博文
- 量子芝诺效应的一个理解
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- 芝诺悖论是古希腊数学家芝诺提出的关于运动不可分性的一系列的哲学悖论。包括两分法悖论，飞矢不动和阿基里斯追乌龟等几个例子。其中两分法悖论大意是这样，一个人从 A 地点走到 B 地点，必须先到到其中点 C ，然后从 C 出发要达到 CB 中点 D ，如此类推，他每次走的距离就会越来越小，直到趋近于零，这就形 ...
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什么样的结果是显著的：浅谈p值
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- p 值是现在常用的统计学指标。当我们检验一个统计假设 H 0 时， p 值是当 H0 为真时样本结果或者更极端结果出现的概率。 p 值越小，也就越应该拒绝原假设，也就是结果越显著。在现在的生物医学研究中，一般的显著性标准是 p 值 0.05 。但这个标准最近几年引发了非常多的争议，比如虽然很多癌症研究都声 ...
- 如何配置深度学习环境：Ubuntu+TensorFlow+keras
- 深度学习是最近很火爆的一个技术，虽然很多概念在上个世纪就已提出，但大规模的应用和发展还是近几年的事情。这里分享一下相关配置（针对TensorFlow+keras）。 硬件需求 ： 最好有一块比较新的支持cuda的NVIDIA显卡，拿cpu也可以体验深度学习，用来做研究可能就捉急了。最好有一台可以安装显卡的台式 ...
- 生物中的逆向工程技术（二）：参数模型
- 系列其他文章： 生物中的逆向工程技术（一）: 线性方程 生物中的逆向工程技术 （二）：参数模型 生物中的逆向工程技术 （三）：布尔网络模型 生物中的逆向工程技术 （四）：贝叶斯网络 生物中的逆向工程技术 （五）：利用相关系数得到直接相互作用 生物中的逆向工程技术 （六）：CellNet与细胞工程 ...
- 生物中的逆向工程技术（四）：贝叶斯网络
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- 基本的数学问题都可以在这篇文章里得到回答Pe'er, D. (2005). Bayesian Network Analysis of Signaling Networks: A Primer. Sci. STKE 2005(281): pl4-. 而比较原始的是这篇文献Friedman, N. (2000). Using Bayesian Networks to Analyze Expression Data. 关于贝叶斯网络比较重要的一个公式 ...
- 生物中的逆向工程技术（一）：线性方程
- 这个系列不知道为什么消失了，老文重发。 系列其他文章： 生物中的逆向工程技术（一）: 线性方程 生物中的逆向工程技术 （二）：参数模型 生物中的逆向工程技术 （三）：布尔网络模型 生物中的逆向工程技术 （四）：贝叶斯网络 生物中的逆向工程技术 （五）：利用相关系数得到直接相互作用 ...
- 消逝的美国梦
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- “中国梦”是最近几年比较流行的一个概念，虽然诸多理论家也没有给它下过一个完整的定义，但影影绰绰的，似乎总是脱胎于美国梦 (American dream) 。美国梦的一个定义是孩子总是期望获得高于其父母的生活水平。相应的，人们也把把赚的比父母多的孩子的比例定义为“绝对收入流动性”，用以衡量美国的经济活力。尽管大家很 ...
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