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置顶 · 个人新博客
2020-2-24 22:24
我的新博客主要用于 分享药物设计软件的使用技巧 和 一些 编程知识。 欢迎大家 访问我的 新博客 , 和我互动交流。 http://blog.chenzhaoqiang.com/
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pymol增加object的states
2019-3-22 11:51
pymol增加object的states 方法一 ---------------------------------------------------------------------------------- 一共有24个蛋白构象,每个构象至少对应一个口袋,口袋有自己的名字, state1 rec_conf1 pkt5 其他state2 rec_conf2 pkt3 其他所有state没有出现过pkt5,导致pkt5成为1/1state,长期 ...
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统一open和close两个构象的PDB结构信息
2019-1-16 11:54
统一open和close两个构象的PDB结构信息 主要通过 SI.zip 解决这个问题。 场景: gromacs 计算RMSD 需要原子序号一致。 #### 摘要 同一个蛋白,解析了OPEN和CLOSE 2个构象,OPEN 构象中可能会有一段 loop 缺少。 #### 方法 step1. 补残基 补全loop,使得残基数目相同。 1t48 的范围 ...
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GMT+8, 2021-7-28 11:34

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