[打听，笔记] 基因组，以及基因组中“非编码 noncoding DNA序列”的含义 （关联：“自然运算”）

   客观世界里的“客观存在的运动过程”，除了可以从“物质”（如化学反应）角度理解外，还可以从“能量”（如能量守恒与转化定律）、“信息”等多种不同的角度进行理解。

   从“信息”的角度理解“客观存在的运动过程”的一种思路，就是“自然运算”：大自然自身可以理解为一种信息的运算。

一、复习：信息，与物质、能量的基本关系

   信息与物质、能量并立为人类社会资源的三大支柱之一。

   广义的信息：

   从物质论意义上说，信息是事物运动的状态和方式；

   从认识论意义上说，信息是事物运动的状态和方式的某种表述或反映。

   从本体论层次上说，信息是事物运动的状态和运动的方式，与是否被其他事物所反映无关。

   事实上，没有物质、没有能量，就没有事物的运动，就没有事物运动的状态和运动的方式，也就没有信息，而且信息的显示、摄取、变换、传递、存储、识别、加工等所有的过程都必须有物质和能量的支持。

二、非编码DNA，noncoding DNA

   基因编码区不能转录信使RNA（mRNA），进而不能合成相应的蛋白质的DNA序列。

   人体基因组中存在约 97%的非编码DNA序列，这些非编码序列可作为转录因子结合位点、DNA修饰靶点，也可转录成非编码RNA。

   非编码DNA其实在生物的起源、进化、发育有着重要的作用。

三、请教：基因组里“非编码DNA序列”的信息含义

   人体基因组中存在约 97%的非编码DNA序列（又称“垃圾DNA”），只有大约 3%的基因负责编码蛋白。

   一种可能的解释：

   人体基因组是一种类似“数字计算机程序”的事物：

   （1）约 3%的基因负责编码蛋白，是该程序的“数据”；

   （2）约占 97%的非编码DNA序列，是该程序对“数据”进行加工、处理的详细说明。

参考资料：

[1] 2023-01-19，信息/information/钟义信，中国大百科全书，第三版网络版[DB/OL]

https://www.zgbk.com/ecph/words?SiteID=1&ID=285111&Type=bkzyb&SubID=137837

   狭义上说，信息是用来消除随机不定性的东西。广义上说，本体论意义上信息泛指一切事物运动的状态和方式，包括事物内部结构及外部联系的状态和方式；认识论意义上信息是关于事物运动的状态和方式的表达或反映，是系统有序程度的标记。

[2] 2022-12-23，信息/information/钟义信，赵一鸣，中国大百科全书，第三版网络版[DB/OL]

https://www.zgbk.com/ecph/words?SiteID=1&ID=326443&Type=bkzyb&SubID=104341  

   与物质、能量并立为人类社会资源的三大支柱之一。

[3] 2023-08-03，非编码DNA /noncoding DNA/章张，中国大百科全书，第三版网络版[DB/OL]

https://www.zgbk.com/ecph/words?SiteID=1&ID=130080&Type=bkzyb&SubID=109732

[4] 科普中国，2024-05-22，为什么说“垃圾DNA”不垃圾？

https://www.kepuchina.cn/article/articleinfo?business_type=100&classify=0&ar_id=497275

[5] 科普中国，2023-07-01，基因测序20年后，终于搞清了垃圾DNA是干啥的

https://www.kepuchina.cn/article/articleinfo?business_type=100&classify=0&ar_id=423102

[6] 科普中国，2021-12-31，长期被误解 非编码RNA存在“认知黑洞”

https://www.kepuchina.cn/article/articleinfo?business_type=100&classify=0&ar_id=263598

[7] 科普中国，2021-11-29，你身体里藏有多少“垃圾DNA”？它们的任务很神秘

https://www.kepuchina.cn/article/articleinfo?business_type=100&classify=0&ar_id=85379

[8] 科普中国，2021-12-31，DNA计算

https://www.kepuchina.cn/article/articleinfo?business_type=100&classify=0&ar_id=367034

相关链接：

[1] 2025-06-10 22:46，[打听，笔记，优先权] 什么是“生物正交化学 bioorthogonal chemistry”？ （关联：“自然运算”）

https://blog.sciencenet.cn/blog-107667-1489303.html

[2] 2025-05-27 22:10，[打听，笔记] 什么是“Click Chemistry 点击化学，咔哒化学”？ （关联：“自然运算”）

https://blog.sciencenet.cn/blog-107667-1487470.html

[3] 2024-09-01 22:20，[小资料，笔记，科普] 诺贝尔化学奖两次得主：卡尔·巴里·夏普利斯（Karl Barry Sharpless），天津大学名誉教授

https://blog.sciencenet.cn/blog-107667-1449160.html

[4] 2023-12-26 22:56，[优先权？] “自然运算”原理示意图（草图，2023-12-20 绘制）

https://blog.sciencenet.cn/blog-107667-1415467.html

[5] 2024-01-05 22:52，[笔记，请教，原创] “自然运算”信息设备的一般理论模式

https://blog.sciencenet.cn/blog-107667-1416810.html

[6] 2023-12-27 22:43，[笔记，请教，原创] “自然运算”有什么创新？

https://blog.sciencenet.cn/blog-107667-1415592.html

[7] 2024-06-26 22:49，[自然运算] 感谢《科学智慧火花》给贴出：用光做“算术加法”和“逻辑与”运算、用“压电效应”做数学运算 2 文

https://blog.sciencenet.cn/blog-107667-1439870.html

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