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TS10K安装Python3, pip3, numpy
胡涛 2020-7-10 16:41
下载Python3.8.3安装包: https://www.python.org/downloads/release/python-383/, 下载sourcerelease版本tar,上传到集群/opt下,使用tar解压: tar zvcf ... 。 到/opt/software路径下mkdir python3,/opt/software是集群的共享路径,应用程序安装到这个路径下。 进入Python-3.8.3路径下, ./configure  ...
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TS10K-calypso调用vasp计算pbs脚本
胡涛 2020-7-10 09:19
#!/bin/bash #PBS-lnodes=1:ppn=5 #PBS-joe #PBS-V #PBS-lwalltime=01:00:00 #PBS-qbatch #PBS-S/bin/bash ###Setintelenvironment### source/opt/intel/compilers_and_libraries_2018/linux/bin/compilervars.sh&nbs ...
个人分类: 计算机|3182 次阅读|没有评论
VASP做第一性原理分子动力学
胡涛 2020-6-12 14:23
考虑一个结构稳不稳定,或者通过第一性原理分子动力学获得合理初始构型,需要使用VASP进行第一性原理分子动力学计算。 首先,结构的晶胞应该足够大,包含几十个原子,这样温度才会波动比较小。 其次,KPOINTS采用比较少的撒点,因为晶胞比较大。采用1 1 1的采样就可以。 KPO ...
个人分类: VASP计算|19022 次阅读|没有评论
把草稿中的参考文献批量导出pdf
胡涛 2020-5-28 21:30
跟其他老师合作写文章,自己写的这一部分的草稿发送给对方的同时,最好把参考文献的pdf也一起发送过去,便于对方统稿。这时就需要把草稿中的参考文献pdf批量导出到一个文件夹。 方法: 在endnote的菜单栏All refrences下面能看到word文档,看不到的话就去草稿里update citati ...
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