相互之间绝不交流；如能杂交，得到最佳基因组合的物种脱颖而出，万物世界就此消失了。自然界的杂交现象是配对染色体等位基因的交换，不是基因杂交。目前实验室的基因杂交还进不了自然，实验就是实验的，自然还是自然的，实验要敬畏自然，等“阿凡达”真正来了，人类就要真的听从实验的了。掌握先进现代化技术的实验病毒学家用基因洗牌，基因搅拌器如此通俗的言语来科普流感病毒进化规律，是不恰当的。
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