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韩春雨到底有没有造假之学术性探讨

已有 23775 次阅读 2016-7-16 16:04 |系统分类:海外观察| 韩春雨, NgAgo

前言:写这篇博文的目的,不是要给韩春雨是否造假下一个定论。不是我不想,而是‘臣妾做不到啊’!因为,最终定论需要有专门的调查委员会,需要看韩实验室的原始数据,或者韩在公开的情况下,重复出自己的实验。但鉴于这么多人对这个话题感兴趣,包括很多不是做基因编辑的,甚至不是做生物的,我决定有必要写一个大家都可以看得懂的,有专业性分析的文章。并且我准备持续追踪这个事件,解读最新进展,直到有人重复出来或者被证实无法重复。


好吧,开始吧!


春雨注定是2016年中国生物圈的焦点人物。先是横空出世,以一篇NatureBiotechnology令世人刮目相看。然而,一两个月后,陆续传出其论文最关键的部分没法重复(Fig.4)。这个过程还跌但起伏,山重水复,其情节堪比美剧。先是有人宣布重复不了,大家一片附和;然后,跳出一个印度学者宣布,他重复出来!于是大家分分来取经,但也有细心人指出,他的结果可能是假阳性,需要测序结果才能确定。现在,最新的情况是这位印度学者宣布,测序结果是阴性。到这个时候,大多数人纷纷对韩春雨失去了信心。可是,就在我写博的前几个小时,一个来自澳洲的叫Gaetan Burgio的学者在推特上宣布他重复出来了!于是乎,又在网上引起了大讨论。总之,这事没完。

眼下丹麦正值夏假时间,人去楼空,本来节奏够慢的丹麦现在变得更慢。加上本人从事基因编辑多年,又正好本人有时间,便决定花点来写这篇博文。闲话一句,丹麦的夏假有点像国内的暑假,一是都是在夏天(虽然丹麦的夏天一点都不热),二是因为学校都放假,因此,丹麦人一般选择这个时间休假,以便在家看孩子:)

好吧,闲话少说,言归正传!


先来看一个调查,即论文最关键的部分-有没有看到基因组敲除,即indels. 虽然24个参与调查的人里边,绝大多数回答no或者呆确定,但是有意思的是有一个人回答yes.其实,只要有一个人重复出来,韩就笑到了最后。但是,因为没有实验数据,我们无从判断这个yes是不是可靠。

再来看另外一个调查,即最后你怎么看NgAgo。30%的人回答,我绝望了,再也不尝试了。但也有,13%的人表示,不会放弃,认为NgAgo代表未来。


就我个人分析,韩文最让我困惑的是Fig.4a和Fig.4b的分歧。Fig.4a各靶点之间最大相隔30个核苷酸,T7EI切割,跑胶之后,各产物条带大小一致。而在Fig.4e,Cas9靶点和NgAgo靶点部分重合,相距小于30个核苷酸,但却看到了两者产物条带的明显偏移。另一个奇怪的地方是,NgAgo两个产物条带分别小于对应的Cas9产物。


未完,待续。。。





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