今天博客首开，博士亦即将毕业了，在这里秀一秀自己辛苦开发的一个药物设计系统，虽然很简陋，但是毕竟是自己娃，希望有志者一起来讨论完善。

分子矩阵分析系统

(The Analysis System of Molecular Matrix, ASMM)

[1]系统说明:

    本软件是在博士攻读期间独立完成开发，系统分为三个部分：①：分子输入系统，②：描述子计算系统，③：数据分析系统。为了确保系统的正确性，在相同参数设置情况下，所有算法结果均经SPSS15.0和其它算法的外部软件，如独立的LIBSVM包，直接检验校正。

[2]开发工具:

       本软件以VC++2005和MatLab7.0为开发工具。

[3] 环境要求:

       1 .WINDOWS 2000/XP

       2. PC (586以上)机，将屏幕大小设为1280×800

[4] 功能介绍

① 分子输入系统

   分子输入系统通过批量读入SYBYL2格式分子文件，采用回溯算法，依据外部定义的标准子结构片段对读入的分子结构进行检查校正，确保输入分子结构的正确性。

② 描述子计算系统

    该系统主要是实现分子分子结构的数据化，它在读入分子结构文件的基础上，集成了分子结构描述子的自动计算，其中描述子主要包括3D-HoVAIF，Vmed、EState和Pmaif的计算，在这些描述子的计算中，均能够随意的改变原子分类方案和拓扑路径的计算方法，同时该部分亦提供了多肽的数据化计算系统。

③ 数据分析系统

       该系统主要是实现对分子数据的自动化处理，提取合理结构参数进行设计分子预测分析，在该系统中主要包含的算法有主成份分析(PCA)、前向逐步线性回归(FSMLR)、前向逐步线性判别分析(FSLDA)、偏最小二乘回归与判别分析(PLSr and PLS_DA)、支持矢量机回归/分类(集成LIBSVM)和反向传播神经网络回归/分类(BPANN)。 

[5] 程序设置界面系统

     界面很乱，以后再逐步细化。

① 描述子计算结果示例

 

② PLS回归结果

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