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2020-2-24 22:24
我的新博客主要用于 分享药物设计软件的使用技巧 和 一些 编程知识。 欢迎大家 访问我的 新博客 , 和我互动交流。 http://blog.chenzhaoqiang.com/
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pipeline的使用案例
2014-11-10 17:03
应用1: 用了两个模型进行筛选,取交集进行送样 取两个化合物库中的公共化合物 应用2 虚拟筛选后购买化合物前,选择的化合物确保结构多样性, 聚类分析,比如你打算购买100个化合物,你可以从500/1000个化合物中聚成100类, 然后你从1类中挑选1个化合物。 也可以聚成50类,每一类挑选2个化合物 3 计算化合 ...
个人分类: Pipeline|1970 次阅读|没有评论
pipeline无法正常启动的原因
2014-11-10 16:46
Pipeline Pilot failed to connect to the server please check the location is valid and the server is running 解决办法 开启服务scitegic_apache
个人分类: 系统|3807 次阅读|没有评论
pymol opengl cgo盒子的画法
热度 1 2014-11-10 10:56
首先需要理解这个关键词TRIANGLE_STRIP, http://blog.csdn.net/xiajun07061225/article/details/7455283 http://game.ceeger.com/Script/GL/GL.TRIANGLE_STRIP.html 通过4个点来定义三角形带,来创建4个点的平面。 4个点的顺序是BACD,这样就能定义出上面的3角型条带。 ###################### ...
3032 次阅读|2 个评论 热度 1
pymol opengl cgo---面的画法
2014-11-9 21:48
画面的必须元素 3个点确定一个面 无需光照,不需要定义向量 需要输入元素 3个点的坐标 关键词BEGIN END TRIANGLES 可选元素 颜色 透明度等 光照 ############################### obj = cmd.load_cgo(obj,'triangle')
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pymol的opengl CGO--线段的画法
2014-11-8 20:27
############### 需要的必须输入元素包括 1起点坐标 2终点坐标 可选元素 颜色 线段的宽度 关键词 BIGIN LINE END line.py ######################################## from pymol.cgo import * from pymol import cmd line = cmd.load_cgo(line,'linered', 1) ...
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Pymol函数cmd.load_cgo中的第3个参数的说明
2014-11-8 18:41
http://www.liv.ac.uk/~afcalder/apt3.html ############ cmd.load_cgo(obj,'segment', 1) Additional states can be appended quite simply like this. Note how thewireframe 'box' is recalled without having to restate the same vertexcoordinates and that the object name 'at ...
个人分类: DrugDesign|2224 次阅读|没有评论
pymol的opengl CGO球体的画法
2014-11-8 16:39
pymol怎么画球 需要的输入元素包括 必备元素 1球的中心点的坐标 2球的半斤 可选元素 1透明度ALPHA,0-1 2颜色rgb 脚本 sphere.py ################ from pymol.cgo import * from pymol import cmd spherelist = cmd.load_cgo(spherelist, 'A_easy') spherelist = cm ...
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pymol的opengl CGO圆柱体的画法
2014-11-7 22:17
# Cylinder specification: set this to 9.0 or if you did from pymol.cgo import * you can then use CYLINDER, here. #怎么设置透明度 #a1, a2 #a1=25.0或者用ALPHA # a1=25 means 'ALPHA' (if you do from pymol.cgo import * you can then use CGO ...
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软件正常安装运行的时候出现segmentation fault的解决方案
2014-11-6 19:09
背景 在有些机器上可以正常安装autodock,然后正常运行 有些机器可以正常安装,但是不能正常运行, 运行的时候报这个错segmentation fault 解决办法 在Linux下写程序的时候,如果程序比较大,经常会遇到“段错误”(segmentation fault)这样的问题,这主要就是由于Linux系统初始的堆栈大小(stack size)太小的缘故 ...
个人分类: DrugDesign|2732 次阅读|没有评论

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GMT+8, 2021-9-21 17:45

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