2014工作总结

热度 2 郑爱萍 2015-1-4 11:28

2014 年工作总结： 1、 发表论文情况（ 4 篇 SCI 收录，其中 J Proteome Res. 为封面文章 IF5.056 ） Lei D, Lin R, Yin C, Li P, Zheng A . Global proteinprotein interaction network of rice sheath blight pathogen. J Proteome Res. 2014 Jul 3;13(7):3277 ...

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杀虫HD521菌株完成图的构建与分析

郑爱萍 2014-11-7 14:18

近日，本课题已完成对杀虫HD521菌株基因组及 pBTHD521-1等 6个质粒 的完成图构建与分析，其中基因组大小为5.43M 。HD521 含有对鞘翅目有特异作用的新基因类型以及抗菌素编码基因簇。HD521完成图的构建为阐释鞘翅目杀虫基因的晶体形成与调控，次生代谢产物产生的通路及芽孢杆菌群基因组比较进化等方面提供重要的分析 ...

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“973”计划“十三五”农业领域“西部微生物资源利用”研讨会

郑爱萍 2014-10-21 11:47

10.18-20 日，参加了由西北农林科技大学主持的“ 973 ” 计划“十三五”农业领域 “西部微生物资源利用方向”研讨会议，会议在陕西杨陵召开。项目拟定结合西部微生物独特的基因资源开展西部微生物基因资源多样性，微生物功能基因与植物健康等 6 大课题的 973项目 。本项目由西北农林科技大学韦革宏杰青教授为 ...

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如何计算FPKM值

热度 1 郑爱萍 2014-10-14 12:09

FPKM, Fragments Kilobase of exon model per millon mapped reads, which can be used to indicate the expression (abundance) characteristics of genes. Now I will describe operation about obtaining interested gene FPKM value. 1.Software Download 1).fastq-dump: convert sra file to fastq file. ...

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和先正达公司正式签订合作协议

热度 2 郑爱萍 2014-7-31 12:01

近日，本实验室就两类杀虫新模式基因和先正达公司签订正式合作协议，为新基因的应用提供良好的技术平台，同时也开启了四川农业大学和先正达公司就农作物杀虫基因领域的应用合作先例。

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水稻纹枯病菌PPI论文刊登JPR杂志封面

郑爱萍 2014-7-4 11:03

http://pubs.acs.org/toc/jprobs/current

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水稻纹枯病菌蛋白质互作网络构建与预测

郑爱萍 2014-6-10 13:59

近期完成对水稻纹枯病菌蛋白质互作网络构建与预测及相关工作： 1 、使用同源映射法和结构域相互作用的方法预测水稻纹枯病菌的蛋白质互作网络图。运用果蝇、线虫、人类、酵母蛋白实验互作网络数据，通过整合两种预测方法的重叠数据(同源映射中 Inparanoid 算法的可信度分值大于 0.5) 构建含 1，773 个蛋白的 6 ...

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2014年毕业生完成答辩

热度 1 郑爱萍 2014-6-4 21:58

6月3-4日，丁磊、伏荣桃、代小娟同学分别参加并通过毕业答辩。 丁磊博士毕业论文题目：水稻纹枯病蛋白质互作网络模型构建与致病转录因子STE12功能研究 伏荣桃博士毕业论文题目：水稻稻曲菌的分离鉴定与分子研究及立枯丝核菌侵染和核型细胞学分析 代小娟硕士毕业论文题目：稻粒黑粉菌的分离鉴定和分子分析 丁磊在读期间 ...

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